UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1C32H11.6C32H11.63e-96chrIV 12,926,301contains similarity to Pfam domain PF02520 Domain of unknown function DUF148 contains similarity to Interpro domain IPR003677 (Protein of unknown function DUF148)
2sra-25T26E3.9n/achrI 12,687,150C. elegans SRA-25 protein; contains similarity to Pfam domain PF02117 C.elegans Sra family integral membrane protein contains similarity to Interpro domains IPR003945 (NADH-plastoquinone oxidoreductase, chain 5), IPR000344 (Nematode chemoreceptor, Sra)
3C32H11.8C32H11.86e-83chrIV 12,934,318contains similarity to Pfam domain PF02520 Domain of unknown function DUF148 contains similarity to Interpro domain IPR003677 (Protein of unknown function DUF148)
4F25H5.6F25H5.6n/achrI 9,159,313contains similarity to Pfam domain PF08561 Mitochondrial ribosomal protein L37 contains similarity to Interpro domain IPR013870 (Ribosomal protein L37, mitochondrial)
5nhr-106T01G6.4n/achrV 490,539nhr-106 encodes a nuclear receptor that is most highly conserved amongst nematode species.
6R13H4.6R13H4.6n/achrV 11,864,309contains similarity to Archaeoglobus fulgidus Putative protease La homolog type (EC 3.4.21.-).; SW:O29883
7F30A10.2F30A10.2n/achrI 9,479,884contains similarity to Staphylococcus aureus ATP-depentend DNA helicase.; TR:Q8NVT1
8D1054.5D1054.5n/achrV 10,774,690contains similarity to Pfam domain PF00571 (CBS domain)
9sqt-2C01B12.1n/achrII 23,878sqt-2 encodes a collagen required for normal alae formation and body morphology; sqt-2 mutants exhibit a slightly dumpy phenotype and the bodies of mutants are helically twisted.
10W04E12.7W04E12.7n/achrV 19,731,742contains similarity to Pfam domain PF06162 Caenorhabditis elegans protein of unknown function (DUF976) contains similarity to Interpro domains IPR010381 (Protein of unknown function DUF976, Caenorhabditis species), IPR016125 (Peptidase C15, pyroglutamyl peptidase I-like)
11F47B10.2F47B10.2n/achrX 10,894,920F47B10.2 is orthologous to the human gene HISTIDASE (HAL; OMIM:235800), which when mutated leads to disease.
12Y37D8A.18Y37D8A.18n/achrIII 12,927,052contains similarity to Interpro domain IPR001848 (Ribosomal protein S10)
13srx-18C47A10.8n/achrV 17,797,511C. elegans SRX-18 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
14lys-6F58B3.3n/achrIV 11,627,398C. elegans LYS-6 protein; contains similarity to Pfam domain PF01183 Glycosyl hydrolases family 25 contains similarity to Interpro domains IPR017853 (Glycoside hydrolase, catalytic core), IPR013781 (Glycoside hydrolase, subgroup, catalytic core), IPR002053 (Glycoside hydrolase, family 25)
15lys-5F58B3.2n/achrIV 11,624,888C. elegans LYS-5 protein; contains similarity to Pfam domain PF01183 Glycosyl hydrolases family 25 contains similarity to Interpro domains IPR017853 (Glycoside hydrolase, catalytic core), IPR013781 (Glycoside hydrolase, subgroup, catalytic core), IPR002053 (Glycoside hydrolase, family 25)
16hlh-15C43H6.8n/achrX 2,413,123C. elegans HLH-15 protein; contains similarity to Pfam domain PF00010 Helix-loop-helix DNA-binding domain contains similarity to Interpro domains IPR001092 (Basic helix-loop-helix dimerisation region bHLH), IPR011598 (Helix-loop-helix DNA-binding)
17F47C12.1F47C12.1n/achrIV 4,001,937contains similarity to Pfam domains PF00008 (EGF-like domain) (4), PF00754 (F5/8 type C domain) , PF07645 (Calcium binding EGF domain) (2), PF07699 (GCC2 and GCC3) (3), PF00431 (CUB domain) , PF07974 (EGF-like domain) , PF02494 (HYR domain) (2), PF00084 (Sushi domain (SCR repeat)) (6)contains similarity to Interpro domains IPR001438 (EGF-like, type 2), IPR000742 (EGF-like, type 3), IPR003410 (Hyalin), IPR000436 (Sushi/SCR/CCP), IPR006209 (EGF-like), IPR000152 (Aspartic acid and asparagine hydroxylation site), IPR006210 (EGF), IPR002049 (EGF-like, laminin), IPR008979 (Galactose-binding like), IPR000859 (CUB), IPR011641 (GCC2 and GCC3), IPR001881 (EGF-like calcium-binding), IPR016060 (Complement control module), IPR009030 (Growth factor, receptor), IPR013032 (EGF-like region, conserved site), IPR000421 (Coagulation factor 5/8 type, C-terminal), IPR013111 (EGF, extracellular), IPR013091 (EGF calcium-binding)
