UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1E04A4.3E04A4.35e-80chrIV 4,730,919
2F53A3.1F53A3.1n/achrIII 1,941,574
3T16A1.5T16A1.5n/achrII 2,083,711
4clpp-1ZK970.2n/achrII 10,301,745clpp-1 encodes a mitochondrial protein, homologous to bacterial ClpP, required to initiate the stress response to unfolded mitochondrial proteins; as with its bacterial ortholog, CLPP-1 is predicted to be a proteolytic subunit of a Clp-like protease, with an N-terminal region required for mitochondrial localization, and a C-terminal region of ClpP similarity; in response to a mutation stressing mitochondria, clpp-1(RNAi) animals show reduced HSP-60 levels, inhibited nuclear translocation and hsp-60 activation by DVE-1, and aberrant mitochondrial morphology; CLPP-1 is biochemically inhibited by the ClpP inhibitor Z-LY-CMK and the peptide aldehyde MG132, and may also be blocked by them when injected in vivo; CLPP-1 is expressed in the intestine.
5math-32F59H6.4n/achrII 2,012,019C. elegans MATH-32 protein; contains similarity to Pfam domain PF00917 MATH domain contains similarity to Interpro domains IPR008974 (TRAF-like), IPR002083 (MATH)
6skr-19R12H7.3n/achrX 13,224,084The skr-19 gene encodes a homolog of Skp1 in S. cerevisiae that has no known function in vivo, since skr-19(RNAi) animals are at least superficially normal.
7nhr-266F56H1.2n/achrI 5,738,931C. elegans NHR-266 protein; contains similarity to Pfam domains PF02206 (Domain of unknown function) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR003125 (Protein of unknown function WSN)
8nhr-70Y51A2D.17n/achrV 18,618,286C. elegans NHR-70 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR001723 (Steroid hormone receptor), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core), IPR002232 (5-Hydroxytryptamine 6 receptor)
9T15B7.10T15B7.10n/achrV 6,811,130contains similarity to Ostreococcus tauri Predicted CDS, putative cytoplasmic protein family member, with ascoiled coil-4 domain, of ancient origin (ISS).; TR:Q010X5
10srh-223F47C12.3n/achrIV 3,982,749C. elegans SRH-223 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
11srz-61K03D3.4n/achrIV 16,322,140C. elegans SRZ-61 protein ;
12srbc-2C04E12.9n/achrV 3,375,717C. elegans SRBC-2 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
13B0001.4B0001.4n/achrIV 12,136,377contains similarity to Pfam domain PF00485 Phosphoribulokinase / Uridine kinase family contains similarity to Interpro domains IPR000764 (Uridine kinase), IPR006083 (Phosphoribulokinase/uridine kinase), IPR006082 (Phosphoribulokinase), IPR003593 (AAA+ ATPase, core)
14F54F3.3F54F3.3n/achrV 12,920,812contains similarity to Pfam domains PF04083 (ab-hydrolase associated lipase region) , PF00561 (alpha/beta hydrolase fold) contains similarity to Interpro domains IPR006693 (AB-hydrolase associated lipase region), IPR000073 (Alpha/beta hydrolase fold-1), IPR008262 (Lipase, active site)
15Y51A2D.8Y51A2D.8n/achrV 18,551,910contains similarity to Pfam domains PF08246 (Cathepsin propeptide inhibitor domain (I29)) , PF00112 (Papain family cysteine protease) contains similarity to Interpro domains IPR013128 (Peptidase C1A, papain), IPR013201 (Proteinase inhibitor I29, cathepsin propeptide), IPR000668 (Peptidase C1A, papain C-terminal)
16F01G10.7F01G10.7n/achrIV 10,240,539contains similarity to Pfam domains PF04083 (ab-hydrolase associated lipase region) , PF00561 (alpha/beta hydrolase fold) contains similarity to Interpro domains IPR006693 (AB-hydrolase associated lipase region), IPR000073 (Alpha/beta hydrolase fold-1), IPR008262 (Lipase, active site)
17cyp-34A10B0213.16n/achrV 3,971,866C. elegans CYP-34A10 protein; contains similarity to Pfam domain PF00067 Cytochrome P450 contains similarity to Interpro domains IPR001128 (Cytochrome P450), IPR002401 (Cytochrome P450, E-class, group I), IPR002403 (Cytochrome P450, E-class, group IV)
18ocr-2T09A12.3n/achrIV 8,216,912ocr-2 encodes a TRPV (transient receptor potential channel, vanilloid subfamily) ion channel; OCR-2 activity is required for several types of sensory transduction including olfaction, osmosensation, mechanosensation, and chemosensation; an OCR-2 fusion protein is expressed in sensory cilia and requires the OSM-9 TRPV channel protein for proper localization; likewise, OSM-9 requires OCR-2 for its cilial localization.
