UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1sru-3C33A12.111e-178chrIV 9,497,224C. elegans SRU-3 protein; contains similarity to Pfam domain PF02688 Domain of unknown function DUF215 contains similarity to Interpro domain IPR003839 (Protein of unknown function DUF215)
2T26E4.5T26E4.5n/achrV 15,787,827contains similarity to Interpro domain IPR008996 ()
3F47C12.1F47C12.1n/achrIV 4,001,937contains similarity to Pfam domains PF00008 (EGF-like domain) (4), PF00754 (F5/8 type C domain) , PF07645 (Calcium binding EGF domain) (2), PF07699 (GCC2 and GCC3) (3), PF00431 (CUB domain) , PF07974 (EGF-like domain) , PF02494 (HYR domain) (2), PF00084 (Sushi domain (SCR repeat)) (6)contains similarity to Interpro domains IPR001438 (EGF-like, type 2), IPR000742 (EGF-like, type 3), IPR003410 (Hyalin), IPR000436 (Sushi/SCR/CCP), IPR006209 (EGF-like), IPR000152 (Aspartic acid and asparagine hydroxylation site), IPR006210 (EGF), IPR002049 (EGF-like, laminin), IPR008979 (Galactose-binding like), IPR000859 (CUB), IPR011641 (GCC2 and GCC3), IPR001881 (EGF-like calcium-binding), IPR016060 (Complement control module), IPR009030 (Growth factor, receptor), IPR013032 (EGF-like region, conserved site), IPR000421 (Coagulation factor 5/8 type, C-terminal), IPR013111 (EGF, extracellular), IPR013091 (EGF calcium-binding)
4C12D5.10C12D5.10n/achrV 7,692,770contains similarity to Pfam domain PF03236 Domain of unknown function DUF263 contains similarity to Interpro domain IPR004920 (Protein of unknown function DUF263)
5F27E11.1F27E11.1n/achrV 3,464,980contains similarity to Pfam domains PF01773 (Na+ dependent nucleoside transporter N-terminus) , PF07670 (Nucleoside recognition) , PF07662 (Na+ dependent nucleoside transporter C-terminus) contains similarity to Interpro domains IPR008276 (Concentrative nucleoside transporter), IPR002668 (Na+ dependent nucleoside transporter), IPR011657 (Na+ dependent nucleoside transporter, C-terminal), IPR011642 (Nucleoside recognition)
6ZK938.3ZK938.3n/achrII 9,832,928contains similarity to Pfam domain PF00612 IQ calmodulin-binding motif contains similarity to Interpro domain IPR000048 (IQ calmodulin-binding region)
7skr-9C52D10.7n/achrIV 17,163,837skr-9 encodes a homolog of Skp1 in S. cerevisiae, a component of the SCF (Skp1, Cullin, F-box) ubiquitin-ligase complex that regulates ubiquitin-mediated protein degradation; SKR-9 is required for posterior body morphogenesis, embryonic and larval development, and postembryonic cell proliferation.
8C14A6.8C14A6.8n/achrV 18,170,317contains similarity to Gallus gallus Cellular tumor antigen p53 (Tumor suppressor p53).; SW:P53_CHICK
9M04C9.4M04C9.4n/achrI 9,356,115contains similarity to Bos taurus Osteopontin precursor (Bone sialoprotein 1).; SW:OSTP_BOVIN
10F59A3.1F59A3.1n/achrI 5,525,077F59A3.1 encodes one of two C. elegans carboxypeptidase D homologs; loss of F59A3.1 activity via large-scale RNAi screens in a sensitized, rrf-3 mutant background results in larval lethality, abnormal locomotion, and abnormal morphogenesis of the vulval epithelium resulting in rupture; high-throughput expression studies report F59A3.1 expression in the pharynx only.
11F11A5.8F11A5.8n/achrV 16,208,396contains similarity to Pfam domain PF01757 Acyltransferase family contains similarity to Interpro domain IPR002656 (Acyltransferase 3)
12C32B5.5C32B5.5n/achrII 974,906contains similarity to Pfam domain PF00646 F-box domain
13ire-1C41C4.4n/achrII 8,118,482ire-1 encodes a transmembrane serine/threonine protein kinase and site-specific endoribonuclease orthologous to Saccharomyces cerevisiae inositol-requiring 1 protein kinase (Ire1) and human endoplasmic reticulum-to-nucleus signaling 1 (ERN1, OMIM:604033); IRE-1 is required for the unfolded protein response (UPR) that counteracts cellular stress induced by accumulation of unfolded proteins in the endoplasmic reticulum (ER); in response to ER stress, IRE-1 cleaves xbp-1 mRNA to produce transcriptionally active XBP-1 that positively regulates UPR gene expression in order to maintain ER homeostasis.
14F22F1.3F22F1.3n/achrX 8,162,399contains similarity to Pfam domain PF02172 KIX domain contains similarity to Interpro domain IPR003101 (Coactivator CBP, KIX)
15tag-224B0496.8n/achrIV 7,450,248tag-224 encodes an ortholog of Drosophila CG6522-PA and of human LMCD1 and TESTIN; TAG-224 is dispensable for Wnt-directed planar cell polarity and the fully asymmetrical division of B.a versus B.p cells.