18col-131C39E9.3n/achrIV 13,066,496C. elegans COL-131 protein; contains similarity to Pfam domains PF01484 (Nematode cuticle collagen N-terminal domain) , PF01391 (Collagen triple helix repeat (20 copies)) (3)contains similarity to Interpro domains IPR002486 (Nematode cuticle collagen, N-terminal), IPR008161 (Collagen helix repeat), IPR008160 (Collagen triple helix repeat)
19F23F1.2F23F1.2n/achrII 34,690contains similarity to Pfam domain PF00036 EF hand contains similarity to Interpro domains IPR011992 (EF-Hand type), IPR002048 (Calcium-binding EF-hand)
20nhr-273T12C9.1n/achrII 4,436,140C. elegans NHR-273 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
21F18C5.5F18C5.5n/achrII 6,566,049contains similarity to Interpro domains IPR000694 (Proline-rich region), IPR002373 (cAMP/cGMP-dependent protein kinase)
22ugt-30T01G5.2n/achrV 15,123,493C. elegans UGT-30 protein; contains similarity to Pfam domain PF00201 UDP-glucoronosyl and UDP-glucosyl transferase contains similarity to Interpro domain IPR002213 (UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase)
23H23N18.5H23N18.5n/achrV 4,912,068contains similarity to Interpro domains IPR016090 (Phospholipase A2), IPR013090 (Phospholipase A2, active site)
24srv-29T13A10.6n/achrIV 6,265,730C. elegans SRV-29 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
25F44A6.5F44A6.5n/achrX 10,217,967contains similarity to Sulfolobus tokodaii Hypothetical protein ST0534.; TR:Q974X9
26F58H10.1F58H10.1n/achrI 7,756,062contains similarity to Homo sapiens Splice isoform Long of Q8WXX7 Autism susceptibility gene 2 protein; ENSEMBL:ENSP00000329863
27zbed-6F25H8.6n/achrIV 9,919,215zbed-6 encodes a protein that contains a BED-type zinc finger domain; loss of zbed-6 activity in large-scale RNAi screens indicates that zbed-6 is required for larval development.
28F19D8.2F19D8.2n/achrX 13,835,397contains similarity to Homo sapiens Splice isoform 1 of Q9UMN6 Myeloid/lymphoid or mixed-lineage leukemia protein 4; ENSEMBL:ENSP00000222270
29F32D1.2F32D1.2n/achrV 4,346,245contains similarity to Pfam domain PF04627 Mitochondrial ATP synthase epsilon chain contains similarity to Interpro domain IPR006721 (ATPase, F1 complex, epsilon subunit, mitochondrial)
30srx-102F40H7.5n/achrII 3,694,076C. elegans SRX-102 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
31T16G1.4T16G1.4n/achrV 12,940,921contains similarity to Pfam domains PF02958 (Domain of unknown function (DUF227)) , PF07914 (Protein of unknown function (DUF1679)) contains similarity to Interpro domains IPR011009 (Protein kinase-like), IPR012877 (Protein of unknown function DUF1679, Caenorhabditis species), IPR004119 (Protein of unknown function DUF227), IPR015897 (CHK kinase-like)
32R07B7.6R07B7.6n/achrV 12,073,908contains similarity to Pfam domain PF02485 Core-2/I-Branching enzyme contains similarity to Interpro domain IPR003406 (Glycosyl transferase, family 14)
33ZK593.3ZK593.3n/achrIV 10,917,060contains similarity to Bacillus cereus YndE protein (Spore germination protein BB).; TR:Q9K337
34col-173F41C6.5n/achrX 6,876,334C. elegans COL-173 protein; contains similarity to Pfam domains PF01484 (Nematode cuticle collagen N-terminal domain) , PF01391 (Collagen triple helix repeat (20 copies)) (3)contains similarity to Interpro domains IPR002486 (Nematode cuticle collagen, N-terminal), IPR000694 (Proline-rich region), IPR008160 (Collagen triple helix repeat)
