UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1E04A4.6E04A4.60chrIV 4,746,804contains similarity to Homo sapiens Isoform 5 of Tectonic-1 precursor; ENSEMBL:ENSP00000380771
2T26E4.5T26E4.5n/achrV 15,787,827contains similarity to Interpro domain IPR008996 ()
3Y116A8C.9Y116A8C.9n/achrIV 16,943,608contains similarity to Danio rerio Transmembrane protein 185-like.; SW:Q7SYC7
4F55F8.3F55F8.3n/achrI 5,651,700contains similarity to Pfam domains PF04047 (Periodic tryptophan protein 2 WD repeat associated presumed domain) , PF00400 (WD domain, G-beta repeat) (5)contains similarity to Interpro domains IPR000009 (Protein phosphatase 2A, regulatory subunit PR55), IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR011046 (WD40 repeat-like), IPR007190 (Periodic tryptophan protein-associated region), IPR001680 (WD40 repeat), IPR015943 (WD40/YVTN repeat-like)
5R06B9.2R06B9.2n/achrII 13,767,269contains similarity to Pfam domain PF00339 Arrestin (or S-antigen), N-terminal domain contains similarity to Interpro domains IPR014756 (Immunoglobulin E-set), IPR011021 (Arrestin-like, N-terminal)
6srbc-66T24A6.5n/achrV 3,531,539C. elegans SRBC-66 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
7W04C9.6W04C9.6n/achrI 485,237contains similarity to Pfam domain PF07690 Major Facilitator Superfamily contains similarity to Interpro domains IPR000694 (Proline-rich region), IPR011701 (Major facilitator superfamily MFS-1), IPR016196 (MFS general substrate transporter)
8C56E6.4C56E6.4n/achrII 6,527,652contains similarity to Pfam domain PF03607 Doublecortin contains similarity to Interpro domain IPR003533 (Doublecortin)
9srz-23F58E2.9n/achrIV 3,454,195C. elegans SRZ-23 protein ;
10his-4T10C6.11n/achrV 16,040,303his-4 encodes an H2B histone.
11F09E10.6F09E10.6n/achrX 1,496,339
12srh-47T03F7.4n/achrV 11,299,983C. elegans SRH-47 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1), IPR006069 (ATPase, P-type cation exchange, alpha subunit)
13B0511.5B0511.5n/achrI 10,630,197contains similarity to Pfam domain PF00100 Zona pellucida-like domain contains similarity to Interpro domain IPR001507 (Endoglin/CD105 antigen)
14T15B7.17T15B7.17n/achrV 6,814,434contains similarity to Pfam domain PF03385 Protein of unknown function, DUF288 contains similarity to Interpro domain IPR005049 (Protein of unknown function DUF288)
15cyp-33C2C45H4.17n/achrV 2,185,028C. elegans CYP-33C2 protein; contains similarity to Pfam domain PF00067 Cytochrome P450 contains similarity to Interpro domains IPR001128 (Cytochrome P450), IPR002401 (Cytochrome P450, E-class, group I), IPR002403 (Cytochrome P450, E-class, group IV), IPR002397 (Cytochrome P450, B-class)
16T02H6.10T02H6.10n/achrII 680,250
17Y116A8C.13Y116A8C.13n/achrIV 16,956,392contains similarity to Pfam domains PF00271 (Helicase conserved C-terminal domain) , PF00176 (SNF2 family N-terminal domain) contains similarity to Interpro domains IPR000330 (SNF2-related), IPR001395 (Aldo/keto reductase), IPR014021 (Helicase, superfamily 1 and 2, ATP-binding), IPR014001 (DEAD-like helicase, N-terminal), IPR001650 (DNA/RNA helicase, C-terminal)
18srh-59W10G11.10n/achrII 3,582,748C. elegans SRH-59 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
19C52D10.3C52D10.3n/achrIV 17,179,526contains similarity to Pelobacter propionicus DSM 2379 Hypothetical protein precursor.; TR:Q3FZT0
20cdh-8F18F11.3n/achrIV 351,612cdh-8 encodes a cadherin that may be nematode specific; CDH-8 is predicted to function as a membrane protein that plays a role in cell adhesion and/or morphogenesis, but as loss of cdh-8 activity via mutation or large-scale RNAi experiments results in no obvious abnormalities, the precise role of cdh-8 in C. elegans development and/or behavior is not yet known.
21C50F2.4C50F2.4n/achrI 3,890,325
22apx-1K08D9.3n/achrV 3,216,670apx-1 encodes one of ten C. elegans DSL (Delta, Serrate, LAG-2) proteins, integral transmembrane and secreted proteins that function as signaling ligands for the Notch family receptors GLP-1 and LIN-12; in the 4-cell embryo, maternally supplied APX-1 functions as a GLP-1 ligand for an inductive interaction that specifies the fate of the ABp blastomere; later in embryogenesis, APX-1 is required for formation of the LIN-12-dependent, invariant asymmetrical twist that occurs as part of normal gut morphogenesis; during larval development, APX-1 is required redundantly with DSL-1 and LAG-2 for the LIN-12-mediated lateral signal that spatially patterns the primary and secondary vulval cell lineages; in the early embryo, APX-1 is first detected at the anterior edge of the P1 blastomere, with later expression visible in P2 at sites of contact with ABp, and in the cytoplasm of the EMS and P3 blastomeres; expression in the vulval precursor cells (VPCs) is detected in the primary VPC, P6.p, and its descendants; embryonic APX-1 expression is dependent upon PIE-1 activity, while later vulval expression is mediated by the Ras signaling pathway and the SUR-2 transcriptional cofactor.
