UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1acs-17C46F4.20chrX 5,939,959C. elegans ACS-17 protein; contains similarity to Pfam domain PF00501 AMP-binding enzyme contains similarity to Interpro domain IPR000873 (AMP-dependent synthetase and ligase)
2nhr-79T26H2.9n/achrV 19,209,750C. elegans NHR-79 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR001723 (Steroid hormone receptor), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
3sulp-8ZK287.2n/achrV 9,671,599sulp-8 encodes one of eight C. elegans members of the sulfate permease family of anion transporters; by homology, SULP-8 is predicted to function as an anion transporter that regulates cellular pH and volume via transmembrane movement of electrolytes and fluids; a SULP-8::GFP fusion is expressed in the basolateral membrane of the excretory cell, intestine, and rectal gland cells.
4C34F6.9C34F6.9n/achrX 11,220,316contains similarity to Interpro domain IPR001394 (Peptidase C19, ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 2)
5far-5F15B9.3n/achrV 12,996,198far-5 encodes a member of a class of fatty acid-and retinol-binding proteins that are known to be secreted by parasitic nematodes and plants; far-5 binds lipid in fluorescence-based assays, however, the precise function of far-5 is not known.
6F17E5.2F17E5.2n/achrX 12,396,800contains similarity to Pfam domains PF00153 (Mitochondrial carrier protein) (3), PF00036 (EF hand) (3)contains similarity to Interpro domains IPR011992 (EF-Hand type), IPR002048 (Calcium-binding EF-hand), IPR003842 (Vacuolating cytotoxin), IPR002067 (Mitochondrial carrier protein), IPR002030 (Mitochondrial brown fat uncoupling protein), IPR002167 (Graves disease carrier protein), IPR001993 (Mitochondrial substrate carrier), IPR002113 (Adenine nucleotide translocator 1)
7F54D10.8F54D10.8n/achrII 3,826,789contains similarity to Pfam domain PF01697 Domain of unknown function contains similarity to Interpro domain IPR008166 (Protein of unknown function DUF23)
8aco-1ZK455.1n/achrX 11,341,447aco-1 encodes an aconitase that is homologous to mammalian iron regulatory protein-1 (IRP1); aco-1 activity is required for normal brood sizes and, under iron stress conditions, for normal lifespan and L4-to-adult growth rates; ACO-1 physically interacts with GEX-3; like IRP1, ACO-1 has aconitase activity and is post-translationally regulated by iron, but, unlike IRP1, it lacks RNA-binding activity; ACO-1 is predicted to be mitochondrial, and its mRNA levels appear to decrease in response to iron treatment.
9lin-13C03B8.4n/achrIII 7,704,833Gene Function : lin-13 encodes a large (2248-residue) nuclear protein with multiple zinc fingers of the C2H2 class and a LXCXE retinoblastoma protein-binding motif, that is required for survival through larval development and for negative regulation of vulval fates during postembryonic development.
10srh-44B0334.7n/achrII 11,516,530C. elegans SRH-44 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
11F58A4.6F58A4.6n/achrIII 9,614,710contains similarity to Homo sapiens Hypothetical protein FLJ36688; ENSEMBL:ENSP00000256538
12T19C3.5T19C3.5n/achrIII 626,220contains similarity to Pfam domains PF02886 (LBP / BPI / CETP family, C-terminal domain) , PF01273 (LBP / BPI / CETP family, N-terminal domain) contains similarity to Interpro domain IPR001124 (Lipid-binding serum glycoprotein)
