UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1C11G6.2C11G6.25.999999999999999e-91chrX 16,329,525contains similarity to Interpro domain IPR003593 (AAA+ ATPase, core)
2rab-33F43D9.2n/achrIII 10,501,953C. elegans RAB-33 protein; contains similarity to Pfam domains PF00071 (Ras family) , PF08477 (Miro-like protein) contains similarity to Interpro domains IPR002041 (Ran GTPase), IPR003577 (Ras small GTPase, Ras type), IPR013684 (Miro-like), IPR003578 (Ras small GTPase, Rho type), IPR005225 (Small GTP-binding protein), IPR001806 (Ras GTPase), IPR003579 (Ras small GTPase, Rab type), IPR000694 (Proline-rich region), IPR006688 (ADP-ribosylation factor), IPR013753 (Ras)
3M01H9.1M01H9.1n/achrIV 4,487,922contains similarity to Pfam domain PF00085 Thioredoxin contains similarity to Interpro domains IPR012336 (Thioredoxin-like fold), IPR012335 (Thioredoxin fold), IPR013766 (Thioredoxin domain), IPR006662 (Thioredoxin-related)
4acbp-4F56C9.5n/achrIII 7,308,549acbp-4 encodes an Acyl-CoA-binding protein.
5T21H8.5T21H8.5n/achrX 13,878,684contains similarity to Interpro domain IPR000515 (Binding-protein-dependent transport systems inner membrane component)
6sre-49C50E10.9n/achrII 12,319,870C. elegans SRE-49 protein; contains similarity to Pfam domain PF03125 C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR004151 (C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor)
7T23F6.2T23F6.2n/achrIV 12,722,330
8F25H2.3F25H2.3n/achrI 10,548,642contains similarity to Interpro domain IPR002110 (Ankyrin)
9C09G9.3C09G9.3n/achrIV 8,871,534contains similarity to Pfam domain PF01681 C6 domain contains similarity to Interpro domain IPR002601 (Protein of unknown function C6)
10sru-19T04A11.8n/achrIV 12,499,445C. elegans SRU-19 protein; contains similarity to Pfam domain PF02688 Domain of unknown function DUF215 contains similarity to Interpro domain IPR003839 (Protein of unknown function DUF215)
11W02B8.1W02B8.1n/achrII 13,900,226
12C52D10.3C52D10.3n/achrIV 17,179,526contains similarity to Pelobacter propionicus DSM 2379 Hypothetical protein precursor.; TR:Q3FZT0
13str-71T23F1.4n/achrV 15,458,547C. elegans STR-71 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
14W04C9.6W04C9.6n/achrI 485,237contains similarity to Pfam domain PF07690 Major Facilitator Superfamily contains similarity to Interpro domains IPR000694 (Proline-rich region), IPR011701 (Major facilitator superfamily MFS-1), IPR016196 (MFS general substrate transporter)
15C05D9.4C05D9.4n/achrX 1,108,239
16C56E6.4C56E6.4n/achrII 6,527,652contains similarity to Pfam domain PF03607 Doublecortin contains similarity to Interpro domain IPR003533 (Doublecortin)
17W02D7.9W02D7.9n/achrV 8,326,331
18F02E9.1F02E9.1n/achrI 8,407,250F02E9.1 encodes a divergent ortholog of S. cerevisiae VMA22; like VMA22, F02E9.1 may be required for vacuolar proton-translocating ATPase (V-ATPase) assembly in the endoplasmic reticulum.
19his-4T10C6.11n/achrV 16,040,303his-4 encodes an H2B histone.
