UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1C41H7.1C41H7.12e-118chrII 3,016,764
2F46F5.12F46F5.12n/achrII 807,746contains similarity to Pfam domain PF03269 Caenorhabditis protein of unknown function, DUF268 contains similarity to Interpro domain IPR004951 (Protein of unknown function DUF268, Caenorhabditis species)
3adm-4ZK154.7n/achrX 7,796,626adm-4 encodes a member of the ADAM (disintegrin plus metalloprotease) family; ADM-4 is highly expressed in most post-embryonic tissues.
4math-1B0047.4n/achrII 2,046,310C. elegans MATH-1 protein; contains similarity to Pfam domain PF00917 MATH domain contains similarity to Interpro domains IPR008974 (TRAF-like), IPR002083 (MATH)
5T20D4.8T20D4.8n/achrV 3,406,799T20D4.8 encodes a neprilysin; neprilysins are thermolysin-like zinc metallopeptidases, found on the outer surface of animal cells, that negatively regulate small signalling peptides (e.g., enkephalin, tachykinin, insulin, and natriuretic peptides) by cleaving them; T20D4.8 has no clear orthologs in other organisms.
6F44B9.5F44B9.5n/achrIII 8,015,142contains similarity to Pfam domain PF02845 CUE domain contains similarity to Interpro domains IPR003892 (Ubiquitin system component Cue), IPR002123 (Phospholipid/glycerol acyltransferase)
7Y47H9C.12Y47H9C.12n/achrI 11,896,823contains similarity to Escherichia coli O6 FMN reductase (EC 1.5.1.29).; TR:Q8FJ92
8ZK856.4ZK856.4n/achrV 10,183,835contains similarity to Interpro domain IPR011001 (Saposin-like)
9T01D1.4T01D1.4n/achrII 178,045contains similarity to Pfam domain PF03079 ARD/ARD' family contains similarity to Interpro domains IPR011051 (Cupin, RmlC-type), IPR004313 (Acireductone dioxygenase, ARD), IPR014710 (RmlC-like jelly roll fold)
10ZC84.1ZC84.1n/achrIII 9,203,077contains similarity to Pfam domains PF01683 (EB module) (3), PF00014 (Kunitz/Bovine pancreatic trypsin inhibitor domain) (5)contains similarity to Interpro domains IPR011052 (Proteinase and amylase inhibitor), IPR002223 (Proteinase inhibitor I2, Kunitz metazoa), IPR006150 (Cysteine-rich repeat), IPR001762 (Blood coagulation inhibitor, Disintegrin), IPR013032 (EGF-like region, conserved site), IPR006149 (Nematode-specific EB region)
11W04A8.2W04A8.2n/achrI 13,840,793contains similarity to Streptococcus pyogenes Putative type I site-specific deoxyribonuclease hsdS subunit.; TR:Q8K5V9
12F56E10.1F56E10.1n/achrV 105,397contains similarity to Neurospora crassa Protein bfr-2.; SW:Q7S6P8
13F17A9.4F17A9.4n/achrV 6,109,818contains similarity to Pfam domain PF00724 NADH:flavin oxidoreductase / NADH oxidase family contains similarity to Interpro domains IPR013785 (Aldolase-type TIM barrel), IPR001155 (NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase, N-terminal), IPR002343 (Paraneoplastic encephalomyelitis antigen)
14C45E5.1C45E5.1n/achrIV 5,745,740contains similarity to Pfam domain PF00702 haloacid dehalogenase-like hydrolase contains similarity to Interpro domains IPR006357 (HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA), IPR005834 (Haloacid dehalogenase-like hydrolase)
15F41E6.12F41E6.12n/achrV 8,627,981
16clec-170F38A1.1n/achrIV 1,270,618C. elegans CLEC-170 protein; contains similarity to Pfam domain PF00059 Lectin C-type domain contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
17lin-25F56H9.5n/achrV 12,654,300lin-25 encodes a novel transcription factor that is conserved in C. briggsae and C. remanei; during development, lin-25 functions downstream of let-60 ras to regulate fate specification and differentiation of a number of cell types such as the vulval precursor cells; targets of LIN-25 activity include the lin-39 Hox gene, whose transcriptional upregulation during vulval cell fate specification is dependent upon lin-25; LIN-25 is expressed in vulval precursor cells, hypodermal seam cells, and cells in the somatic gonad; LIN-25 is detected in nuclei, but also seen in the cytoplasm.
