UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1F10D7.1F10D7.10chrX 17,362,183contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)
2R12C12.3R12C12.3n/achrII 6,030,297contains similarity to Pfam domain PF00001 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR002184 (Serpentine beta receptor), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
3col-164T21D9.1n/achrX 2,094,123C. elegans COL-164 protein; contains similarity to Pfam domains PF01484 (Nematode cuticle collagen N-terminal domain) , PF01391 (Collagen triple helix repeat (20 copies)) (3)contains similarity to Interpro domains IPR002486 (Nematode cuticle collagen, N-terminal), IPR008160 (Collagen triple helix repeat), IPR013286 (Annexin, type VII)
4skr-9C52D10.7n/achrIV 17,163,837skr-9 encodes a homolog of Skp1 in S. cerevisiae, a component of the SCF (Skp1, Cullin, F-box) ubiquitin-ligase complex that regulates ubiquitin-mediated protein degradation; SKR-9 is required for posterior body morphogenesis, embryonic and larval development, and postembryonic cell proliferation.
5ZK1307.4ZK1307.4n/achrII 9,651,306contains similarity to Pfam domain PF00635 MSP (Major sperm protein) domain contains similarity to Interpro domains IPR008962 (PapD-like), IPR000535 (Major sperm protein)
6bbs-2F20D12.3n/achrIV 7,935,876bbs-2 is orthologous to human BBS2 (OMIM:606151, mutated in Bardet-Biedl syndrome 2); while the function of BBS-2 is unknown, it shares conserved domains with its human paralogs BBS1 and BBS7, which also are mutated in other Bardet-Biedl syndromes.
7C46A5.1C46A5.1n/achrIV 7,765,495contains similarity to Pfam domain PF00102 Protein-tyrosine phosphatase contains similarity to Interpro domains IPR003595 (Protein-tyrosine phosphatase, catalytic), IPR000242 (Protein-tyrosine phosphatase, receptor/non-receptor type), IPR000387 (Protein-tyrosine phosphatase)
8AC8.3AC8.3n/achrX 228,920
9ZC376.1ZC376.1n/achrV 14,179,216contains similarity to Pfam domain PF00135 Carboxylesterase contains similarity to Interpro domain IPR002018 (Carboxylesterase, type B)
10F53B6.6F53B6.6n/achrI 8,956,012contains similarity to Pfam domain PF00100 Zona pellucida-like domain contains similarity to Interpro domain IPR001507 (Endoglin/CD105 antigen)
11B0024.3B0024.3n/achrV 10,288,395contains similarity to Pfam domain PF01705 CX module contains similarity to Interpro domain IPR002619 (Protein of unknown function CX)
12F35F10.11F35F10.11n/achrV 3,311,123contains similarity to Pfam domains PF00339 (Arrestin (or S-antigen), N-terminal domain) , PF02752 (Arrestin (or S-antigen), C-terminal domain) contains similarity to Interpro domains IPR014756 (Immunoglobulin E-set), IPR011022 (Arrestin-like, C-terminal), IPR000694 (Proline-rich region), IPR011021 (Arrestin-like, N-terminal)
13T09B9.2T09B9.2n/achrX 9,763,139contains similarity to Pfam domains PF07690 (Major Facilitator Superfamily) , PF00083 (Sugar (and other) transporter) contains similarity to Interpro domains IPR007114 (Major facilitator superfamily), IPR011701 (Major facilitator superfamily MFS-1), IPR005828 (General substrate transporter), IPR016196 (MFS general substrate transporter), IPR004745 (Na(+)-dependent inorganic phosphate cotransporter)
14T14B1.2T14B1.2n/achrX 9,651,998contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
15T26F2.2T26F2.2n/achrV 13,982,237contains similarity to Homo sapiens Isoform 1 of Protein Dom3Z; ENSEMBL:ENSP00000337759
16D2023.3D2023.3n/achrV 11,804,015contains similarity to Pfam domain PF00168 C2 domain contains similarity to Interpro domains IPR008973 (C2 calcium/lipid-binding region, CaLB), IPR000008 (C2 calcium-dependent membrane targeting)
17srbc-19C45H4.16n/achrV 2,165,802C. elegans SRBC-19 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domains IPR002651 (Protein of unknown function DUF32), IPR002208 (SecY protein)
18F15A8.6F15A8.6n/achrX 4,432,690contains similarity to Pfam domain PF00135 Carboxylesterase contains similarity to Interpro domain IPR002018 (Carboxylesterase, type B)
19T05B4.4T05B4.4n/achrV 4,128,560
20C47E8.3C47E8.3n/achrV 14,681,957contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)
21fbxa-115Y113G7B.3n/achrV 20,186,739This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; this gene's encoded protein also contains an FTH/DUF38 motif, which may also mediate protein-protein interaction.
