UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1F07G11.3F07G11.30chrV 7,300,103contains similarity to Pfam domain PF01697 Domain of unknown function contains similarity to Interpro domains IPR008167 (Protein of unknown function DUF23, C-terminal), IPR008166 (Protein of unknown function DUF23)
2srg-15C34C6.1n/achrII 8,709,673C. elegans SRG-15 protein; contains similarity to Pfam domain PF02118 C.elegans Srg family integral membrane protein contains similarity to Interpro domain IPR000609 (Serpentine gamma receptor, Caenorhabditis species)
3ZC196.8ZC196.8n/achrV 8,721,706contains similarity to Pfam domain PF04789 Protein of unknown function (DUF621) contains similarity to Interpro domain IPR006874 (Protein of unknown function DUF621)
4C45H4.13C45H4.13n/achrV 2,149,713contains similarity to Staphylococcus aureus Staphylococcal secretory antigen ssaA2 precursor.; SW:Q6GED5
5str-139ZC513.9n/achrV 8,061,503C. elegans STR-139 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1), IPR002091 (Aromatic amino acid permease)
6F26D11.6F26D11.6n/achrV 7,955,880
7srw-19T10H4.8n/achrV 15,280,555C. elegans SRW-19 protein; contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)
8F53H2.1F53H2.1n/achrV 20,385,929contains similarity to Pfam domain PF05218 Protein of unknown function (DUF713) contains similarity to Interpro domains IPR010989 (t-SNARE), IPR007883 (Protein of unknown function DUF713)
9tag-40R02C2.3n/achrV 249,183C. elegans TAG-40 protein; contains similarity to Pfam domain PF01757 Acyltransferase family contains similarity to Interpro domains IPR002656 (Acyltransferase 3), IPR006621 (Nose resistant to fluoxetine-4, N-terminal)
10K08H2.7K08H2.7n/achrX 13,247,766contains similarity to Synechocystis sp Probable glycogen synthase 2 (EC 2.4.1.21) (Starch [bacterialsglycogen] synthase 2).; SW:GLG2_SYNY3
11srd-32T19H12.5n/achrV 4,867,995C. elegans SRD-32 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1), IPR003945 (NADH-plastoquinone oxidoreductase, chain 5)
12ttr-54T14G10.4n/achrIV 10,156,441C. elegans TTR-54 protein; contains similarity to Pfam domain PF01060 Transthyretin-like family contains similarity to Interpro domain IPR001534 (Transthyretin-like)
13Y32B12A.5Y32B12A.5n/achrV 16,487,248contains similarity to Pfam domain PF04590 Protein of unknown function, DUF595 contains similarity to Interpro domain IPR007669 (Protein of unknown function DUF595)
14ZK757.1ZK757.1n/achrIII 9,869,795contains similarity to Pfam domain PF06681 Protein of unknown function (DUF1182) contains similarity to Interpro domains IPR000883 (Cytochrome c oxidase, subunit I), IPR010601 (Protein of unknown function DUF1182)
15srh-4K09D9.6n/achrV 4,011,203C. elegans SRH-4 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1), IPR000832 (GPCR, family 2, secretin-like)
16Y39A1A.10Y39A1A.10n/achrIII 10,632,788contains similarity to Arabidopsis thaliana ORF protein (Fragment).; TR:Q39170
17sod-4F55H2.1n/achrIII 9,499,079C. elegans SOD-4 protein; contains similarity to Pfam domain PF00080 Copper/zinc superoxide dismutase (SODC) contains similarity to Interpro domain IPR001424 (Superoxide dismutase, copper/zinc binding)
18F15H10.6F15H10.6n/achrV 10,411,166contains similarity to Mycoplasma pneumoniae Oligopeptide transport ATP-binding protein oppF.; SW:OPPF_MYCPN
19try-4F31D4.6n/achrV 20,855,551C. elegans TRY-4 protein; contains similarity to Pfam domains PF00089 (Trypsin) , PF03761 (Domain of unknown function (DUF316)) contains similarity to Interpro domains IPR001314 (Peptidase S1A, chymotrypsin), IPR001254 (Peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap), IPR005514 (Protein of unknown function DUF316), IPR009003 (Peptidase, trypsin-like serine and cysteine)
20Y7A5A.9Y7A5A.9n/achrX 15,828,129contains similarity to Cyprinus carpio Nucleolin.; TR:Q804J2
21srd-16C04E6.9n/achrV 5,899,272C. elegans SRD-16 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
22F14H3.9F14H3.9n/achrV 16,068,329contains similarity to Pfam domain PF03236 (Domain of unknown function DUF263)
23str-88R08H2.2n/achrV 15,383,115C. elegans STR-88 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
24F26A3.1F26A3.1n/achrI 7,641,050contains similarity to Interpro domain IPR008262 (Lipase, active site)
25T23F2.4T23F2.4n/achrX 5,514,897contains similarity to Pfam domain PF01679 Uncharacterized protein family UPF0057 contains similarity to Interpro domain IPR000612 (Protein of unknown function UPF0057)
26clec-12T27F6.2n/achrI 12,477,625C. elegans CLEC-12 protein; contains similarity to Pfam domains PF00431 (CUB domain) , PF00059 (Lectin C-type domain) (2)contains similarity to Interpro domains IPR000859 (CUB), IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
27C07E3.5C07E3.5n/achrII 10,364,567contains similarity to Pfam domain PF04942 CC domain contains similarity to Interpro domain IPR007026 (Domian of unknown function, DUF-CC)
28skr-16C42D4.6n/achrIV 7,169,011The skr-16 gene encodes a homolog of Skp1 in S. cerevisiae that has no known function in vivo, since skr-16(RNAi) animals are at least superficially normal.
