UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1abt-1C24F3.50chrIV 10,210,507abt-1 encodes a predicted ATP-binding cassette (ABC) transporter that is a member of the ABCA subfamily of transport proteins; ABT-1 is predicted to function as a transmembrane protein that couples energy to transport of various molecules across membranes, but as loss of abt-1 activity via RNAi results in no obvious defects, the precise role of abt-1 in C. elegans development and/or behavior is not yet known.
2Y106G6E.1Y106G6E.1n/achrI 10,199,352contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR008271 (Serine/threonine protein kinase, active site), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
3col-53M01A12.1n/achrI 5,645,857C. elegans COL-53 protein; contains similarity to Pfam domain PF01391 Collagen triple helix repeat (20 copies) contains similarity to Interpro domains IPR008161 (Collagen helix repeat), IPR008160 (Collagen triple helix repeat)
4Y106G6G.1Y106G6G.1n/achrI 10,329,688contains similarity to Plasmodium falciparum Hypothetical protein.; TR:Q8I4Z6
5M117.4M117.4n/achrIV 11,832,142contains similarity to Interpro domains IPR000694 (Proline-rich region), IPR003882 (Pistil-specific extensin-like protein)
6B0218.7B0218.7n/achrIV 8,165,316
7T19D12.5T19D12.5n/achrII 6,635,499contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR008271 (Serine/threonine protein kinase, active site), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
8Y45F10B.8Y45F10B.8n/achrIV 13,577,771contains similarity to Pfam domain PF00097 Zinc finger, C3HC4 type (RING finger) contains similarity to Interpro domains IPR001841 (Zinc finger, RING-type), IPR013083 (Zinc finger, RING/FYVE/PHD-type), IPR000533 (Tropomyosin)
9D2045.5D2045.5n/achrIII 10,468,691contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR008271 (Serine/threonine protein kinase, active site), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
10F20B6.1F20B6.1n/achrX 4,200,926contains similarity to Pfam domain PF00102 Protein-tyrosine phosphatase contains similarity to Interpro domains IPR003595 (Protein-tyrosine phosphatase, catalytic), IPR000242 (Protein-tyrosine phosphatase, receptor/non-receptor type), IPR000387 (Protein-tyrosine phosphatase)
11C36F7.5C36F7.5n/achrI 9,575,404contains similarity to Pfam domain PF03057 Protein of unknown function contains similarity to Interpro domains IPR004296 (Protein of unknown function DUF236), IPR003979 (Tropoelastin), IPR013286 (Annexin, type VII)
12K02B12.6K02B12.6n/achrI 8,519,194contains similarity to Schistosoma mansoni Putative eggshell protein (Fragment).; SW:P08016
13F53G12.8F53G12.8n/achrI 114,244contains similarity to Homo sapiens Putative uncharacterized protein (Fragment); ENSEMBL:ENSP00000333119
14C36H8.1C36H8.1n/achrIV 12,743,886contains similarity to Pfam domains PF03134 (TB2/DP1, HVA22 family) , PF00635 (MSP (Major sperm protein) domain) contains similarity to Interpro domains IPR008962 (PapD-like), IPR000694 (Proline-rich region), IPR000535 (Major sperm protein), IPR004345 (TB2/DP1 and HVA22 related protein)
15Y57G7A.5Y57G7A.5n/achrII 1,274,377
16ttr-9C33A12.15n/achrIV 9,505,947C. elegans TTR-9 protein; contains similarity to Pfam domain PF01060 Transthyretin-like family contains similarity to Interpro domain IPR001534 (Transthyretin-like)
17ent-3K02E11.1n/achrV 14,234,164C. elegans ENT-3 protein; contains similarity to Pfam domain PF01733 Nucleoside transporter contains similarity to Interpro domain IPR002259 (Delayed-early response protein/equilibrative nucleoside transporter)
18F26F2.1F26F2.1n/achrV 20,555,875contains similarity to Drosophila melanogaster Flybase gene name is CG2839-PA;; FLYBASE:CG2839
19C49C8.1C49C8.1n/achrIV 8,655,687contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
20F19C7.5F19C7.5n/achrIV 4,596,309
21kin-5T13H10.1n/achrIV 9,968,114kin-5 encodes a predicted protein tyrosine kinase that is most closely related to the non-receptor tyrosine kinases Fes/Fps and Fer that contain an SH2 domain and a tyrosine kinase domain (OMIM:190030, murine Fes appears to be required for hemopoietic homeostasis); as loss of kin-5 activity via large-scale RNAi screens does not result in any obvious abnormalities, the precise role of kin-5 in C. elegans development and/or behavior is not yet known.
22twk-6F17C8.5n/achrIII 4,743,772twk-6 encodes one of 44 C. elegans TWK (two-P domain K+) potassium channel subunits that contain two pore-forming domains and four transmembrane domains; as loss of TWK-6 function via RNA-mediated interference (RNAi) does not result in any abnormalities, the precise role of TWK-6 in C. elegans development and/or behavior is not yet known; TWK-6 may, however, function redundantly with other TWK channels; TWK-6 is expressed in the hypodermis.