18tag-131H38K22.3n/achrIII 4,318,987C. elegans TAG-131 protein; contains similarity to Pfam domain PF00173 Cytochrome b5-like Heme/Steroid binding domain contains similarity to Interpro domain IPR001199 (Cytochrome b5)
19C06A1.6C06A1.6n/achrII 10,564,347contains similarity to Interpro domains IPR000006 (Metallothionein, vertebrate), IPR004035 (Endonuclease III, iron-sulphur binding, conserved site-1), IPR001396 (Echinodermata metallothionein, family 4), IPR001008 (Mollusc metallothionein, family 2)
20math-21C40D2.3n/achrII 1,994,852C. elegans MATH-21 protein; contains similarity to Pfam domain PF00917 MATH domain contains similarity to Interpro domains IPR008974 (TRAF-like), IPR002083 (MATH)
21F55C12.6F55C12.6n/achrII 5,875,271contains similarity to Pfam domain PF06852 Protein of unknown function (DUF1248) contains similarity to Interpro domain IPR009658 (Protein of unknown function DUF1248)
22plc-3T01E8.3n/achrII 10,226,078C. elegans PLC-3 protein; contains similarity to Pfam domains PF07653 (Variant SH3 domain) , PF00168 (C2 domain) , PF00387 (Phosphatidylinositol-specific phospholipase C, Y domain) , PF00018 (SH3 domain) , PF00388 (Phosphatidylinositol-specific phospholipase C, X domain) , PF00017 (SH2 domain) (2)contains similarity to Interpro domains IPR001192 (Phospholipase C, phosphoinositol-specific, C-terminal (PLC)), IPR001849 (Pleckstrin-like), IPR001452 (Src homology-3), IPR011511 (Variant SH3), IPR000909 (Phospholipase C, phosphatidylinositol-specific , X region), IPR008973 (C2 calcium/lipid-binding region, CaLB), IPR001711 (Phospholipase C, phosphatidylinositol-specific, Y domain), IPR016279 (Phosphatidylinositol-4, 5-bisphosphate phosphodiesterase gamma), IPR000980 (SH2 motif), IPR013841 (Phospholipase C, phosphatidylinositol-specific , X and Y boxes), IPR000008 (C2 calcium-dependent membrane targeting)
23C14E2.1C14E2.1n/achrX 1,826,905
24K09C4.5K09C4.5n/achrX 3,284,155contains similarity to Pfam domains PF07690 (Major Facilitator Superfamily) , PF00083 (Sugar (and other) transporter) contains similarity to Interpro domains IPR007114 (Major facilitator superfamily), IPR011701 (Major facilitator superfamily MFS-1), IPR005828 (General substrate transporter), IPR016196 (MFS general substrate transporter)
25R08F11.1R08F11.1n/achrV 3,781,014contains similarity to Pfam domain PF04685 Protein of unknown function, DUF608 contains similarity to Interpro domains IPR006775 (Protein of unknown function DUF608), IPR014551 (Beta-glucosidase, GBA2 type), IPR008928 (Six-hairpin glycosidase-like)
26nol-9K09B11.2n/achrIV 13,425,891C. elegans NOL-9 protein; contains similarity to Pfam domain PF08160 NUC156 domain contains similarity to Interpro domains IPR012581 (NUC156), IPR003593 (AAA+ ATPase, core)
27F43C9.1F43C9.1n/achrX 4,794,691This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins.
28R05D3.9R05D3.9n/achrIII 8,365,541contains similarity to Interpro domains IPR012336 (Thioredoxin-like fold), IPR012335 (Thioredoxin fold)
29inx-15R12E2.9n/achrI 4,160,065C. elegans INX-15 protein; contains similarity to Pfam domain PF00876 Innexin contains similarity to Interpro domain IPR000990 (Innexin)
30npp-5F07A11.3n/achrII 11,598,202C. elegans NPP-5 protein; contains similarity to Interpro domain IPR007252 (Nuclear pore protein 84/107)
31T05E7.1T05E7.1n/achrI 6,205,413contains similarity to Pfam domains PF08840 (BAAT / Acyl-CoA thioester hydrolase C terminal) , PF04775 (Acyl-CoA thioester hydrolase / Bile acid-CoA amino acid N-acetyltransferase) contains similarity to Interpro domains IPR006862 (Acyl-CoA thioester hydrolase/bile acid-CoA amino acid N-acetyltransferase), IPR014940 (BAAT/Acyl-CoA thioester hydrolase C-terminal), IPR016662 (Acyl-CoA thioesterase, long chain)
32bli-5F45G2.5n/achrIII 13,428,598bli-5 encodes a protease inhibitor that affects the integrity of the cuticle and the development of the bursa in the adult male.
