UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1str-247B0213.90chrV 3,954,734C. elegans STR-247 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
2T26E4.5T26E4.5n/achrV 15,787,827contains similarity to Interpro domain IPR008996 ()
3F47C12.1F47C12.1n/achrIV 4,001,937contains similarity to Pfam domains PF00008 (EGF-like domain) (4), PF00754 (F5/8 type C domain) , PF07645 (Calcium binding EGF domain) (2), PF07699 (GCC2 and GCC3) (3), PF00431 (CUB domain) , PF07974 (EGF-like domain) , PF02494 (HYR domain) (2), PF00084 (Sushi domain (SCR repeat)) (6)contains similarity to Interpro domains IPR001438 (EGF-like, type 2), IPR000742 (EGF-like, type 3), IPR003410 (Hyalin), IPR000436 (Sushi/SCR/CCP), IPR006209 (EGF-like), IPR000152 (Aspartic acid and asparagine hydroxylation site), IPR006210 (EGF), IPR002049 (EGF-like, laminin), IPR008979 (Galactose-binding like), IPR000859 (CUB), IPR011641 (GCC2 and GCC3), IPR001881 (EGF-like calcium-binding), IPR016060 (Complement control module), IPR009030 (Growth factor, receptor), IPR013032 (EGF-like region, conserved site), IPR000421 (Coagulation factor 5/8 type, C-terminal), IPR013111 (EGF, extracellular), IPR013091 (EGF calcium-binding)
4str-177T18H9.42.9999999999999998e-36chrV 9,198,343C. elegans STR-177 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
5F28H7.8F28H7.8n/achrV 10,759,739contains similarity to Pfam domains PF01105 (emp24/gp25L/p24 family/GOLD) , PF00650 (CRAL/TRIO domain) contains similarity to Interpro domains IPR001071 (Cellular retinaldehyde binding/alpha-tocopherol transport), IPR001251 (Cellular retinaldehyde-binding/triple function, C-terminal), IPR011074 (Phosphatidylinositol transfer protein-like, N-terminal), IPR000348 (emp24/gp25L/p24)
6T08E11.8T08E11.8n/achrII 1,834,708contains similarity to Pfam domain PF01827 FTH domain contains similarity to Interpro domain IPR002900 (Protein of unknown function DUF38, Caenorhabditis species)
7F55F10.1F55F10.1n/achrIV 4,373,684contains similarity to Pfam domains PF07726 (ATPase family associated with various cellular activities (AAA)) , PF00092 (von Willebrand factor type A domain) , PF07728 (ATPase family associated with various cellular activities (AAA)) (5)contains similarity to Interpro domains IPR011704 (ATPase associated with various cellular activities, AAA-5), IPR011703 (ATPase associated with various cellular activities, AAA-3), IPR012099 (Midasin), IPR003593 (AAA+ ATPase, core), IPR002078 (RNA polymerase sigma factor 54, interaction), IPR002035 (von Willebrand factor, type A)
8ZK892.3ZK892.3n/achrII 10,002,830contains similarity to Pfam domains PF07690 (Major Facilitator Superfamily) , PF00083 (Sugar (and other) transporter) contains similarity to Interpro domains IPR007114 (Major facilitator superfamily), IPR011701 (Major facilitator superfamily MFS-1), IPR005829 (Sugar transporter, conserved site), IPR005828 (General substrate transporter), IPR016196 (MFS general substrate transporter)
9ZC482.3ZC482.3n/achrIII 12,762,606contains similarity to Pfam domain PF01030 Receptor L domain contains similarity to Interpro domain IPR000494 (EGF receptor, L domain)
10B0554.4B0554.4n/achrV 432,094contains similarity to Pfam domain PF02795 Domain of unknown function (DUF225) contains similarity to Interpro domain IPR004024 (Protein of unknown function DUF225)
11R102.6R102.6n/achrIV 10,699,884contains similarity to Interpro domains IPR000694 (Proline-rich region), IPR000976 (Wilm's tumour protein)
12T11F9.7T11F9.7n/achrV 11,476,386contains similarity to Interpro domain IPR008880 (Trigger factor, C-terminal, bacterial)
13srd-63F13A7.2n/achrV 16,393,128C. elegans SRD-63 protein ;
14F31F4.17F31F4.17n/achrV 659,395
15srh-41Y54G11A.12n/achrII 14,286,480C. elegans SRH-41 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR000264 (Serum albumin), IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
16srx-35T01C4.5n/achrV 7,121,587C. elegans SRX-35 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR002651 (Protein of unknown function DUF32), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
17srh-111F08E10.6n/achrV 17,484,578C. elegans SRH-111 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
18C01F1.6C01F1.6n/achrII 4,285,393contains similarity to Pfam domain PF00023 Ankyrin repeat contains similarity to Interpro domain IPR002110 (Ankyrin)
19srh-200F07C4.13n/achrV 7,652,983C. elegans SRH-200 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
20clec-188M199.3n/achrIV 15,117,866C. elegans CLEC-188 protein; contains similarity to Pfam domain PF08277 PAN-like domain contains similarity to Interpro domains IPR006583 (CW), IPR016187 (C-type lectin fold), IPR001304 (C-type lectin)
21nhr-32K08H2.8n/achrX 13,254,014C. elegans NHR-32 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR001723 (Steroid hormone receptor), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
22ZK550.2ZK550.2n/achrIV 17,247,626contains similarity to Pfam domain PF07690 Major Facilitator Superfamily contains similarity to Interpro domains IPR007114 (Major facilitator superfamily), IPR011701 (Major facilitator superfamily MFS-1), IPR016196 (MFS general substrate transporter)
23F21D9.1F21D9.1n/achrV 19,267,093This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins.