13F31D5.2F31D5.2n/achrII 4,216,907contains similarity to Pfam domains PF07690 (Major Facilitator Superfamily) , PF05978 (Eukaryotic protein of unknown function (DUF895)) contains similarity to Interpro domains IPR010291 (Protein of unknown function DUF895, eukaryotic), IPR011701 (Major facilitator superfamily MFS-1), IPR016196 (MFS general substrate transporter)
14C32D5.7C32D5.7n/achrII 6,337,900
15Y81G3A.4Y81G3A.4n/achrII 13,092,774contains similarity to Guillardia theta 60S acidic ribosomal protein P0.; TR:Q98S65
16srh-83F09G2.7n/achrV 7,165,183C. elegans SRH-83 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
17T23B12.4T23B12.4n/achrV 8,463,927contains similarity to Pfam domain PF04112 Mak10 subunit, NatC N(alpha)-terminal acetyltransferase contains similarity to Interpro domain IPR007244 (Mak10 subunit, NatC N(alpha)-terminal acetyltransferase)
18C06C6.6C06C6.6n/achrV 15,990,153contains similarity to Pfam domain PF02206 Domain of unknown function contains similarity to Interpro domain IPR003125 (Protein of unknown function WSN)
19lgc-18T01H10.7n/achrX 12,126,727C. elegans LGC-18 protein; contains similarity to Pfam domain PF02931 Neurotransmitter-gated ion-channel ligand binding domain contains similarity to Interpro domains IPR006201 (Neurotransmitter-gated ion-channel), IPR006202 (Neurotransmitter-gated ion-channel ligand-binding)
20F28A10.2F28A10.2n/achrII 829,085contains similarity to Pfam domains PF05050 (Protein of unknown function (DUF672)) , PF02995 (Protein of unknown function (DUF229)) contains similarity to Interpro domains IPR007744 (Protein of unknown function DUF672), IPR004245 (Protein of unknown function DUF229)
21F46G11.1F46G11.1n/achrX 5,794,401F46G11.1 is orthologous to the human gene TRUNCATED PUTATIVE T7-LIKE MITOCHONDRIAL DNA HELICASE (C10orf2; OMIM:606075), which when mutated leads to disease.
22F22E5.13F22E5.13n/achrII 2,648,208
23ist-1C54D1.3n/achrX 7,135,879ist-1 encodes a pleckstrin homology (PH) and phosphotyrosine binding (PTB) domain-containing insulin receptor substrate (IRS) homolog that negatively regulates lifespan and dauer development; IST-1 potentiates insulin-like signaling, although it is not absolutely required for such signaling under most conditions; in addition to acting through the AGE-1/PI3K branch of the insulin-like signaling pathway, IST-1 may also function in a parallel pathway to activate downstream protein-kinase Bs encoded by akt-1 and akt-2.
24gcy-21F22E5.3n/achrII 2,662,347gcy-21 is predicted to encode a guanylate cyclase.
25sulp-1C55B7.6n/achrI 6,484,156sulp-1 encodes one of eight C. elegans members of the sulfate permease family of anion transporters; by homology, SULP-1 is predicted to function as an anion transporter that regulates cellular pH and volume via transmembrane movement of electrolytes and fluids; a sulp-1::GFP transcriptional fusion is expressed strongly in several neurons, weakly in hypodermal cells and the intestine, and very faintly in the excretory cell and body wall muscle.
26osm-6R31.3n/achrV 11,925,995osm-6 encodes a novel protein that is orthologous to the IFT52 component of the intraflagellar transport particle; osm-6 activity is required cell autonomously for proper sensory cilium structure and thus for normal ciliated sensory neuron function; OSM-6 is a component of the intraflagellar transport particle subcomplex B, and OSM-6::GFP reporter fusions are expressed exclusively in ciliated sensory neurons.
