UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1fat-7F10D2.90chrV 7,152,237fat-7 encodes an essential delta-9 fatty acid desaturase that is required for the synthesis of monounsaturated fatty acids; fat-7 can substitute for the functions of the other two fatty acid desaturases, fat-5 and fat-6; RNA interference has shown that fat-7 is required for viability and normal growth.
2ZC204.1ZC204.1n/achrII 1,666,906contains similarity to Pfam domain PF02520 Domain of unknown function DUF148 contains similarity to Interpro domain IPR003677 (Protein of unknown function DUF148)
3F55C12.2F55C12.2n/achrII 5,877,311
4F22H10.2F22H10.2n/achrX 16,679,072contains similarity to Interpro domain IPR002395 (HMW kininogen)
5F09C12.2F09C12.2n/achrII 5,111,113F09C12.2 encodes a kinase most closely related to mitogen-activated protein (MAP) kinases; as loss of F09C12.2 activity via mutation or large-scale RNAi results in no obvious defects, the precise role of F09C12.2 in C. elegans development and/or behavior is not yet known.
6C33F10.8C33F10.8n/achrII 4,824,276This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; its encoded protein also contains a Pfam-B45 motif of presently unknown function.
7abt-3F55G11.9n/achrIV 12,953,691abt-3 encodes a predicted ATP-binding cassette (ABC) transporter that is a member of the ABCA subfamily of transport proteins; ABT-3 is predicted to function as a transmembrane protein that couples energy to transport of various molecules across membranes, but as loss of abt-3 activity via RNAi results in no obvious defects, the precise role of abt-3 in C. elegans development and/or behavior is not yet known.
8T27A3.5T27A3.5n/achrI 6,101,032contains similarity to Pfam domain PF00102 Protein-tyrosine phosphatase contains similarity to Interpro domains IPR003595 (Protein-tyrosine phosphatase, catalytic), IPR016130 (Protein-tyrosine phosphatase, active site), IPR000242 (Protein-tyrosine phosphatase, receptor/non-receptor type), IPR000387 (Protein-tyrosine phosphatase)
9Y48E1C.3Y48E1C.3n/achrII 13,439,410contains similarity to Pfam domain PF00566 TBC domain contains similarity to Interpro domain IPR000195 (RabGAP/TBC)
10ZK1053.4ZK1053.4n/achrI 13,243,185contains similarity to Schizosaccharomyces pombe Nucleoporin nup124 (Nuclear pore protein nup124).; SW:N124_SCHPO
11T19D7.5T19D7.5n/achrX 665,501
12F28A10.2F28A10.2n/achrII 829,085contains similarity to Pfam domains PF05050 (Protein of unknown function (DUF672)) , PF02995 (Protein of unknown function (DUF229)) contains similarity to Interpro domains IPR007744 (Protein of unknown function DUF672), IPR004245 (Protein of unknown function DUF229)
13Y51A2D.18Y51A2D.18n/achrV 18,484,174contains similarity to Pfam domains PF07690 (Major Facilitator Superfamily) , PF00083 (Sugar (and other) transporter) contains similarity to Interpro domains IPR007114 (Major facilitator superfamily), IPR001991 (Sodium:dicarboxylate symporter), IPR011701 (Major facilitator superfamily MFS-1), IPR005829 (Sugar transporter, conserved site), IPR005828 (General substrate transporter), IPR003663 (Sugar transporter), IPR016196 (MFS general substrate transporter)
14F44D12.3F44D12.3n/achrIV 10,022,456contains similarity to Pfam domain PF00635 MSP (Major sperm protein) domain contains similarity to Interpro domains IPR008962 (PapD-like), IPR000535 (Major sperm protein)
15R155.3R155.3n/achrIII 1,973,361contains similarity to Pfam domain PF00102 Protein-tyrosine phosphatase contains similarity to Interpro domains IPR003595 (Protein-tyrosine phosphatase, catalytic), IPR016130 (Protein-tyrosine phosphatase, active site), IPR003016 (2-oxo acid dehydrogenase, lipoyl-binding site), IPR000242 (Protein-tyrosine phosphatase, receptor/non-receptor type), IPR000387 (Protein-tyrosine phosphatase)
