UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1fut-2EGAP9.20chrV 6,574,873fut-2 encodes a unique alpha 1,2-fucosyltransferase specifically expressed in intestinal cells of larval and adult animals; recombinant FUT-2 expressed in human 293T cells exhibits a novel acceptor specificity profile compared with mammalian alpha 1,2-fucosyltransferases and the predicted protein shares very low amino acid identity with human alpha 1,2-fucosyltransferases, but its predicted type 2 topology and domain structure are typical of other glucosyltransferases.
2srg-5T12A2.11n/achrIII 6,263,078C. elegans SRG-5 protein; contains similarity to Pfam domain PF02118 C.elegans Srg family integral membrane protein contains similarity to Interpro domain IPR000609 (Serpentine gamma receptor, Caenorhabditis species)
3srj-1ZK829.8n/achrIV 11,964,638C. elegans SRJ-1 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
4his-45B0035.10n/achrIV 11,326,794his-45 encodes an H3 histone.
5EGAP2.2EGAP2.2n/achrII 5,230,269
6ZC53.4ZC53.4n/achrX 1,931,714contains similarity to Tetrahymena thermophila SB210 Putative uncharacterized protein.; TR:Q227Y0
7ZC416.2ZC416.2n/achrIV 3,634,511n/a
8sre-31F57G9.1n/achrII 12,407,787C. elegans SRE-31 protein; contains similarity to Pfam domain PF03125 C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR004151 (C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor), IPR000366 (Fungal pheromone mating factor STE2 GPCR), IPR000293 (Channel forming colicin, C-terminal cytotoxic)
9nhr-241Y69H2.8n/achrV 18,700,186C. elegans NHR-241 protein
10K01A11.1K01A11.1n/achrIII 3,429,872contains similarity to Dictyostelium discoideum PAXILLIN-like protein.; TR:Q8MML5
11C37E2.3C37E2.3n/achrX 14,180,268contains similarity to Pfam domain PF04750 FAR-17a/AIG1-like protein contains similarity to Interpro domains IPR006838 (FAR-17a/AIG1-like protein), IPR002208 (SecY protein)
12B0205.5B0205.5n/achrI 10,740,393
13LLC1.2LLC1.2n/achrIV 14,460,481contains similarity to Pfam domain PF06879 Protein of unknown function (DUF1261) contains similarity to Interpro domain IPR009673 (Protein of unknown function DUF1261)
14Y102A5C.27Y102A5C.27n/achrV 16,988,446contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
15C17B7.10C17B7.10n/achrV 3,341,460C17B7.10 encodes a neprilysin; neprilysins are thermolysin-like zinc metallopeptidases, found on the outer surface of animal cells, that negatively regulate small signalling peptides (e.g., enkephalin, tachykinin, insulin, and natriuretic peptides) by cleaving them; C17B7.10 has no clear orthologs in other organisms.
16srw-76W06G6.6n/achrV 16,637,565C. elegans SRW-76 protein; contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)
17T01G6.10T01G6.10n/achrV 502,683contains similarity to Pfam domains PF01370 (NAD dependent epimerase/dehydratase family) , PF00106 (short chain dehydrogenase) contains similarity to Interpro domains IPR002424 (Insect alcohol dehydrogenase family), IPR001509 (NAD-dependent epimerase/dehydratase), IPR003560 (2,3-dihydro-2,3-dihydroxybenzoate dehydrogenase), IPR002347 (Glucose/ribitol dehydrogenase), IPR002198 (Short-chain dehydrogenase/reductase SDR), IPR016040 (NAD(P)-binding), IPR001100 (Pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase, class I)
18F13B12.3F13B12.3n/achrIV 10,441,433contains similarity to Tetraodon nigroviridis Chromosome 12 SCAF8721, whole genome shotgun sequence. (Fragment).; TR:Q4T6K3
19B0462.1B0462.1n/achrV 18,326,871contains similarity to Pfam domain PF05075 Protein of unknown function (DUF684) contains similarity to Interpro domain IPR007767 (Protein of unknown function DUF684)
20gcy-4ZK970.5n/achrII 10,306,418gcy-4 encodes a predicted transmembrane guanylyl cyclase; by homology, GCY-4 may function as a chemosensory receptor; however, as loss of gcy-4 activity via mutation or large-scale RNAi screens results in no obvious abnormalities, the precise role of gcy-4 in C. elegans development and/or behavior is not yet known; the sole gcy-4 ::GFP reporter construct reported to date did not produce any specific GFP signals.
