UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1srh-227C35D6.20chrIV 16,343,304C. elegans SRH-227 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
2nhr-188F47C10.7n/achrV 3,857,080C. elegans NHR-188 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
3T28H10.1T28H10.1n/achrV 12,504,477contains similarity to Pfam domain PF01648 4'-phosphopantetheinyl transferase superfamily contains similarity to Interpro domain IPR008278 (4'-phosphopantetheinyl transferase)
4srab-18T11A5.3n/achrV 9,870,635C. elegans SRAB-18 protein; contains similarity to Interpro domain IPR002184 (Serpentine beta receptor)
5math-25C46F9.4n/achrII 1,896,912C. elegans MATH-25 protein; contains similarity to Pfam domain PF00917 MATH domain contains similarity to Interpro domains IPR008974 (TRAF-like), IPR002083 (MATH)
6scl-1F49E11.9n/achrIV 13,056,795scl-1 encodes a predicted secretory protein that is a member of the cysteine-rich secretory protein (CRISP) family; scl-1 activity positively regulates longevity and stress resistance; in wild-type animals, scl-1 mRNA is detected solely in eggs, while in daf-2 mutants it is detected in eggs and late adult stages; scl-1 expression appears to be under the control of the DAF-2/insulin-like signaling pathway as, in mixed-stage cultures, scl-1 mRNA levels are increased in daf-2 and age-1 mutants and undetectable in daf-16 mutants; scl-1 contains a DAF-16 consensus binding element within its predicted regulatory regions.
7F48A9.2F48A9.2n/achrI 6,593,082
8sulp-5K12G11.2n/achrV 11,881,591sulp-5 encodes one of eight C. elegans members of the sulfate permease family of anion transporters; by homology, SULP-5 is predicted to function as an anion transporter that regulates cellular pH and volume via transmembrane movement of electrolytes and fluids; a SULP-5::GFP fusion is expressed in punctate structures irregularly distributed along the apical membrane of excretory cell canals and is also expressed weakly in adult seam cells.
9T26E4.5T26E4.5n/achrV 15,787,827contains similarity to Interpro domain IPR008996 ()
10C44H9.2C44H9.2n/achrV 12,832,016contains similarity to Antirrhinum majus ACC synthase 2 (Fragment).; TR:Q9ZT10
11dod-20B0554.6n/achrV 423,333C. elegans DOD-20 protein; contains similarity to Pfam domain PF03409 Protein of unknown function (DUF274) contains similarity to Interpro domain IPR005071 (Protein of unknown function DUF274)
12C01B7.3C01B7.3n/achrV 8,783,769
13C54D10.8C54D10.8n/achrV 12,445,902contains similarity to Homo sapiens cDNA FLJ44007 fis, clone TESTI4023762; ENSEMBL:ENSP00000364402
14W04D12.1W04D12.1n/achrIII 5,837,006
15Y38H6C.21Y38H6C.21n/achrV 20,550,079contains similarity to Aquifex aeolicus Flagellar biosynthetic protein flhB.; SW:FLHB_AQUAE
16C33F10.4C33F10.4n/achrII 4,796,475
17M163.6M163.6n/achrX 14,463,353contains similarity to Xenopus laevis Hypothetical protein.; TR:Q7SZA3
18ZK632.9ZK632.9n/achrIII 9,825,065contains similarity to Barley yellow dwarf virus Coat protein.; SW:COAT_BYDVN
19B0410.1B0410.1n/achrX 2,894,901
20T05C3.2T05C3.2n/achrV 5,498,362The T05C3.2 gene encodes a protein that may be involved in apoptosis.