16C35A11.2C35A11.2n/achrV 5,387,617
17F41D3.6F41D3.6n/achrI 12,265,384contains similarity to Pfam domain PF01531 Glycosyl transferase family 11 contains similarity to Interpro domain IPR002516 (Glycosyl transferase, family 11)
18srab-9C36C5.6n/achrV 3,140,609C. elegans SRAB-9 protein; contains similarity to Pfam domain PF02117 C.elegans Sra family integral membrane protein contains similarity to Interpro domain IPR000344 (Nematode chemoreceptor, Sra)
19Y39E4A.1Y39E4A.1n/achrIII 12,951,765contains similarity to Mus musculus Nuclear protein ZAP3.; SW:ZAP3_MOUSE
20C36E8.4C36E8.4n/achrIII 4,014,026contains similarity to Pfam domain PF00018 SH3 domain contains similarity to Interpro domains IPR001060 (Cdc15/Fes/CIP4), IPR001452 (Src homology-3)
21C38C3.7C38C3.7n/achrV 1,502,860contains similarity to Pfam domains PF01827 (FTH domain) (2), PF00646 (F-box domain) contains similarity to Interpro domains IPR002900 (Protein of unknown function DUF38, Caenorhabditis species), IPR001810 (Cyclin-like F-box)
22F47F6.4F47F6.4n/achrII 1,262,570
23T25B2.1T25B2.1n/achrX 6,175,044contains similarity to Pfam domains PF00620 (RhoGAP domain) , PF00130 (Phorbol esters/diacylglycerol binding domain (C1 domain)) contains similarity to Interpro domains IPR001060 (Cdc15/Fes/CIP4), IPR008936 (Rho GTPase activation protein), IPR000533 (Tropomyosin), IPR002219 (Protein kinase C, phorbol ester/diacylglycerol binding), IPR000695 (H+ transporting ATPase, proton pump), IPR000198 (RhoGAP)
24W03F8.2W03F8.2n/achrIV 5,191,305contains similarity to Pfam domains PF07714 (Protein tyrosine kinase) , PF00069 (Protein kinase domain) contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related), IPR000980 (SH2 motif)
25F47B7.4F47B7.4n/achrX 3,765,997contains similarity to Pfam domain PF02343 Domain of unknown function DUF130 contains similarity to Interpro domain IPR003326 (Protein of unknown function DUF130)
26R01H2.4R01H2.4n/achrIII 7,062,521contains similarity to Interpro domain IPR000215 (Protease inhibitor I4, serpin)
27C34D4.3C34D4.3n/achrIV 7,153,905contains similarity to Pfam domain PF00635 MSP (Major sperm protein) domain contains similarity to Interpro domains IPR008962 (PapD-like), IPR000535 (Major sperm protein)
28F45C12.9F45C12.9n/achrII 1,709,067contains similarity to Pfam domain PF02343 Domain of unknown function DUF130 contains similarity to Interpro domain IPR003326 (Protein of unknown function DUF130)
29B0207.1B0207.1n/achrI 5,966,138contains similarity to Pfam domain PF00102 Protein-tyrosine phosphatase contains similarity to Interpro domains IPR000387 (Protein-tyrosine phosphatase), IPR003595 (Protein-tyrosine phosphatase, catalytic), IPR000005 (Helix-turn-helix, AraC type), IPR016130 (Protein-tyrosine phosphatase, active site), IPR000694 (Proline-rich region), IPR000242 (Protein-tyrosine phosphatase, receptor/non-receptor type)
30gcy-18ZK896.8n/achrIV 12,863,005gcy-18 encodes a receptor-type guanylyl cyclase that, along with gcy-8 and gcy-23, constitutes a subfamily of guanylyl cyclase genes in C. elegans; gcy-18 functions redundantly with gcy-8 and gcy-23, and upstream of tax-4, to regulate thermotaxis via the AFD thermosensory neurons, although of the three guanylyl cyclases required, genetic analyses suggest that GCY-18 is the primary guanylyl cyclase required; in addition, microarray experiments indicate that gcy-18 expression is induced in daf-16(RNAi); daf-2(RNAi) double mutants and repressed in daf-2(RNAi) mutants, suggesting that GCY-18 activity may contribute to a shortened lifespan; consistent with this, loss of gcy-18 activity via RNAi does result in lifespan extension; GCY-18 is expressed exclusively in the AFD thermosensory neurons, where it localizes to sensory endings.