21Y76A2B.2Y76A2B.2n/achrIII 13,533,575contains similarity to Homo sapiens Reticulon-4 receptor precursor; ENSEMBL:ENSP00000043402
22str-71T23F1.4n/achrV 15,458,547C. elegans STR-71 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
23srd-69H04J21.2n/achrIII 2,364,601C. elegans SRD-69 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
24D1086.1D1086.1n/achrV 14,099,606contains similarity to Pfam domain PF01579 Domain of unknown function DUF19 contains similarity to Interpro domains IPR016638 (Uncharacterised conserved protein UPF0376), IPR002542 (Protein of unknown function DUF19)
25srg-26C10G8.1n/achrV 5,332,145C. elegans SRG-26 protein; contains similarity to Pfam domain PF02118 C.elegans Srg family integral membrane protein contains similarity to Interpro domain IPR000609 (Serpentine gamma receptor, Caenorhabditis species)
26F14H3.9F14H3.9n/achrV 16,068,329contains similarity to Pfam domain PF03236 (Domain of unknown function DUF263)
27srsx-1F40D4.5n/achrV 17,177,360C. elegans SRSX-1 protein; contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)
28C11H1.2C11H1.2n/achrX 14,306,277contains similarity to Interpro domain IPR015672 (G-protein coupled receptor 89-related)
29Y39A1A.8Y39A1A.8n/achrIII 10,627,062contains similarity to Pfam domain PF03083 MtN3/saliva family contains similarity to Interpro domain IPR004316 (MtN3 and saliva related transmembrane protein)
30K09B11.4K09B11.4n/achrIV 13,429,722contains similarity to Patella vulgata Twist protein (Fragment).; TR:Q8WQQ8
31fbxb-21ZC204.8n/achrII 1,648,389fbxb-21 encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; FBXB-21 also contains a C-terminal type 2 F-box-associated domain of presently unknown function.
32R11G11.3R11G11.3n/achrV 531,412contains similarity to Interpro domain IPR000215 (Protease inhibitor I4, serpin)
33tbx-31C36C9.2n/achrX 1,672,652tbx-31 encodes a diverged member of the T-box transcription factor family; by homology, TBX-31 is predicted to function as a transcriptional regulator during development, but as loss of tbx-31 activity via RNAi results in no obvious defects, the precise role of TBX-31 in C. elegans development and/or behavior is not yet known.
34glb-20R01E6.6n/achrX 13,554,276glb-20 encodes a globin; glb-20 transcription is higher in L3 and dauers than in young adults; glb-20 has no obvious function in mass RNAi assays.
35B0302.4B0302.4n/achrX 17,176,549
36ZK896.9ZK896.9n/achrIV 12,857,434ZK896.9 encodes a putative transporter of UDP-N-acetylglucosamine (UDP-GlcNAc) and UDP-N-acetylgalactosamine (UDP-GalNAc), orthologous to human SLC35A3 (OMIM:605632) and paralogous to C03H5.2 and SRF-3; ZK896.9 has no obvious function in RNAi assays, but this could reflect genetic redundancy with its paralogs.
37K07D4.4K07D4.4n/achrII 4,032,008
38K09A11.5K09A11.5n/achrX 13,277,067contains similarity to Pfam domain PF00628 PHD-finger contains similarity to Interpro domains IPR008984 (SMAD/FHA domain), IPR001965 (Zinc finger, PHD-type), IPR013083 (Zinc finger, RING/FYVE/PHD-type), IPR011011 (Zinc finger, FYVE/PHD-type)
39C03A3.3C03A3.3n/achrX 11,268,134contains similarity to Pfam domain PF00753 Metallo-beta-lactamase superfamily contains similarity to Interpro domain IPR001279 (Beta-lactamase-like)
40Y116A8C.15Y116A8C.15n/achrIV 16,996,337contains similarity to Homo sapiens similar to KIAA1357 protein; ENSEMBL:ENSP00000258005
41Y51B9A.6Y51B9A.6n/achrII 9,401,875contains similarity to Pfam domain PF07690 Major Facilitator Superfamily contains similarity to Interpro domains IPR007114 (Major facilitator superfamily), IPR011701 (Major facilitator superfamily MFS-1), IPR016196 (MFS general substrate transporter)
42F13E9.4F13E9.4n/achrIV 10,895,888contains similarity to Pfam domain PF02520 Domain of unknown function DUF148 contains similarity to Interpro domains IPR000775 (Bindin), IPR008119 (Dense granule Gra6 protein), IPR003677 (Protein of unknown function DUF148)
43B0507.5B0507.5n/achrV 8,754,261
44C10G11.6C10G11.6n/achrI 6,291,932
45srd-56E04F6.14n/achrII 7,202,553C. elegans SRD-56 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
46ZK994.6ZK994.6n/achrV 8,503,564
47srd-21W06G6.3n/achrV 16,630,499C. elegans SRD-21 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
48F16G10.4F16G10.4n/achrII 2,369,673contains similarity to Pfam domain PF02343 Domain of unknown function DUF130 contains similarity to Interpro domains IPR003326 (Protein of unknown function DUF130), IPR002371 (Flagellar hook-associated protein)
49T16H12.1T16H12.1n/achrIII 10,084,745contains similarity to Human papillomavirus type 70 E7 protein.; SW:VE7_HPV70
50apc-11F35G12.9n/achrIII 4,594,070apc-11 encodes a predicted key catalytic subunit of the anaphase promoting complex that is required for embryonic development past the embryonic one- cell stage.