UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1C26E6.12C26E6.120chrIII 4,931,357contains similarity to Pfam domains PF01018 (GTP1/OBG) , PF01926 (GTPase of unknown function) contains similarity to Interpro domains IPR000795 (Protein synthesis factor, GTP-binding), IPR014100 (GTP-binding protein Obg/CgtA), IPR006169 (GTP1/OBG subdomain), IPR002917 (GTP-binding protein, HSR1-related), IPR006073 (GTP1/OBG)
2nhr-79T26H2.9n/achrV 19,209,750C. elegans NHR-79 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR001723 (Steroid hormone receptor), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
3K09D9.3K09D9.3n/achrV 4,020,029
4F19B10.4F19B10.4n/achrII 3,661,345contains similarity to Interpro domain IPR015425 (Actin-binding FH2)
5H36L18.1H36L18.1n/achrX 12,650,135contains similarity to Pfam domains PF00413 (Matrixin) , PF00045 (Hemopexin) (3)contains similarity to Interpro domains IPR000585 (Hemopexin), IPR006025 (Peptidase M, neutral zinc metallopeptidases, zinc-binding site), IPR006026 (Peptidase, metallopeptidases), IPR001818 (Peptidase M10A and M12B, matrixin and adamalysin)
6dsl-2W09G12.1n/achrIV 1,203,808dsl-2 encodes a putative transmembrane protein whose extracellular domain has single DSL and EGF domains in series, somewhat like Delta/LAG-2; DSL-2 belongs to a nematode-specific family of Delta/LAG-2-like proteins that includes DSL-1, -2, -3, -5, -6, and -7.
7F21D9.4F21D9.4n/achrV 19,255,280contains similarity to Interpro domain IPR016181 (Acyl-CoA N-acyltransferase)
8srsx-30C51E3.5n/achrV 10,159,536C. elegans SRSX-30 protein; contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
9F02D10.4F02D10.4n/achrX 13,458,404contains similarity to Emericella nidulans Anucleate primary sterigmata protein B.; SW:APSB_EMENI
10str-33C24B9.1n/achrV 2,729,388C. elegans STR-33 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
11F21A9.1F21A9.1n/achrI 3,712,645
12C44E4.2C44E4.2n/achrI 4,632,370contains similarity to Interpro domain IPR016024 (Armadillo-type fold)
13R10F2.4R10F2.4n/achrIII 2,921,110contains similarity to Interpro domain IPR001778 (Pollen allergen Poa pIX/Phl pVI, C-terminal)
14taf-1W04A8.7n/achrI 13,874,444The taf-1 gene encodes an ortholog of human TATA-binding protein associated factor TAF1L (TAFII250) that possesses histone acetyl transferase (HAT) activity and is a component of the TFIID general transcription factor that recognizes the transcription start site; TAF-1 is required for proper embryonic and larval development.
15Y116A8C.29Y116A8C.29n/achrIV 17,094,627contains similarity to Homo sapiens Class-I MHC-restricted T cell associated molecule; ENSEMBL:ENSP00000227348
16E01G6.2E01G6.2n/achrX 12,257,730contains similarity to Streptomyces coelicolor;Streptomyces lividans Putative secreted protein (Putative TWIN ARGININ translocationsreceptor).; TR:Q9RJ68
17asf-1F10G7.3n/achrII 4,702,628C. elegans ASF-1 protein; contains similarity to Pfam domain PF04729 Anti-silencing protein, ASF1-like contains similarity to Interpro domains IPR006818 (Anti-silencing protein, ASF1-like), IPR017282 (Histone deposition protein Asf1)
18R10D12.1R10D12.1n/achrV 13,933,592contains similarity to Pfam domain PF07690 Major Facilitator Superfamily contains similarity to Interpro domains IPR007114 (Major facilitator superfamily), IPR001958 (Tetracycline resistance protein, TetA), IPR011701 (Major facilitator superfamily MFS-1), IPR016196 (MFS general substrate transporter)
19T16A1.3T16A1.3n/achrII 2,084,511
20M153.2M153.2n/achrX 12,152,642contains similarity to Pfam domains PF07690 (Major Facilitator Superfamily) , PF05978 (Eukaryotic protein of unknown function (DUF895)) contains similarity to Interpro domains IPR010291 (Protein of unknown function DUF895, eukaryotic), IPR011701 (Major facilitator superfamily MFS-1), IPR016196 (MFS general substrate transporter)
21T04D1.2T04D1.2n/achrI 4,681,214This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; its encoded protein also contains a Pfam-B45 motif of presently unknown function.