27gcy-35T04D3.4n/achrI 13,329,337C. elegans GCY-35 protein; contains similarity to Pfam domains PF07700 (Heme NO binding) , PF07701 (Heme NO binding associated) , PF00211 (Adenylate and Guanylate cyclase catalytic domain) contains similarity to Interpro domains IPR011644 (Haem NO binding), IPR011645 (Haem NO binding associated), IPR001054 (Adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase)
28Y57G11B.2Y57G11B.2n/achrIV 14,566,202contains similarity to Guillardia theta Hypothetical protein orf176 from chromosome 3.; TR:Q98SC3
29BE10.4BE10.4n/achrIII 12,815,049contains similarity to Interpro domain IPR000694 (Proline-rich region)
30tbx-35ZK177.10n/achrII 5,524,762C. elegans TBX-35 protein; contains similarity to Pfam domain PF00907 T-box contains similarity to Interpro domains IPR008967 (p53-like transcription factor, DNA-binding), IPR001699 (Transcription factor, T-box)
31C33E10.5C33E10.5n/achrX 17,276,148contains similarity to Interpro domain IPR000173 (Glyceraldehyde 3-phosphate dehydrogenase)
32C16D6.2C16D6.2n/achrX 12,544,267contains similarity to Pfam domain PF00001 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) contains similarity to Interpro domains IPR001402 (Prolactin-releasing peptide receptor), IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000405 (Galanin receptor), IPR000611 (Neuropeptide Y receptor), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
33wht-6T26A5.1n/achrIII 6,473,428C. elegans WHT-6 protein; contains similarity to Pfam domains PF01061 (ABC-2 type transporter) , PF00005 (ABC transporter) contains similarity to Interpro domains IPR003439 (ABC transporter-like), IPR003593 (AAA+ ATPase, core), IPR013525 (ABC-2 type transporter)
34F11G11.13F11G11.13n/achrII 4,875,478contains similarity to Pfam domain PF00217 ATP:guanido phosphotransferase, C-terminal catalytic domain contains similarity to Interpro domains IPR000749 (ATP:guanido phosphotransferase), IPR014746 (Glutamine synthetase/guanido kinase, catalytic region)
35T11F1.3T11F1.3n/achrII 2,955,703
36str-43T23D5.9n/achrV 15,751,514C. elegans STR-43 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
37K11H12.4K11H12.4n/achrIV 674,988contains similarity to Pfam domain PF03409 Protein of unknown function (DUF274) contains similarity to Interpro domain IPR005071 (Protein of unknown function DUF274)
38F22G12.5F22G12.5n/achrI 13,172,567contains similarity to Interpro domain IPR001765 (Carbonic anhydrase)
39E01G6.2E01G6.2n/achrX 12,257,730contains similarity to Streptomyces coelicolor;Streptomyces lividans Putative secreted protein (Putative TWIN ARGININ translocationsreceptor).; TR:Q9RJ68
40T23G11.1T23G11.1n/achrI 7,701,721contains similarity to Plasmodium falciparum Hypothetical protein.; TR:Q8I452
41T28D6.7T28D6.7n/achrIII 11,345,403contains similarity to Pfam domain PF01852 START domain contains similarity to Interpro domain IPR002913 (Lipid-binding START)
42T09E11.6T09E11.6n/achrI 12,367,467contains similarity to Pfam domain PF02485 Core-2/I-Branching enzyme contains similarity to Interpro domain IPR003406 (Glycosyl transferase, family 14)
43T09B9.3T09B9.3n/achrX 9,760,250contains similarity to Pfam domain PF03009 Glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family contains similarity to Interpro domain IPR004129 (Glycerophosphoryl diester phosphodiesterase)
44fbxb-107F29A7.2n/achrII 2,760,240C. elegans FBXB-107 protein; contains similarity to Pfam domain PF07735 F-box associated contains similarity to Interpro domain IPR012885 (F-box associated type 2)
45del-4T28B8.5n/achrI 8,140,996C. elegans DEL-4 protein; contains similarity to Pfam domain PF00858 Amiloride-sensitive sodium channel contains similarity to Interpro domain IPR001873 (Na+ channel, amiloride-sensitive)
46C17C3.2C17C3.2n/achrII 5,566,360
47F54C4.4F54C4.4n/achrIII 87,055
48str-56T06C12.3n/achrV 15,873,145C. elegans STR-56 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1), IPR003569 (Cytochrome c-type biogenesis protein CcbS)
49tag-192T04D1.4n/achrI 4,692,225C. elegans TAG-192 protein; contains similarity to Pfam domains PF00271 (Helicase conserved C-terminal domain) , PF07533 (Associated with TFs and helicases) , PF00385 ('chromo' (CHRromatin Organisation MOdifier) domain) , PF00176 (SNF2 family N-terminal domain) contains similarity to Interpro domains IPR000953 (Chromo domain), IPR000330 (SNF2-related), IPR000104 (Antifreeze protein, type I), IPR001005 (SANT, DNA-binding), IPR000694 (Proline-rich region), IPR016197 (Chromo domain-like), IPR014021 (Helicase, superfamily 1 and 2, ATP-binding), IPR006576 (BRK), IPR009057 (Homeodomain-like), IPR014001 (DEAD-like helicase, N-terminal), IPR001650 (DNA/RNA helicase, C-terminal)
50Y53C10A.5Y53C10A.5n/achrI 12,000,702contains similarity to Interpro domain IPR000608 (Ubiquitin-conjugating enzyme, E2)