23str-122W03D2.10n/achrIV 4,067,151C. elegans STR-122 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
24srd-44F17A2.8n/achrX 12,339,267C. elegans SRD-44 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
25srsx-27C51E3.2n/achrV 10,151,415C. elegans SRSX-27 protein; contains similarity to Pfam domain PF00001 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
26C44H4.6C44H4.6n/achrX 14,597,741contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR008271 (Serine/threonine protein kinase, active site), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
27srd-46F17A2.10n/achrX 12,332,621C. elegans SRD-46 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
28str-246W09D6.3n/achrIII 11,078,457C. elegans STR-246 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
29ptr-13K07C10.1n/achrII 11,159,735ptr-13 encodes a nematode-specific member of the sterol sensing domain (SSD) proteins, distantly paralogous to Drosophila PATCHED (PTC) and human PTCH (OMIM:601309, mutated in basal cell nevus syndrome); PTR-13 is weakly required for normal molting from L4 to adult stages; PTR-13 is also required for normal growth to full size and locomotion.
30F26A1.7F26A1.7n/achrIII 4,819,598
31srh-297C17F4.4n/achrII 3,229,698C. elegans SRH-297 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR006084 (DNA repair protein (XPGC)/yeast Rad), IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
32srv-21H04M03.8n/achrIV 5,876,704C. elegans SRV-21 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
33Y48E1B.7Y48E1B.7n/achrII 13,580,236Y48E1B.7 encodes a C2H2-type zinc-finger protein required for embryonic development and fertility; Y48E1B.7 transcript levels are diminished by ERI-1, RDE-3, and RRF-2, perhaps through endogenous RNAi; Y48E1B.7 is paralogous to MCD-1, but has no obvious non-nematode orthologs; Y48E1B.7 contains a single central zinc-finger and a C-terminal low-complexity region, but no other recognizable protein domains.
34C48A7.2C48A7.2n/achrIV 7,395,373contains similarity to Pfam domain PF01384 Phosphate transporter family contains similarity to Interpro domains IPR000804 (Clathrin adaptor, sigma subunit/coatomer, zeta subunit), IPR001204 (Phosphate transporter)
35Y44A6D.1Y44A6D.1n/achrV 20,782,907contains similarity to Escherichia coli TraT.; TR:Q7WUD7
36R07B1.9R07B1.9n/achrX 9,879,387contains similarity to Arabidopsis thaliana Hypothetical protein (At1g15170).; TR:Q8L731
37Y66A7A.7Y66A7A.7n/achrIII 11,629,581contains similarity to Lactobacillus plantarum Hypothetical protein.; TR:Q88VI8
38srd-41F17A2.6n/achrX 12,327,467C. elegans SRD-41 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1), IPR003006 (Immunoglobulin/major histocompatibility complex, conserved site)
39hlh-29F31A3.4n/achrX 17,548,141C. elegans HLH-29 protein; contains similarity to Pfam domain PF00010 Helix-loop-helix DNA-binding domain contains similarity to Interpro domains IPR001092 (Basic helix-loop-helix dimerisation region bHLH), IPR011598 (Helix-loop-helix DNA-binding)
40immp-1C24H11.6n/achrIII 11,775,731C. elegans IMMP-1 protein; contains similarity to Pfam domain PF00717 Peptidase S24-like contains similarity to Interpro domains IPR001733 (Peptidase S26B, eukaryotic signal peptidase), IPR015927 (Peptidase S24, S26A, S26B and S26C), IPR014037 (Peptidase S26A), IPR011056 (Peptidase S24, S26A and S26B, C-terminal), IPR000223 (Peptidase S26A, signal peptidase I)
41sri-9Y102A5C.29n/achrV 17,002,496C. elegans SRI-9 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1), IPR000565 (DNA topoisomerase, type IIA, subunit B)
42W06G6.9W06G6.9n/achrV 16,646,169contains similarity to Ralstonia solanacearum Hypothetical protein RSc2317.; TR:Q8XX01
43C05D9.4C05D9.4n/achrX 1,108,239
44F15D3.7F15D3.7n/achrI 11,579,107contains similarity to Pfam domain PF02466 Tim17/Tim22/Tim23 family contains similarity to Interpro domain IPR003397 (Mitochondrial import inner membrane translocase, subunit Tim17/22)
45F18H3.1F18H3.1n/achrX 13,520,521contains similarity to Pfam domain PF00622 SPRY domain contains similarity to Interpro domains IPR001870 (B302, (SPRY)-like), IPR003877 (SPla/RYanodine receptor SPRY)
46fkb-7B0511.1n/achrI 10,669,451fkb-7 encodes a peptidylprolyl cis/trans isomerase homologous to mammalian FK506-binding proteins; by homology, FKB-7 could function in a number of different processes including protein folding, signal transduction, and regulation of muscle contraction; however, as loss of fkb-7 function via RNA-mediated interference (RNAi) does not result in any obvious abnormalities, the precise role of FKB-7 in C. elegans development and/or behavior is not yet known.
47T24D5.4T24D5.4n/achrX 12,597,224contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
48F52C9.5F52C9.5n/achrIII 5,304,230contains similarity to Pfam domain PF00024 PAN domain contains similarity to Interpro domains IPR000884 (Thrombospondin, type I), IPR003609 (Apple-like), IPR003014 (N/apple PAN)
49F09F9.3F09F9.3n/achrX 4,120,310
50C03B1.9C03B1.9n/achrX 6,346,694