29C06E4.1C06E4.1n/achrIV 7,283,548
30C02B4.3C02B4.3n/achrX 12,659,689weak similarity with E. coli hemolysin D protein (Swiss Prot accession number P09986)
31Y39A3B.1Y39A3B.1n/achrIII 2,007,600
32nas-28F42A10.8n/achrIII 6,182,093C. elegans NAS-28 protein; contains similarity to Pfam domain PF01400 Astacin (Peptidase family M12A) contains similarity to Interpro domains IPR017050 (Peptidase M12A, astacin, nematode), IPR006025 (Peptidase M, neutral zinc metallopeptidases, zinc-binding site), IPR001506 (Peptidase M12A, astacin), IPR006026 (Peptidase, metallopeptidases), IPR000859 (CUB), IPR013032 (EGF-like region, conserved site)
33K07A1.7K07A1.7n/achrI 9,597,007contains similarity to Drosophila melanogaster Flybase gene name is hdc-PC;; FLYBASE:CG15532
34C41G6.13C41G6.13n/achrV 15,208,853contains similarity to Homo sapiens Xylosyltransferase I; ENSEMBL:ENSP00000261381
35T22E5.3T22E5.3n/achrX 6,386,631contains similarity to Pfam domains PF01682 (DB module) , PF00041 (Fibronectin type III domain) contains similarity to Interpro domains IPR008957 (Fibronectin, type III-like fold), IPR003961 (Fibronectin, type III), IPR002602 (Protein of unknown function DB), IPR007110 (Immunoglobulin-like)
36srt-58C29G2.5n/achrV 2,575,489C. elegans SRT-58 protein; contains similarity to Pfam domains PF01748 (Caenorhabditis serpentine receptor-like protein) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR002651 (Protein of unknown function DUF32), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type)
37rnt-1B0414.2n/achrI 5,782,356rnt-1 encodes a transcription factor that is the sole C. elegans member of the RUNX family of transcriptional regulators; rnt-1 activity is required for several developmental processes, including regulation of hypodermal seam cell proliferation and proper development of the male tail; RNT-1 can physically interact with SMA-4 and regulates, either directly or indirectly, expression of tlp-1 and cki-1, which encode a C2H2 zinc finger and CDK inhibitor, respectively; RNT-1::GFP reporter fusions are reportedly expressed in the nuclei of hypodermal seam cells, intestinal cells, body wall muscles, and, in males, cells derived from the V5, V6 and T lineages that give rise to the sensory rays.
38F21F8.2F21F8.2n/achrV 8,275,167contains similarity to Pfam domain PF00026 Eukaryotic aspartyl protease contains similarity to Interpro domains IPR009007 (Peptidase aspartic, catalytic), IPR001461 (Peptidase A1)
39fut-4K12H6.3n/achrII 2,820,961fut-4 encodes a member of the glycosyltransferase 10 family.
40srx-95F41G3.11n/achrII 6,753,887C. elegans SRX-95 protein; contains similarity to Interpro domain IPR003915 (Polycystic kidney disease type 2 protein)
41C33A12.7C33A12.7n/achrIV 9,507,832contains similarity to Pfam domain PF00753 Metallo-beta-lactamase superfamily contains similarity to Interpro domain IPR001279 (Beta-lactamase-like)
42Y38H6C.21Y38H6C.21n/achrV 20,550,079contains similarity to Aquifex aeolicus Flagellar biosynthetic protein flhB.; SW:FLHB_AQUAE
43C53B4.6C53B4.6n/achrIV 8,985,786contains similarity to Pfam domain PF08449 UAA transporter family contains similarity to Interpro domain IPR013657 (UAA transporter)
44C30G4.2C30G4.2n/achrX 17,044,626contains similarity to Interpro domains IPR000210 (BTB/POZ-like), IPR011333 (BTB/POZ fold)
45W04D12.1W04D12.1n/achrIII 5,837,006
46K09E2.1K09E2.1n/achrX 8,683,969contains similarity to Pfam domain PF00092 von Willebrand factor type A domain contains similarity to Interpro domain IPR002035 (von Willebrand factor, type A)
47Y6E2A.4Y6E2A.4n/achrV 15,713,920contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR001723 (Steroid hormone receptor), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core), IPR002219 (Protein kinase C, phorbol ester/diacylglycerol binding)
48K07A9.3K07A9.3n/achrIV 1,835,383contains similarity to Interpro domain IPR001736 (Phospholipase D/Transphosphatidylase)
49F19F10.3F19F10.3n/achrV 7,552,413
50ZC266.2ZC266.2n/achrV 4,696,862