33F21E9.2F21E9.2n/achrX 1,329,400
34R06F6.2R06F6.2n/achrII 10,790,634contains similarity to Interpro domains IPR001841 (Zinc finger, RING-type), IPR016528 (Vacuolar protein sorting-associated protein 11), IPR013083 (Zinc finger, RING/FYVE/PHD-type), IPR000547 (Clathrin, heavy chain/VPS, 7-fold repeat), IPR016024 (Armadillo-type fold), IPR011044 (Quinoprotein amine dehydrogenase, beta chain-like)
35Y39A1A.22Y39A1A.22n/achrIII 10,705,056contains similarity to Pfam domains PF03124 (EXS family) , PF03105 (SPX domain) contains similarity to Interpro domains IPR004342 (EXS, C-terminal), IPR004331 (SPX, N-terminal)
36tgt-1ZK829.6n/achrIV 11,958,629tgt-1 encodes a tRNA-guanine transglycosylase predicted to be mitochondrial.
37F55D12.2F55D12.2n/achrI 7,892,099contains similarity to Interpro domains IPR002017 (Spectrin repeat), IPR001251 (Cellular retinaldehyde-binding/triple function, C-terminal)
38K10C2.2K10C2.2n/achrX 6,433,006contains similarity to Interpro domain IPR000832 (GPCR, family 2, secretin-like)
39cul-5ZK856.1n/achrV 10,181,305cul-5 encodes a cullin, orthologous to vasopressin-activated calcium-mobilizing receptor-1 in mammals, that is thought to regulate the cell cycle by virtue of its paralogy to cul-1 and cul-2; however, CUL-5 is dispensable for viability and gross morphology in mass RNAi screens, and does not appear to interact with any of 17 Skp1-related proteins (SKR-1 through SKR-21).
40H37A05.2H37A05.2n/achrV 13,632,011contains similarity to Pfam domains PF02958 (Domain of unknown function (DUF227)) , PF07914 (Protein of unknown function (DUF1679)) contains similarity to Interpro domains IPR011009 (Protein kinase-like), IPR012877 (Protein of unknown function DUF1679, Caenorhabditis species), IPR004119 (Protein of unknown function DUF227), IPR015897 (CHK kinase-like)
41adr-2T20H4.4n/achrIII 7,231,956adr-2 encodes an adenosine deaminase that acts on RNA (ADAR); ADARs are RNA-editing enzymes that deaminate adenosines to create inosines in double-stranded RNA (dsRNA); adr-2 is expressed ubiquitously in early embryos, as well as in the germline of early adults; ADR-2 is required for ADAR activity in vivo, and for normal chemotaxis.
42R07B1.3R07B1.3n/achrX 9,859,984contains similarity to Pfam domain PF01130 CD36 family contains similarity to Interpro domain IPR002159 (CD36 antigen)
43T21B6.2T21B6.2n/achrX 10,939,710contains similarity to Pfam domains PF00300 (Phosphoglycerate mutase family) , PF00328 (Histidine acid phosphatase) contains similarity to Interpro domains IPR000560 (Histidine acid phosphatase), IPR013078 (Phosphoglycerate mutase)
44F56D6.6F56D6.6n/achrIV 3,904,376
45W02D3.4W02D3.4n/achrI 6,720,208contains similarity to Pfam domain PF07857 CEO family (DUF1632) contains similarity to Interpro domain IPR012435 (Protein of unknown function DUF1632)
46rpb-6C06A1.5n/achrII 10,579,552C. elegans RPB-6 protein; contains similarity to Pfam domain PF01192 RNA polymerase Rpb6 contains similarity to Interpro domains IPR006110 (RNA polymerase Rpb6), IPR002048 (Calcium-binding EF-hand), IPR006111 (DNA-directed RNA polymerase, 14 to 18 kDa subunit), IPR012293 (RNA polymerase subunit, RPB6/omega)
47ddl-2Y48E1B.1n/achrII 13,545,140C. elegans DDL-2 protein; contains similarity to Interpro domains IPR006077 (Vinculin/alpha-catenin), IPR000381 (Inhibin, beta B subunit), IPR000694 (Proline-rich region), IPR003882 (Pistil-specific extensin-like protein)
48skr-9C52D10.7n/achrIV 17,163,837skr-9 encodes a homolog of Skp1 in S. cerevisiae, a component of the SCF (Skp1, Cullin, F-box) ubiquitin-ligase complex that regulates ubiquitin-mediated protein degradation; SKR-9 is required for posterior body morphogenesis, embryonic and larval development, and postembryonic cell proliferation.
49F54D12.1F54D12.1n/achrII 1,400,894contains similarity to Pfam domain PF08277 PAN-like domain contains similarity to Interpro domain IPR006583 (CW)
50srh-40Y40D12A.3n/achrIII 6,611,482C. elegans SRH-40 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)