24cyp-33E3F42A9.4n/achrIV 8,615,428C. elegans CYP-33E3 protein; contains similarity to Pfam domain PF00067 Cytochrome P450 contains similarity to Interpro domains IPR001128 (Cytochrome P450), IPR002401 (Cytochrome P450, E-class, group I)
25srz-15C32H11.2n/achrIV 12,916,637C. elegans SRZ-15 protein ;
26C36B7.1C36B7.1n/achrX 7,113,827contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR008271 (Serine/threonine protein kinase, active site), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
27W09G12.9W09G12.9n/achrIV 1,217,448
28F45G2.10F45G2.10n/achrIII 13,438,200contains similarity to Pfam domain PF01883 Domain of unknown function DUF59 contains similarity to Interpro domain IPR002744 (Protein of unknown function DUF59)
29D2085.4D2085.4n/achrII 8,667,037contains similarity to Pfam domains PF00612 (IQ calmodulin-binding motif) , PF00632 (HECT-domain (ubiquitin-transferase)) contains similarity to Interpro domains IPR000569 (HECT), IPR000048 (IQ calmodulin-binding region)
30nhr-227T27B7.5n/achrV 2,286,399C. elegans NHR-227 protein; contains similarity to Pfam domain PF00105 Zinc finger, C4 type (two domains) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
31sre-12T07H8.7n/achrV 6,978,417C. elegans SRE-12 protein; contains similarity to Pfam domain PF03125 C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR004151 (C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor), IPR001680 (WD40 repeat)
32K08B5.2K08B5.2n/achrX 16,552,470
33ZK632.3ZK632.3n/achrIII 9,803,610contains similarity to Pfam domain PF01163 RIO1 family contains similarity to Interpro domains IPR000687 (RIO kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR017406 (Serine/threonine-protein kinase Rio3)
34str-260T24A6.61e-40chrV 3,528,795C. elegans STR-260 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
35str-101Y6E2A.23.9999999999999996e-26chrV 15,711,366C. elegans STR-101 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
36F46F5.8F46F5.8n/achrII 821,517
37ptc-2F21H12.4n/achrII 6,084,701ptc-2 encodes an ortholog of Drosophila PATCHED (PTC) and human PTCH (OMIM:601309, mutated in basal cell nevus syndrome), which defines one of seven paralogous families of sterol sensing domain (SSD) proteins; PTC-2 is required for normal fat storage; PTC-2 is also required for normal egg osmotic integrity, locomotion, egg laying, and viability in mass RNAi assays.
38str-68Y73C8C.60.00000000000003chrV 3,106,888C. elegans STR-68 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
39srh-186F36G9.2n/achrV 15,956,387C. elegans SRH-186 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
40srw-134T05B4.7n/achrV 4,111,591C. elegans SRW-134 protein; contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)
41ugt-37F10D2.6n/achrV 7,143,012C. elegans UGT-37 protein; contains similarity to Pfam domain PF00201 UDP-glucoronosyl and UDP-glucosyl transferase contains similarity to Interpro domain IPR002213 (UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase)
42W04G5.9W04G5.9n/achrI 11,644,012contains similarity to Pfam domain PF04721 Domain of unknown function (DUF750) contains similarity to Interpro domain IPR006588 (Protein of unknown function PAW)
43T26C11.2T26C11.2n/achrX 1,836,847contains similarity to Interpro domains IPR000893 (Luteovirus ORF6 protein), IPR000694 (Proline-rich region), IPR000480 (Glutelin)
44ZC395.4ZC395.4n/achrIII 5,270,595contains similarity to Homo sapiens Putative uncharacterized protein (Fragment); ENSEMBL:ENSP00000333119
45F58F6.6F58F6.6n/achrIV 1,342,037contains similarity to Pfam domain PF04789 Protein of unknown function (DUF621) contains similarity to Interpro domain IPR006874 (Protein of unknown function DUF621)
46C41C4.3C41C4.3n/achrII 8,110,504contains similarity to Pfam domain PF00560 Leucine Rich Repeat contains similarity to Interpro domains IPR001611 (Leucine-rich repeat), IPR003591 (Leucine-rich repeat, typical subtype)
47T05B4.4T05B4.4n/achrV 4,128,560
48moc-2W01A11.6n/achrV 6,503,257C. elegans MOC-2 protein; contains similarity to Pfam domain PF00994 Probable molybdopterin binding domain contains similarity to Interpro domains IPR008284 (Molybdenum cofactor biosynthesis, conserved site), IPR001453 (Molybdopterin binding)
49nspb-5F38A5.9n/achrIV 6,599,329C. elegans NSPB-5 protein; contains similarity to Pfam domain PF07312 Protein of unknown function (DUF1459) contains similarity to Interpro domain IPR009924 (Protein of unknown function DUF1459)
50lgc-23C15A7.1n/achrX 12,066,273C. elegans LGC-23 protein; contains similarity to Pfam domain PF02931 Neurotransmitter-gated ion-channel ligand binding domain contains similarity to Interpro domains IPR006201 (Neurotransmitter-gated ion-channel), IPR006202 (Neurotransmitter-gated ion-channel ligand-binding)