35Y38A10A.2Y38A10A.2n/achrV 6,058,787contains similarity to Pfam domain PF02995 Protein of unknown function (DUF229) contains similarity to Interpro domain IPR004245 (Protein of unknown function DUF229)
36osr-1C32E12.3n/achrI 5,201,845C. elegans OSR-1 protein ; contains similarity to Schizosaccharomyces pombe Uncharacterized protein C29E6.10c.; SW:Q09863
37D1014.5D1014.5n/achrV 8,125,176contains similarity to Pfam domain PF01697 Domain of unknown function contains similarity to Interpro domain IPR008166 (Protein of unknown function DUF23)
38C06A6.5C06A6.5n/achrIV 7,833,492contains similarity to Pfam domain PF00085 Thioredoxin contains similarity to Interpro domains IPR012336 (Thioredoxin-like fold), IPR012335 (Thioredoxin fold), IPR013766 (Thioredoxin domain), IPR006662 (Thioredoxin-related)
39col-111F29B9.9n/achrIV 4,656,697C. elegans COL-111 protein; contains similarity to Pfam domains PF01484 (Nematode cuticle collagen N-terminal domain) , PF01391 (Collagen triple helix repeat (20 copies)) (3)contains similarity to Interpro domains IPR002486 (Nematode cuticle collagen, N-terminal), IPR000694 (Proline-rich region), IPR008160 (Collagen triple helix repeat)
40H37A05.1H37A05.1n/achrV 13,652,199H37A05.1 encodes a putative phosphatidic acid phosphatase orthologous to budding yeast PAH1 and human LPIN1 (OMIM:605518), LPIN2 (OMIM:605519, mutated in Majeed syndrome), and LPIN3 (OMIM:605520); H37A05.1 is expressed in vulval muscle; in mass RNAi assays, H37A05.1 is required for the osmotic integrity of eggs and for normal larval growth, body thickness, locomotion, and fertility; by orthology, H37A05.1 is expected to be dephosphorylated by SCPL-2.
41C32D5.12C32D5.12n/achrII 6,357,672contains similarity to Pfam domains PF07993 (Male sterility protein) , PF01370 (NAD dependent epimerase/dehydratase family) , PF01073 (3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase family) contains similarity to Interpro domains IPR002225 (3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase), IPR001509 (NAD-dependent epimerase/dehydratase), IPR016040 (NAD(P)-binding), IPR013120 (Male sterility, NAD-binding)
42skr-9C52D10.7n/achrIV 17,163,837skr-9 encodes a homolog of Skp1 in S. cerevisiae, a component of the SCF (Skp1, Cullin, F-box) ubiquitin-ligase complex that regulates ubiquitin-mediated protein degradation; SKR-9 is required for posterior body morphogenesis, embryonic and larval development, and postembryonic cell proliferation.
43crn-5C14A4.5n/achrII 10,593,065C. elegans CRN-5 protein; contains similarity to Pfam domain PF01138 3' exoribonuclease family, domain 1 contains similarity to Interpro domain IPR001247 (Exoribonuclease, phosphorolytic domain 1)
44F52F10.2F52F10.2n/achrV 1,549,423contains similarity to Interpro domain IPR016196 (MFS general substrate transporter)
45F39H12.3F39H12.3n/achrX 839,898contains similarity to Pfam domains PF00612 (IQ calmodulin-binding motif) (3), PF02197 (Regulatory subunit of type II PKA R-subunit) contains similarity to Interpro domains IPR003117 (cAMP-dependent protein kinase, regulatory subunit, type I/II alpha/beta), IPR000048 (IQ calmodulin-binding region)
46C54D10.9C54D10.9n/achrV 12,448,057contains similarity to Interpro domain IPR001904 (Paxillin)
47C11D2.4C11D2.4n/achrIV 6,156,178contains similarity to Bos taurus Putative uncharacterized protein C9orf64.; TR:Q1JP73
48D1005.5D1005.5n/achrX 1,471,940
49F17B5.4F17B5.4n/achrI 13,200,152contains similarity to Pfam domain PF04590 Protein of unknown function, DUF595 contains similarity to Interpro domain IPR007669 (Protein of unknown function DUF595)
50T02G5.7T02G5.7n/achrII 7,076,340The T02G5.7 gene encodes a homolog of the human gene ACAT1, which when mutated leads to alpha-methylacetoaceticaciduria (OMIM:203750).