22srz-14K05D4.3n/achrV 16,184,163C. elegans SRZ-14 protein ;
23F32H5.4F32H5.4n/achrV 13,362,228contains similarity to Pfam domains PF07690 (Major Facilitator Superfamily) , PF00083 (Sugar (and other) transporter) contains similarity to Interpro domains IPR007114 (Major facilitator superfamily), IPR011701 (Major facilitator superfamily MFS-1), IPR005828 (General substrate transporter), IPR016196 (MFS general substrate transporter)
24tag-77C28C12.10n/achrIV 8,506,971C. elegans TAG-77 protein; contains similarity to Pfam domains PF00169 (PH domain) , PF01363 (FYVE zinc finger) contains similarity to Interpro domains IPR000219 (Dbl homology (DH) domain), IPR001849 (Pleckstrin-like), IPR000306 (Zinc finger, FYVE-type), IPR000694 (Proline-rich region), IPR013083 (Zinc finger, RING/FYVE/PHD-type), IPR011993 (Pleckstrin homology-type), IPR017455 (Zinc finger, FYVE-related), IPR011011 (Zinc finger, FYVE/PHD-type)
25F14F8.8F14F8.8n/achrV 16,671,873contains similarity to Saccharomyces cerevisiae Daughter cell-specific secreted protein with similarity to glucanases, degrades cell wall from the daughter side causing daughter to separate from mother; expression is repressed by cAMP; SGD:YHR143W
26ZC518.4ZC518.4n/achrIV 12,367,373contains similarity to Neurospora crassa Hypothetical protein B8B8.120.; TR:Q872S5
27F15A8.4F15A8.4n/achrX 4,408,576
28T11A5.6T11A5.6n/achrV 9,884,090contains similarity to Pfam domain PF00648 Calpain family cysteine protease contains similarity to Interpro domains IPR001300 (Peptidase C2, calpain), IPR001876 (Zinc finger, RanBP2-type)
29C32E8.3C32E8.3n/achrI 3,787,036contains similarity to Pfam domain PF05517 p25-alpha contains similarity to Interpro domain IPR008907 (P25-alpha)
30srh-169C49G7.2n/achrV 4,048,582C. elegans SRH-169 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
31F45E1.5F45E1.5n/achrX 7,978,560contains similarity to Interpro domain IPR000834 (Peptidase M14, carboxypeptidase A)
32inft-1F58B6.2n/achrIII 1,107,561C. elegans INFT-1 protein; contains similarity to Pfam domain PF02181 Formin Homology 2 Domain contains similarity to Interpro domains IPR015425 (Actin-binding FH2), IPR000694 (Proline-rich region), IPR003104 (Actin-binding FH2 and DRF autoregulatory)
33F16B12.7F16B12.7n/achrX 14,109,051contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
34clec-259M162.1n/achrV 19,786,034C. elegans CLEC-259 protein; contains similarity to Pfam domain PF00337 Galactoside-binding lectin contains similarity to Interpro domains IPR001079 (Galectin, galactose-binding lectin), IPR013320 (Concanavalin A-like lectin/glucanase, subgroup), IPR007233 (Sybindin-like protein), IPR008985 (Concanavalin A-like lectin/glucanase)
35T21B10.6T21B10.6n/achrII 8,945,096contains similarity to Pfam domain PF00100 Zona pellucida-like domain contains similarity to Interpro domain IPR001507 (Endoglin/CD105 antigen)
36srg-28T09D3.2n/achrV 5,335,592C. elegans SRG-28 protein; contains similarity to Pfam domain PF02118 C.elegans Srg family integral membrane protein contains similarity to Interpro domain IPR000609 (Serpentine gamma receptor, Caenorhabditis species)
37gcy-5ZK970.6n/achrII 10,313,230gcy-5 encodes a predicted guanylate cyclase with strong similarity to rat atrial natriuretic peptide receptor A; expressed in ASER.