20K02F3.8K02F3.8n/achrIII 838,968
21T15B7.17T15B7.17n/achrV 6,814,434contains similarity to Pfam domain PF03385 Protein of unknown function, DUF288 contains similarity to Interpro domain IPR005049 (Protein of unknown function DUF288)
22B0302.4B0302.4n/achrX 17,176,549
23T05G5.5T05G5.5n/achrIII 9,750,414contains similarity to Pfam domain PF01121 Dephospho-CoA kinase contains similarity to Interpro domains IPR000764 (Uridine kinase), IPR001977 (Dephospho-CoA kinase)
24C54D2.1C54D2.1n/achrX 7,843,978contains similarity to Pfam domain PF01683 EB module contains similarity to Interpro domains IPR006149 (Nematode-specific EB region), IPR002557 (Chitin binding protein, peritrophin-A)
25srx-68K07C6.11n/achrV 3,913,635C. elegans SRX-68 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
26sru-4C33A12.10n/achrIV 9,498,965C. elegans SRU-4 protein; contains similarity to Pfam domain PF02688 Domain of unknown function DUF215 contains similarity to Interpro domain IPR003839 (Protein of unknown function DUF215)
27F14E5.1F14E5.1n/achrII 8,418,639contains similarity to Pfam domains PF07690 (Major Facilitator Superfamily) , PF00083 (Sugar (and other) transporter) contains similarity to Interpro domains IPR007114 (Major facilitator superfamily), IPR011701 (Major facilitator superfamily MFS-1), IPR005829 (Sugar transporter, conserved site), IPR005828 (General substrate transporter), IPR003663 (Sugar transporter), IPR002455 (GPCR, family 3, gamma-aminobutyric acid receptor, type B), IPR016196 (MFS general substrate transporter)
28R06B9.2R06B9.2n/achrII 13,767,269contains similarity to Pfam domain PF00339 Arrestin (or S-antigen), N-terminal domain contains similarity to Interpro domains IPR014756 (Immunoglobulin E-set), IPR011021 (Arrestin-like, N-terminal)
29R12B2.3R12B2.3n/achrIII 5,806,220
30C18G1.7C18G1.7n/achrV 4,746,815contains similarity to Pfam domain PF01697 Domain of unknown function contains similarity to Interpro domains IPR002455 (GPCR, family 3, gamma-aminobutyric acid receptor, type B), IPR008166 (Protein of unknown function DUF23)
31srv-8F53F1.7n/achrV 13,419,959C. elegans SRV-8 protein; contains similarity to Interpro domains IPR002456 (GPCR, family 3, gamma-aminobutyric acid receptor, type B1), IPR002455 (GPCR, family 3, gamma-aminobutyric acid receptor, type B)
32srh-136F36D3.6n/achrV 16,496,767C. elegans SRH-136 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
33str-246W09D6.3n/achrIII 11,078,457C. elegans STR-246 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
34brc-2T07E3.5n/achrIII 6,901,783brc-2 encodes a BRC domain-containing protein that is homologous to human BRCA2 which when mutated leads to early-onset breast cancer 2 or hereditary male breast cancer (OMIM:600185); in C. elegans, BRC-2 activity is essential for RAD-51-mediated repair of meiotic and radiation-induced double-strand breaks (DSBs); BRC-2 physically interacts with RAD-51 and single-stranded DNA and is required for proper localization of RAD-51 to sites of DNA damage and stabilization of RAD-51-DNA filaments; BRC-2 can also promote RAD-51-independent DSB repair via single-strand annealing (SSA) when the homologous recombination (HR) and nonhomologous end joining pathways (NHEJ) are compromised; in nonirradiated animals, BRC-2 is seen at diffuse, low levels in germline nuclei, but upon radiation treatment BRC-2 localizes to discrete foci that coincide with presumptive sites of DNA damage.
35srsx-27C51E3.2n/achrV 10,151,415C. elegans SRSX-27 protein; contains similarity to Pfam domain PF00001 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
36C54F6.3C54F6.3n/achrV 7,534,164contains similarity to Pfam domain PF04590 Protein of unknown function, DUF595 contains similarity to Interpro domain IPR007669 (Protein of unknown function DUF595)
37B0348.1B0348.1n/achrV 49,270contains similarity to Interpro domain IPR006629 (LPS-induced tumor necrosis factor alpha factor)
38srb-18C54F6.7n/achrV 7,516,266C. elegans SRB-18 protein; contains similarity to Pfam domain PF02117 C.elegans Sra family integral membrane protein contains similarity to Interpro domains IPR002184 (Serpentine beta receptor), IPR000344 (Nematode chemoreceptor, Sra)
39B0286.1B0286.1n/achrII 4,382,555contains similarity to Homo sapiens Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 8; ENSEMBL:ENSP00000302239
40srx-119F49C5.1n/achrII 12,528,893C. elegans SRX-119 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
41viln-1C10H11.1n/achrI 4,753,615C. elegans VILN-1 protein; contains similarity to Pfam domain PF02209 Villin headpiece domain contains similarity to Interpro domains IPR007122 (Gelsolin), IPR003128 (Villin headpiece)
42R107.2R107.2n/achrIII 9,044,850contains similarity to Pfam domain PF01256 Carbohydrate kinase contains similarity to Interpro domain IPR000631 (Carbohydrate kinase)
43M03D4.3M03D4.3n/achrIV 6,111,524
44C33E10.8C33E10.8n/achrX 17,293,743This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins.
45apc-11F35G12.9n/achrIII 4,594,070apc-11 encodes a predicted key catalytic subunit of the anaphase promoting complex that is required for embryonic development past the embryonic one- cell stage.
46M02B1.2M02B1.2n/achrIV 12,846,951contains similarity to Melanoplus sanguinipes entomopoxvirus ORF MSV233 hypothetical protein.; TR:Q9YVK8
47F15D3.7F15D3.7n/achrI 11,579,107contains similarity to Pfam domain PF02466 Tim17/Tim22/Tim23 family contains similarity to Interpro domain IPR003397 (Mitochondrial import inner membrane translocase, subunit Tim17/22)
48srj-44T03D3.11n/achrV 2,845,216C. elegans SRJ-44 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
49K06H6.4K06H6.4n/achrV 580,280contains similarity to Pfam domain PF01697 Domain of unknown function contains similarity to Interpro domain IPR008166 (Protein of unknown function DUF23)
50F48C1.3F48C1.3n/achrI 5,314,472