23K07F5.6K07F5.6n/achrIV 9,845,791contains similarity to Pfam domain PF00102 Protein-tyrosine phosphatase contains similarity to Interpro domains IPR003595 (Protein-tyrosine phosphatase, catalytic), IPR000242 (Protein-tyrosine phosphatase, receptor/non-receptor type), IPR000387 (Protein-tyrosine phosphatase), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
24ZK892.5ZK892.5n/achrII 10,008,728contains similarity to Interpro domain IPR016196 (MFS general substrate transporter)
25C09H10.9C09H10.9n/achrII 11,105,179
26Y57G11C.6Y57G11C.6n/achrIV 14,759,618contains similarity to Pfam domain PF00102 Protein-tyrosine phosphatase contains similarity to Interpro domains IPR003595 (Protein-tyrosine phosphatase, catalytic), IPR000242 (Protein-tyrosine phosphatase, receptor/non-receptor type), IPR000387 (Protein-tyrosine phosphatase)
27C04E6.5C04E6.5n/achrV 5,903,504contains similarity to Pfam domain PF00443 Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase contains similarity to Interpro domain IPR001394 (Peptidase C19, ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 2)
28C08F8.4C08F8.4n/achrIV 11,158,277contains similarity to Pfam domain PF03062 MBOAT family contains similarity to Interpro domain IPR004299 (Membrane bound O-acyl transferase, MBOAT)
29ZK795.2ZK795.2n/achrIV 12,557,986contains similarity to Homo sapiens hypothetical protein; ENSEMBL:ENSP00000352916
30C55A6.3C55A6.3n/achrV 11,512,875contains similarity to Pfam domain PF00106 short chain dehydrogenase contains similarity to Interpro domains IPR003560 (2,3-dihydro-2,3-dihydroxybenzoate dehydrogenase), IPR002347 (Glucose/ribitol dehydrogenase), IPR002198 (Short-chain dehydrogenase/reductase SDR), IPR016040 (NAD(P)-binding)
31C28C12.1C28C12.1n/achrIV 8,502,192contains similarity to Interpro domain IPR002217 (Lipoprotein LPP20)
32C01B12.4C01B12.4n/achrII 7,948contains similarity to Interpro domain IPR005178 (Protein of unknown function DUF300)
33K05F1.8K05F1.8n/achrII 5,799,460
34F30F8.2F30F8.2n/achrI 7,829,032contains similarity to Pfam domains PF04960 (Glutaminase) , PF00023 (Ankyrin repeat) (3)contains similarity to Interpro domains IPR015868 (Glutaminase, core), IPR002110 (Ankyrin), IPR007043 (Glutaminase), IPR012338 (Beta-lactamase-type transpeptidase fold)
35F14E5.3F14E5.3n/achrII 8,436,197contains similarity to Pfam domain PF00328 Histidine acid phosphatase contains similarity to Interpro domain IPR000560 (Histidine acid phosphatase)
36ZC581.2ZC581.2n/achrI 6,656,611contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR008271 (Serine/threonine protein kinase, active site), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
37Y57G11B.3Y57G11B.3n/achrIV 14,572,262contains similarity to Pfam domain PF00042 Globin contains similarity to Interpro domains IPR012292 (Globin), IPR009050 (Globin-like), IPR013314 (Globin, lamprey/hagfish type), IPR000971 (Globin, subset)
38K09F6.4K09F6.4n/achrII 2,263,817contains similarity to Pfam domain PF02206 Domain of unknown function contains similarity to Interpro domain IPR003125 (Protein of unknown function WSN)
39B0457.4B0457.4n/achrII 8,911,392contains similarity to Bacteriophage phi-C31 Gp21.; TR:Q9ZX87
40F56F4.3F56F4.3n/achrI 6,142,912contains similarity to Pfam domain PF00209 Sodium:neurotransmitter symporter family contains similarity to Interpro domains IPR000175 (Sodium:neurotransmitter symporter), IPR001411 (Tetracycline resistance protein, TetB), IPR002208 (SecY protein), IPR002229 (Blood group Rhesus C/E and D polypeptide)
41bath-37K08E4.5n/achrIV 12,073,207C. elegans BATH-37 protein; contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)
42F26D2.10F26D2.10n/achrV 16,427,124contains similarity to Pfam domains PF02206 (Domain of unknown function) , PF00023 (Ankyrin repeat) , PF00533 (BRCA1 C Terminus (BRCT) domain) contains similarity to Interpro domains IPR002110 (Ankyrin), IPR003125 (Protein of unknown function WSN), IPR001357 (BRCT)
43R09B5.12R09B5.12n/achrV 1,455,855contains similarity to Interpro domains IPR011583 (Chitinase II), IPR017853 (Glycoside hydrolase, catalytic core)
44K07A1.4K07A1.4n/achrI 9,589,308contains similarity to Mycobacterium tuberculosis TcrZ protein (Fragment).; TR:Q50810
45W02A2.8W02A2.8n/achrIV 13,356,775
46C50D2.3C50D2.3n/achrII 106,848contains similarity to Pfam domain PF00595 PDZ domain (Also known as DHR or GLGF) contains similarity to Interpro domain IPR001478 (PDZ/DHR/GLGF)
47B0207.7B0207.7n/achrI 5,946,551contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core)
48Y38H6C.15Y38H6C.15n/achrV 20,530,900contains similarity to Interpro domain IPR006017 (Caldesmon)
49F01D4.3F01D4.3n/achrIV 10,474,640contains similarity to Pfam domains PF07714 (Protein tyrosine kinase) , PF00069 (Protein kinase domain) , PF00017 (SH2 domain) contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR005819 (Histone H5), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related), IPR000980 (SH2 motif), IPR008266 (Tyrosine protein kinase, active site), IPR001984 (Peptidase S16, Lon protease)
50B0511.11B0511.11n/achrI 10,649,379