22srx-96T01D3.4n/achrV 13,712,245C. elegans SRX-96 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
23col-147T06E4.4n/achrV 9,632,778C. elegans COL-147 protein; contains similarity to Pfam domains PF01484 (Nematode cuticle collagen N-terminal domain) , PF01391 (Collagen triple helix repeat (20 copies)) (3)contains similarity to Interpro domains IPR002486 (Nematode cuticle collagen, N-terminal), IPR000694 (Proline-rich region), IPR008160 (Collagen triple helix repeat)
24C44B12.3C44B12.3n/achrIV 1,105,091
25W02B8.2W02B8.2n/achrII 13,911,962contains similarity to Pfam domains PF00169 (PH domain) , PF00780 (CNH domain) , PF00130 (Phorbol esters/diacylglycerol binding domain (C1 domain)) contains similarity to Interpro domains IPR001849 (Pleckstrin-like), IPR011993 (Pleckstrin homology-type), IPR000533 (Tropomyosin), IPR001180 (Citron-like), IPR002219 (Protein kinase C, phorbol ester/diacylglycerol binding)
26Y75B8A.25Y75B8A.25n/achrIII 12,278,010contains similarity to Homo sapiens Golgi autoantigen, golgin subfamily B member 1; ENSEMBL:ENSP00000315938
27W02B3.6W02B3.6n/achrIII 690,542contains similarity to Pfam domain PF01744 GLTT repeat (6 copies) contains similarity to Interpro domain IPR008164 (Repeat of unknown function XGLTT)
28C49A1.10C49A1.10n/achrI 14,243,227contains similarity to Mus musculus Proteinase activated receptor 3 precursor (PAR-3) (Thrombin receptor-slike 2) (Coagulation factor II receptor-like 2).; SW:PAR3_MOUSE
29K06G5.3K06G5.3n/achrX 14,221,334contains similarity to Saccharomyces cerevisiae Required for invasion and pseudohyphae formation in response to nitrogen starvation; SGD:YIR019C
30rom-3Y116A8C.14n/achrIV 16,967,844C. elegans ROM-3 protein; contains similarity to Pfam domain PF01694 Rhomboid family contains similarity to Interpro domain IPR002610 (Peptidase S54, rhomboid)
31nhr-180F31F4.12n/achrV 666,725C. elegans NHR-180 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
32Y116A8C.23Y116A8C.23n/achrIV 17,054,490contains similarity to Interpro domain IPR000694 (Proline-rich region)
33K12H6.12K12H6.12n/achrII 2,810,497contains similarity to Interpro domain IPR015880 (Zinc finger, C2H2-like)
34fis-1F41G3.4n/achrII 6,755,453C. elegans FIS-1 protein; contains similarity to Interpro domains IPR016543 (Tetratricopeptide repeat 11 Fission 1 protein), IPR011990 (Tetratricopeptide-like helical)
35T02H6.8T02H6.8n/achrII 681,180
36T25D1.3T25D1.3n/achrX 16,506,246This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins.
37Y41E3.11Y41E3.11n/achrIV 15,045,860contains similarity to Pfam domain PF00622 SPRY domain contains similarity to Interpro domains IPR001870 (B302, (SPRY)-like), IPR000694 (Proline-rich region), IPR003877 (SPla/RYanodine receptor SPRY)
38F16G10.11F16G10.11n/achrII 2,392,784contains similarity to Pfam domain PF02343 Domain of unknown function DUF130 contains similarity to Interpro domain IPR003326 (Protein of unknown function DUF130)
39T13F2.9T13F2.9n/achrIV 9,768,468contains similarity to Interpro domain IPR003071 (Orphan nuclear receptor, HMR type)
40Y116A8B.5Y116A8B.5n/achrIV 17,228,490contains similarity to Pfam domain PF00001 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
41srsx-24C03G6.16n/achrV 7,378,672C. elegans SRSX-24 protein; contains similarity to Pfam domain PF00001 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
42str-149Y32B12B.5n/achrV 16,574,182C. elegans STR-149 protein ;
43F39G3.3F39G3.3n/achrV 4,732,719contains similarity to Homo sapiens Isoform 2 of Zinc finger CCCH domain-containing protein 13; ENSEMBL:ENSP00000282007
44nrd-1D1007.7n/achrI 4,600,304C. elegans NRD-1 protein; contains similarity to Pfam domain PF00076 RNA recognition motif. (a.k.a. RRM, RBD, or RNP domain) contains similarity to Interpro domains IPR006569 (Regulation of nuclear pre-mRNA protein), IPR000694 (Proline-rich region), IPR012677 (Nucleotide-binding, alpha-beta plait), IPR008942 (ENTH/VHS), IPR000504 (RNA recognition motif, RNP-1)
45srx-118T21B4.12n/achrII 12,526,763C. elegans SRX-118 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
46F40H6.5F40H6.5n/achrIII 6,052,328contains similarity to Pfam domains PF02795 (Domain of unknown function (DUF225)) , PF00337 (Galactoside-binding lectin) (3)contains similarity to Interpro domains IPR001079 (Galectin, galactose-binding lectin), IPR013320 (Concanavalin A-like lectin/glucanase, subgroup), IPR004024 (Protein of unknown function DUF225), IPR008985 (Concanavalin A-like lectin/glucanase)
47F53G12.4F53G12.4n/achrI 135,809
48Y49F6C.7Y49F6C.7n/achrII 3,367,722
49fbxa-199T06E6.3n/achrV 15,398,082srx-40 encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; this gene's encoded protein also contains an FTH/DUF38 motif, which may also mediate protein-protein interaction.
50F40G9.5F40G9.5n/achrIII 184,128