19R07B1.6R07B1.6n/achrX 9,867,228contains similarity to Pfam domain PF01681 C6 domain contains similarity to Interpro domain IPR002601 (Protein of unknown function C6)
20K02F6.4K02F6.4n/achrII 2,541,208contains similarity to Pfam domains PF02206 (Domain of unknown function) , PF00023 (Ankyrin repeat) contains similarity to Interpro domains IPR002110 (Ankyrin), IPR003125 (Protein of unknown function WSN), IPR001357 (BRCT)
21F20D1.8F20D1.8n/achrX 14,996,828contains similarity to Pfam domain PF00100 Zona pellucida-like domain contains similarity to Interpro domain IPR001507 (Endoglin/CD105 antigen)
22inx-20T23H4.1n/achrI 9,877,813C. elegans INX-20 protein; contains similarity to Pfam domain PF00876 Innexin contains similarity to Interpro domain IPR000990 (Innexin)
23C46E10.3C46E10.3n/achrII 3,722,194
24B0286.1B0286.1n/achrII 4,382,555contains similarity to Homo sapiens Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 8; ENSEMBL:ENSP00000302239
25str-15T08G3.1n/achrV 16,458,013C. elegans STR-15 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
26C54E4.4C54E4.4n/achrIV 2,163,172
27clec-3C41H7.7n/achrII 3,018,651C. elegans CLEC-3 protein; contains similarity to Pfam domains PF00431 (CUB domain) , PF00059 (Lectin C-type domain) (2)contains similarity to Interpro domains IPR000859 (CUB), IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
28T22E5.6T22E5.6n/achrX 6,415,238contains similarity to Interpro domain IPR002016 (Haem peroxidase, plant/fungal/bacterial)
29pes-1T28H11.4n/achrIV 5,004,039C. elegans PES-1 protein; contains similarity to Pfam domain PF00250 Fork head domain contains similarity to Interpro domains IPR011991 (Winged helix repressor DNA-binding), IPR001766 (Fork head transcription factor)
30T14G11.1T14G11.1n/achrX 2,690,488
31K09E3.5K09E3.5n/achrX 17,109,938contains similarity to Pfam domain PF03353 DUF278 contains similarity to Interpro domain IPR005020 (Protein of unknown function DUF278)
32W04B5.6W04B5.6n/achrIII 2,434,376
33twk-14K01D12.4n/achrV 12,388,845C. elegans TWK-14 protein; contains similarity to Pfam domain PF07885 Ion channel contains similarity to Interpro domains IPR003280 (Potassium channel, two pore-domain), IPR005410 (Potassium channel, two pore-domain, THIK), IPR013099 (Ion transport 2), IPR003092 (Potassium channel, two pore-domain, TASK)
34M03D4.3M03D4.3n/achrIV 6,111,524
35Y75B8A.8Y75B8A.8n/achrIII 12,165,797contains similarity to Plasmodium yoelii yoelii Drosophila melanogaster CG8797 gene product-related (Fragment).; TR:Q7REV3
36C34E11.2C34E11.2n/achrX 11,808,336contains similarity to Pfam domain PF03166 MH2 domain contains similarity to Interpro domains IPR008984 (SMAD/FHA domain), IPR000694 (Proline-rich region), IPR001132 (SMAD domain, Dwarfin-type), IPR017855 (SMAD domain-like)
37F25H2.2F25H2.2n/achrI 10,544,713contains similarity to Pfam domains PF00595 (PDZ domain (Also known as DHR or GLGF)) , PF00787 (PX domain) contains similarity to Interpro domains IPR002048 (Calcium-binding EF-hand), IPR001683 (Phox-like), IPR001478 (PDZ/DHR/GLGF)
38tsp-18F59G1.2n/achrII 5,905,416C. elegans TSP-18 protein; contains similarity to Interpro domain IPR008952 (Tetraspanin)
39F59H6.2F59H6.2n/achrII 2,021,048
40T08H10.3T08H10.3n/achrV 4,472,476
41Y37D8A.22Y37D8A.22n/achrIII 12,937,773contains similarity to Danio rerio Transmembrane protein 49.; SW:Q6NYY9
42srbc-82C31A11.4n/achrV 16,301,000C. elegans SRBC-82 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
43srw-138C44C3.3n/achrV 2,962,370C. elegans SRW-138 protein; contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)
44ZK1073.2ZK1073.2n/achrX 16,113,615contains similarity to Aquifex aeolicus Hypothetical protein AQ_293.; SW:Y293_AQUAE
45F31A9.1F31A9.1n/achrX 1,797,616
46F58E2.2F58E2.2n/achrIV 3,470,373
47K12C11.3K12C11.3n/achrI 1,336,076contains similarity to Pfam domain PF04145 Ctr copper transporter family contains similarity to Interpro domain IPR007274 (Ctr copper transporter)
48T27A8.5T27A8.5n/achrX 16,065,286contains similarity to Pfam domain PF06869 Protein of unknown function (DUF1258) contains similarity to Interpro domain IPR009667 (Protein of unknown function DUF1258)
49clec-240F49H6.1n/achrV 17,011,082C. elegans CLEC-240 protein; contains similarity to Pfam domain PF00059 Lectin C-type domain contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
50T03F1.7T03F1.7n/achrI 3,856,739contains similarity to Pfam domain PF00398 Ribosomal RNA adenine dimethylase contains similarity to Interpro domains IPR001737 (Ribosomal RNA adenine methylase transferase), IPR016861 (Mitochondrial dimethyladenosine transferase 2, mitochondrial precursor)