21F56H6.7F56H6.7n/achrI 12,299,265contains similarity to Pfam domain PF03385 Protein of unknown function, DUF288 contains similarity to Interpro domains IPR005049 (Protein of unknown function DUF288), IPR001692 (Histidinol dehydrogenase)
22B0228.6B0228.6n/achrII 7,754,791
23K06H6.6K06H6.6n/achrV 584,556contains similarity to Pfam domain PF01531 Glycosyl transferase family 11 contains similarity to Interpro domain IPR002516 (Glycosyl transferase, family 11)
24F19B10.6F19B10.6n/achrII 3,663,696
25C43H6.6C43H6.6n/achrX 2,397,074contains similarity to Pfam domains PF00059 (Lectin C-type domain) , PF00431 (CUB domain) contains similarity to Interpro domains IPR000859 (CUB), IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
26B0244.5B0244.5n/achrIII 5,745,987
27srd-32T19H12.50.006chrV 4,867,995C. elegans SRD-32 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1), IPR003945 (NADH-plastoquinone oxidoreductase, chain 5)
28F23B2.10F23B2.10n/achrIV 9,153,550contains similarity to Interpro domain IPR001841 (Zinc finger, RING-type)
29clec-179C42D4.11n/achrIV 7,183,961C. elegans CLEC-179 protein; contains similarity to Pfam domain PF08277 PAN-like domain contains similarity to Interpro domains IPR006583 (CW), IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
30ZC239.2ZC239.2n/achrII 3,218,443contains similarity to Pfam domain PF02214 K+ channel tetramerisation domain contains similarity to Interpro domains IPR011333 (BTB/POZ fold), IPR003131 (Potassium channel, voltage dependent, Kv, tetramerisation)
31T15D6.12T15D6.12n/achrI 12,400,253contains similarity to Pfam domain PF01697 Domain of unknown function contains similarity to Interpro domain IPR008166 (Protein of unknown function DUF23)
32srg-7C18F10.8n/achrIII 6,267,278C. elegans SRG-7 protein; contains similarity to Pfam domain PF02118 C.elegans Srg family integral membrane protein contains similarity to Interpro domain IPR000609 (Serpentine gamma receptor, Caenorhabditis species)
33C17G1.1C17G1.1n/achrX 9,919,758contains similarity to Trypanosoma rangeli Kinetoplastid membrane protein 11.; TR:Q7YZC6
34C54A12.3C54A12.3n/achrII 5,261,141
35F26F2.2F26F2.2n/achrV 20,559,052contains similarity to Saccharomyces cerevisiae Global transcription activator that acts in complex with Snf2p, Snf5p, Snf6p, and Swi3p to assist gene-specific activators; involved in the regulation of expression of many genes, including ADH1, ADH2, GAL1, HO, INO1 and SUC2; SGD:YPL016W
36twk-16F52E4.4n/achrX 3,083,226C. elegans TWK-16 protein; contains similarity to Pfam domain PF07885 Ion channel contains similarity to Interpro domains IPR003280 (Potassium channel, two pore-domain), IPR000694 (Proline-rich region), IPR013099 (Ion transport 2), IPR003092 (Potassium channel, two pore-domain, TASK)
37nas-28F42A10.8n/achrIII 6,182,093C. elegans NAS-28 protein; contains similarity to Pfam domain PF01400 Astacin (Peptidase family M12A) contains similarity to Interpro domains IPR017050 (Peptidase M12A, astacin, nematode), IPR006025 (Peptidase M, neutral zinc metallopeptidases, zinc-binding site), IPR001506 (Peptidase M12A, astacin), IPR006026 (Peptidase, metallopeptidases), IPR000859 (CUB), IPR013032 (EGF-like region, conserved site)
38twk-7F22B7.7n/achrIII 8,638,816C. elegans TWK-7 protein; contains similarity to Pfam domain PF07885 Ion channel contains similarity to Interpro domains IPR003280 (Potassium channel, two pore-domain), IPR013099 (Ion transport 2), IPR003092 (Potassium channel, two pore-domain, TASK)
39F57E7.2F57E7.2n/achrV 16,482,980contains similarity to Psilotum nudum Hypothetical protein.; TR:Q8WHW9
40ZK1073.1ZK1073.1n/achrX 16,126,525contains similarity to Pfam domain PF03096 Ndr family contains similarity to Interpro domain IPR004142 (Ndr)
41math-6C16C4.11n/achrII 1,884,167C. elegans MATH-6 protein; contains similarity to Pfam domain PF00917 MATH domain contains similarity to Interpro domains IPR008974 (TRAF-like), IPR002083 (MATH)
42Y70C5C.3Y70C5C.3n/achrV 16,714,293contains similarity to Pfam domain PF03269 Caenorhabditis protein of unknown function, DUF268 contains similarity to Interpro domain IPR004951 (Protein of unknown function DUF268, Caenorhabditis species)
43M01G12.7M01G12.7n/achrI 12,115,167contains similarity to Arabidopsis thaliana Hypothetical protein.; TR:Q9LZ50
44lgc-6F17E9.8n/achrIV 8,341,064C. elegans LGC-6 protein; contains similarity to Pfam domain PF02931 Neurotransmitter-gated ion-channel ligand binding domain contains similarity to Interpro domains IPR006201 (Neurotransmitter-gated ion-channel), IPR006202 (Neurotransmitter-gated ion-channel ligand-binding)
45sod-4F55H2.1n/achrIII 9,499,079C. elegans SOD-4 protein; contains similarity to Pfam domain PF00080 Copper/zinc superoxide dismutase (SODC) contains similarity to Interpro domain IPR001424 (Superoxide dismutase, copper/zinc binding)
46sre-20ZC455.7n/achrV 12,783,819C. elegans SRE-20 protein; contains similarity to Pfam domain PF03125 C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR004151 (C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor), IPR008075 (Lipocalin-1 receptor)
47ugt-6ZC455.4n/achrV 12,796,799C. elegans UGT-6 protein; contains similarity to Pfam domains PF04101 (Glycosyltransferase family 28 C-terminal domain) , PF00201 (UDP-glucoronosyl and UDP-glucosyl transferase) contains similarity to Interpro domains IPR002213 (UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase), IPR007235 (Glycosyl transferase, family 28, C-terminal)
48srj-16T06A1.20.003chrV 1,955,236C. elegans SRJ-16 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
49srz-53Y102A5C.23n/achrV 16,977,768C. elegans SRZ-53 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
50str-89F59A1.40.0006chrV 17,670,073C. elegans STR-89 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)