31scrm-8K08D10.7n/achrIV 4,165,432scrm-8 encodes a putative phospholipid scramblase required for normally short lifespan; SCRM-8 is homologous to human PLSCR1-5, and paralogous to other C. elegans SCRMs (e.g., SCRM-1).
32ugt-2AC3.8n/achrV 10,399,988C. elegans UGT-2 protein; contains similarity to Pfam domain PF00201 UDP-glucoronosyl and UDP-glucosyl transferase contains similarity to Interpro domain IPR002213 (UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase)
33F46B6.10F46B6.10n/achrV 9,801,717contains similarity to Homo sapiens Hypothetical protein; TR:Q96QJ8
34W02B8.3W02B8.3n/achrII 13,917,920contains similarity to Pfam domain PF04870 Protein of unknown function, DUF644 contains similarity to Interpro domain IPR006954 (Protein of unknown function DUF644)
35rnh-1.1ZK1290.6n/achrII 7,526,915C. elegans RNH-1.1 protein; contains similarity to Pfam domain PF00075 RNase H contains similarity to Interpro domains IPR002952 (Eggshell protein), IPR012337 (Polynucleotidyl transferase, Ribonuclease H fold), IPR002156 (Ribonuclease H)
36F48B9.3F48B9.3n/achrX 2,165,518contains similarity to Pfam domain PF03761 Domain of unknown function (DUF316) contains similarity to Interpro domain IPR005514 (Protein of unknown function DUF316)
37flp-23F22B7.2n/achrIII 8,651,368C. elegans FLP-23 protein ;
38K02D7.1K02D7.1n/achrIV 293,550K02D7.1 is orthologous to the human gene PURINE NUCLEOSIDE PHOSPHORYLASE (NP; OMIM:164050), which when mutated leads to disease.
39Y17G7B.19Y17G7B.19n/achrII 12,110,327contains similarity to Pfam domain PF01666 (DX module)
40F47B7.7F47B7.7n/achrX 3,779,589contains similarity to Ostertagia ostertagi Putative ES protein (Fragment).; TR:Q8WQ03
41K11H12.4K11H12.4n/achrIV 674,988contains similarity to Pfam domain PF03409 Protein of unknown function (DUF274) contains similarity to Interpro domain IPR005071 (Protein of unknown function DUF274)
42sur-6F26E4.1n/achrI 9,756,000C. elegans SUR-6 protein; contains similarity to Pfam domain PF00400 WD domain, G-beta repeat contains similarity to Interpro domains IPR000009 (Protein phosphatase 2A, regulatory subunit PR55), IPR011046 (WD40 repeat-like), IPR001680 (WD40 repeat), IPR015943 (WD40/YVTN repeat-like)
43C09D4.3C09D4.3n/achrI 5,489,487contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
44Y51A2D.1Y51A2D.1n/achrV 18,510,717contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
45F26F2.4F26F2.4n/achrV 20,565,244contains similarity to Homo sapiens Laminin alpha-4 chain precursor; ENSEMBL:ENSP00000230538
46rmd-5T23B3.3n/achrI 6,711,598C. elegans RMD-5 protein ; contains similarity to Xenopus laevis Protein FAM82C.; SW:Q5EAU9
47F25B3.2F25B3.2n/achrV 9,578,510contains similarity to Lactococcus lactis Oligopeptide transport system permease protein oppC.; SW:OPPC_LACLA
48gnrr-5H22D07.1n/achrV 4,452,877C. elegans GNRR-5 protein; contains similarity to Pfam domain PF00001 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
49C42C1.3C42C1.3n/achrIV 12,269,969contains similarity to Trypanosoma cruzi Hypothetical protein.; TR:Q4CVC5
50Y113G7A.13Y113G7A.13n/achrV 20,143,831contains similarity to Pfam domain PF01431 Peptidase family M13 contains similarity to Interpro domains IPR006025 (Peptidase M, neutral zinc metallopeptidases, zinc-binding site), IPR000718 (Peptidase M13, neprilysin)