UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1C54G10.1C54G10.13e-51chrV 14,641,219contains similarity to Homo sapiens similar to secreted gel-forming mucin; ENSEMBL:ENSP00000328427
2srj-8T28A11.9n/achrV 3,248,476C. elegans SRJ-8 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
3B0238.7B0238.7n/achrV 5,261,699contains similarity to Pfam domain PF00135 Carboxylesterase contains similarity to Interpro domain IPR002018 (Carboxylesterase, type B)
4R17.3R17.3n/achrIII 10,836,977R17.3 encodes an ortholog of human retinal pigment epithelium (RPE)-spondin (RPESP).
5F31B9.1F31B9.1n/achrX 15,912,318contains similarity to Pfam domain PF00001 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR002286 (P2 purinoceptor), IPR006121 (Heavy metal transport/detoxification protein), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
6ztf-9ZK287.6n/achrV 9,691,558C. elegans ZTF-9 protein; contains similarity to Interpro domain IPR015880 (Zinc finger, C2H2-like)
7T27F6.4T27F6.4n/achrI 12,485,310contains similarity to Saccharomyces cerevisiae Mid-Two Like 1; SGD:YGR023W
8R09H3.1R09H3.1n/achrX 1,660,650contains similarity to Sulfolobus solfataricus DNA double-strand break repair rad50 ATPase.; SW:Q97WH0
9clec-168F38A1.7n/achrIV 1,258,213C. elegans CLEC-168 protein; contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
10srd-21W06G6.3n/achrV 16,630,499C. elegans SRD-21 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
11srw-111M01G12.4n/achrI 12,124,188C. elegans SRW-111 protein; contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)
12F45G2.7F45G2.7n/achrIII 13,433,876contains similarity to Oceanobacillus iheyensis Two-component response regulator involved in modulation ofsflagellar.; TR:Q8EQW9
13Y65A5A.1Y65A5A.1n/achrIV 16,399,303contains similarity to Interpro domain IPR001092 (Basic helix-loop-helix dimerization domain bHLH)
14F36D4.1F36D4.1n/achrV 9,418,520
15F37B12.3F37B12.3n/achrII 9,040,539contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
16wrn-1F18C5.2n/achrII 6,557,068wrn-1 encodes an ortholog of human WRN, which when mutated leads to Werner syndrome (OMIM:277700), and one of four C. elegans homologs of the RecQ DNA helicase family that includes E. coli RecQ; by homology, WRN-1 is predicted to function as a helicase, DNA-dependent ATPase, and exonuclease that plays a key role in DNA replication, recombination, and repair; RNA interference studies in C. elegans and the enhancement of many of the resulting phenotypes by ionizing radiation indicate that wrn-1 affects life span and aging and acts at a DNA damage checkpoint; the wrn-1 phenotypes such as premature aging are similar to those of Werner syndrome; immunolocalization studies indicate that WRN-1 expression is nuclear in cells at the embryonic, larval and adult stages.
17C06E4.5C06E4.5n/achrIV 7,255,611contains similarity to Interpro domain IPR011009 (Protein kinase-like)
18ZK262.9ZK262.9n/achrV 18,440,924contains similarity to Brachydanio rerio Similar to formin binding protein 3.; TR:Q7ZUE4
19srh-206Y102A5C.15n/achrV 16,954,279C. elegans SRH-206 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
20srx-135F09F3.11n/achrV 13,860,290C. elegans SRX-135 protein ;
21hlh-8C02B8.4n/achrX 8,118,315The hlh-8 gene encodes a helix-loop-helix protein required for normal muscle development, and hence for normal defecation and egg-laying.
22K09H9.4K09H9.4n/achrI 3,134,515contains similarity to Interpro domains IPR015706 (RNA-directed DNA polymerase (reverse transcriptase), related), IPR003286 (Nematode reverse transcriptase-like)
23nhr-233Y32B12B.6n/achrV 16,570,335C. elegans NHR-233 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR001723 (Steroid hormone receptor), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
24F21C10.6F21C10.6n/achrV 9,124,712contains similarity to Pfam domain PF01705 CX module contains similarity to Interpro domain IPR002619 (Protein of unknown function CX)
25F01F1.14F01F1.14n/achrIII 5,882,603
26srh-278T09F5.8n/achrV 15,171,028C. elegans SRH-278 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
27F21F8.2F21F8.2n/achrV 8,275,167contains similarity to Pfam domain PF00026 Eukaryotic aspartyl protease contains similarity to Interpro domains IPR009007 (Peptidase aspartic, catalytic), IPR001461 (Peptidase A1)
28K05F6.8K05F6.8n/achrII 1,567,541This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins.