38cmk-1K07A9.2n/achrIV 1,829,288cmk-1 encodes a Ca+2/calmodulin-dependent protein kinase I (CaMK1); CMK-1 activity is required, cell autonomously and downstream of the cyclic nucleotide-gated channel TAX-4, for several aspects of AFD thermosensory neuron differentiation, including expression of the gcy-8 guanylyl cyclase and nhr-38 nuclear hormone receptor genes and morphology of the AFD sensory endings; cmk-1 activity is thus also required for normal thermosensory behavior; a cmk-1::gfp reporter is expressed in head sensory and interneurons as well as in the ventral nerve cord; expression is seen specifically in the neurons of the thermosensory circuit, AFD, AIY, and AIZ; CMK-1 localizes exclusively to the cytoplasm.
39C34F6.7C34F6.7n/achrX 11,212,716contains similarity to Drosophila melanogaster Flybase gene name is CG14646-PA;; FLYBASE:CG14646
40srb-6R05H5.6n/achrII 10,195,792C. elegans SRB-6 protein; contains similarity to Pfam domains PF02117 (C.elegans Sra family integral membrane protein) , PF02175 (C.elegans integral membrane protein Srb) contains similarity to Interpro domains IPR002184 (Serpentine beta receptor), IPR000344 (Nematode chemoreceptor, Sra)
41F27D9.4F27D9.4n/achrX 7,653,722
42R06A10.1R06A10.1n/achrI 1,087,211contains similarity to Interpro domain IPR016196 (MFS general substrate transporter)
43cdd-1C47D2.2n/achrX 8,209,904cdd-1 encodes a cytidine deaminase that contains a zinc-binding region; expressed in the intestine.
44col-61C01H6.1n/achrI 7,202,873C. elegans COL-61 protein; contains similarity to Pfam domains PF01484 (Nematode cuticle collagen N-terminal domain) , PF01391 (Collagen triple helix repeat (20 copies)) (3)contains similarity to Interpro domains IPR002486 (Nematode cuticle collagen, N-terminal), IPR000694 (Proline-rich region), IPR008161 (Collagen helix repeat), IPR008160 (Collagen triple helix repeat)
45C01A2.4C01A2.4n/achrI 13,393,035contains similarity to Pfam domain PF03357 Snf7 contains similarity to Interpro domain IPR005024 (Snf7)
46ZK945.8ZK945.8n/achrII 10,108,812contains similarity to Pfam domain PF07491 Protein phosphatase inhibitor contains similarity to Interpro domain IPR011107 (Protein phosphatase inhibitor)
47sru-21C08F11.4n/achrIV 13,629,701C. elegans SRU-21 protein; contains similarity to Pfam domain PF02688 Domain of unknown function DUF215 contains similarity to Interpro domain IPR003839 (Protein of unknown function DUF215)
48C33C12.8C33C12.8n/achrII 2,184,467contains similarity to Pfam domain PF02055 O-Glycosyl hydrolase family 30 contains similarity to Interpro domains IPR017853 (Glycoside hydrolase, catalytic core), IPR001139 (Glycoside hydrolase, family 30), IPR013781 (Glycoside hydrolase, subgroup, catalytic core)
49srd-27T26E4.12n/achrV 15,803,891C. elegans SRD-27 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
50C33B4.2C33B4.2n/achrII 11,371,111contains similarity to Aristolochia gigantea RPB140 (EC 2.7.7.6) (DNA-directed RNA polymerase beta chain)s(Fragment).; TR:O48912