16C46H3.3C46H3.3n/achrX 1,228,487contains similarity to Pfam domain PF00023 Ankyrin repeat contains similarity to Interpro domain IPR002110 (Ankyrin)
17str-178R11D1.5n/achrV 12,715,427C. elegans STR-178 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
18R08B4.3R08B4.3n/achrX 11,119,911contains similarity to Homo sapiens 23 kDa protein; VG:OTTHUMP00000170038
19srh-15C50B6.6n/achrV 13,321,651C. elegans SRH-15 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
20T20F7.5T20F7.5n/achrX 16,850,352contains similarity to Interpro domain IPR000694 (Proline-rich region)
21F56F11.2F56F11.2n/achrIII 2,883,625
22T21E12.2T21E12.2n/achrI 4,414,499contains similarity to Interpro domain IPR006162 (Phosphopantetheine attachment site)
23C44H9.4C44H9.4n/achrV 12,837,723contains similarity to Interpro domain IPR000839 (Porin, Oms28 type)
24gcy-3R134.1n/achrII 9,504,941gcy-3 is predicted to encode a guanylate cyclase.
25EEED8.12EEED8.12n/achrII 5,408,624contains similarity to Pfam domain PF00076 RNA recognition motif. (a.k.a. RRM, RBD, or RNP domain) contains similarity to Interpro domains IPR002952 (Eggshell protein), IPR012677 (Nucleotide-binding, alpha-beta plait), IPR000504 (RNA recognition motif, RNP-1)
26sri-18Y22F5A.2n/achrV 10,259,578C. elegans SRI-18 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
27Y17D7C.2Y17D7C.2n/achrV 18,717,931contains similarity to Pfam domains PF07714 (Protein tyrosine kinase) , PF00069 (Protein kinase domain) contains similarity to Interpro domains IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related), IPR008266 (Tyrosine protein kinase, active site)
28C01H6.3C01H6.3n/achrI 7,208,985contains similarity to Pfam domain PF00096 (Zinc finger, C2H2 type)
29ZK892.6ZK892.6n/achrII 9,979,541contains similarity to Vibrio parahaemolyticus Hypothetical protein.; TR:Q87PB2
30str-16Y73C8A.1n/achrV 3,239,764C. elegans STR-16 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1), IPR002091 (Aromatic amino acid permease)
31F08G12.3F08G12.3n/achrX 11,301,106contains similarity to Plasmodium falciparum Hypothetical protein.; TR:Q8I5Q0
32F52H2.1F52H2.1n/achrX 2,574,893
33ceh-23ZK652.5n/achrIII 7,840,469The ceh-23 gene encodes a homeodomain protein required for a specific differentiated trait of the thermosensory interneuron AIY.
34C41C4.3C41C4.3n/achrII 8,110,504contains similarity to Pfam domain PF00560 Leucine Rich Repeat contains similarity to Interpro domains IPR001611 (Leucine-rich repeat), IPR003591 (Leucine-rich repeat, typical subtype)
35F13B12.3F13B12.3n/achrIV 10,441,433contains similarity to Tetraodon nigroviridis Chromosome 12 SCAF8721, whole genome shotgun sequence. (Fragment).; TR:Q4T6K3
36R151.1R151.1n/achrIII 7,218,656
37C08H9.1C08H9.1n/achrII 9,876,448contains similarity to Pfam domain PF00450 Serine carboxypeptidase contains similarity to Interpro domain IPR001563 (Peptidase S10, serine carboxypeptidase)
38F38A1.6F38A1.6n/achrIV 1,252,165
39F45D3.2F45D3.2n/achrV 12,541,972contains similarity to Dictyocaulus viviparus Putative uncharacterized protein.; TR:Q6E6T3
40Y41C4A.13Y41C4A.13n/achrIII 11,735,378contains similarity to Homo sapiens Rabconnectin; ENSEMBL:ENSP00000251076
41ocam-1T02B5.2n/achrV 14,167,452T02B5.2 encodes a protein with an OCAM domain, a nematode-specific motif conserved between T02B5.2 and two other nematode ONECUT homeobox proteins (CEH-21 and CEH-41); this gene is probably derived from a ONECUT gene that lost both tit cut domain and its homeodomain; T02B5.2 has no obvious function in mass RNAi assays.
42srh-179ZK228.7n/achrV 18,477,190C. elegans SRH-179 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
43F54A5.2F54A5.2n/achrI 966,565contains similarity to Pfam domain PF00100 Zona pellucida-like domain contains similarity to Interpro domain IPR001507 (Endoglin/CD105 antigen)
44C34F6.10C34F6.10n/achrX 11,233,244contains similarity to Pfam domain PF00041 Fibronectin type III domain contains similarity to Interpro domains IPR008957 (Fibronectin, type III-like fold), IPR003961 (Fibronectin, type III), IPR000694 (Proline-rich region)
45cdk-2K03E5.3n/achrI 3,411,552C. elegans CDK-2 protein; contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR008271 (Serine/threonine protein kinase, active site), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
46nhr-176F14H3.11n/achrV 16,072,040C. elegans NHR-176 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR001723 (Steroid hormone receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
47chd-3T14G8.1n/achrX 12,849,438chd-3 encodes a PHD-finger SNF2 family member containing a chromo domain and a C-terminal helicase domain that affects Notch-dependent vulval development; expressed in virtually all embryonic cells and in many larval nuclei.
48B0554.5B0554.5n/achrV 425,501contains similarity to Pfam domain PF05978 Eukaryotic protein of unknown function (DUF895) contains similarity to Interpro domains IPR010291 (Protein of unknown function DUF895, eukaryotic), IPR016196 (MFS general substrate transporter)
49T10B10.5T10B10.5n/achrX 15,197,450contains similarity to Pfam domain PF00168 C2 domain contains similarity to Interpro domains IPR008973 (C2 calcium/lipid-binding region, CaLB), IPR000008 (C2 calcium-dependent membrane targeting)
50ZK1086.2ZK1086.2n/achrX 13,792,979contains similarity to Shewanella oneidensis Hypothetical protein.; TR:Q8EJA6