29R160.2R160.2n/achrX 4,376,697
30srj-45T03D3.6n/achrV 2,836,005C. elegans SRJ-45 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1), IPR006162 (Phosphopantetheine attachment site)
31F28A10.5F28A10.5n/achrII 850,172contains similarity to Pfam domain PF05050 Protein of unknown function (DUF672) contains similarity to Interpro domain IPR007744 (Protein of unknown function DUF672)
32C27D6.1C27D6.1n/achrII 5,174,657contains similarity to Interpro domain IPR009057 (Homeodomain-like)
33C18B2.2C18B2.2n/achrX 3,625,928contains similarity to Pfam domain PF04590 Protein of unknown function, DUF595 contains similarity to Interpro domain IPR007669 (Protein of unknown function DUF595)
34F22E12.3F22E12.3n/achrV 10,461,278contains similarity to Petroselinum crispum Reverse transcriptase (Fragment).; TR:Q9ZRL1
35nas-21T11F9.5n/achrV 11,473,207nas-21 encodes an astacin-like metalloprotease.
36srj-26ZK262.10n/achrV 18,422,252C. elegans SRJ-26 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
37F14H12.7F14H12.7n/achrX 4,362,080
38sra-11F44F4.13n/achrII 10,909,485sra-11 encodes an orphan, G protein-coupled seven-transmembrane receptor; SRA-11 is expressed in three classes of interneurons, AIA, AIY, and AVB throughout larval and adult stages, and analysis of sra-11 mutations indicates that sra-11 activity in AIY is essential for olfactory imprinting; sra-11 expression in AIY is positively regulated by the TTX-3 and CEH-23 homeodomain proteins, with TTX-3 required for both initiation and maintenance of expression and CEH-23 required solely for maintenance.
39ZK353.2ZK353.2n/achrIII 8,398,849contains similarity to Interpro domain IPR002952 (Eggshell protein)
40C55B6.4C55B6.4n/achrX 7,187,869
41srh-3K04F1.5n/achrV 1,683,835C. elegans SRH-3 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1), IPR001024 (Lipoxygenase, LH2)
42B0454.5B0454.5n/achrII 3,039,835contains similarity to Homo sapiens 21 kDa protein; VG:OTTHUMP00000165983
43R05D7.1R05D7.1n/achrI 12,162,955contains similarity to Kluyveromyces lodderae Truncated cytochrome oxidase subunit 2 (Fragment).; TR:Q7YG01
44C27F2.5C27F2.5n/achrIII 4,961,124C27F2.5 encodes the C. elegans ortholog of the conserved vacuolar protein sorting protein EAP30/SNF8/VPS22; by homology, the product of C27F2.5 is predicted to be a component of an ESCRT-II complex (Endosomal Sorting Complex Required for Transport) that functions in endosomal transport.
45nas-33K04E7.3n/achrX 6,453,429C. elegans NAS-33 protein; contains similarity to Pfam domains PF00090 (Thrombospondin type 1 domain) , PF01400 (Astacin (Peptidase family M12A)) contains similarity to Interpro domains IPR000884 (Thrombospondin, type I), IPR000742 (EGF-like, type 3), IPR006030 (Molluscan rhodopsin C-terminal tail), IPR006025 (Peptidase M, neutral zinc metallopeptidases, zinc-binding site), IPR000694 (Proline-rich region), IPR001506 (Peptidase M12A, astacin), IPR006026 (Peptidase, metallopeptidases), IPR000859 (CUB), IPR013032 (EGF-like region, conserved site)
46sri-65F13A7.8n/achrV 16,387,488C. elegans SRI-65 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1), IPR000883 (Cytochrome c oxidase, subunit I)
47col-148C12D8.8n/achrV 10,242,222C. elegans COL-148 protein; contains similarity to Pfam domains PF01484 (Nematode cuticle collagen N-terminal domain) , PF01391 (Collagen triple helix repeat (20 copies)) (2)contains similarity to Interpro domains IPR002486 (Nematode cuticle collagen, N-terminal), IPR003979 (Tropoelastin), IPR000694 (Proline-rich region), IPR008161 (Collagen helix repeat), IPR008160 (Collagen triple helix repeat)
48sre-7K02E11.2n/achrV 14,245,132C. elegans SRE-7 protein; contains similarity to Pfam domain PF03125 C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR004151 (C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor)
49sdz-34Y73C8C.7n/achrV 3,108,727C. elegans SDZ-34 protein; contains similarity to Pfam domain PF00097 Zinc finger, C3HC4 type (RING finger) contains similarity to Interpro domains IPR001841 (Zinc finger, RING-type), IPR001965 (Zinc finger, PHD-type), IPR013083 (Zinc finger, RING/FYVE/PHD-type), IPR000533 (Tropomyosin), IPR011016 (Zinc finger, variant RING-type)
50ZC412.8ZC412.8n/achrV 14,879,632contains similarity to Plasmodium cynomolgi Circumsporozoite protein precursor (CS).; SW:P08675