Affine Alignment
 
Alignment between Y39A1A.17 (top Y39A1A.17 385aa) and Y39A1A.17 (bottom Y39A1A.17 385aa) score 37639

001 METIKVLRKQELRSFVVGCEENTNQYTEKNEIDIISVLRKGLNNRSQQKLLHLGLNGQLI 060
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
001 METIKVLRKQELRSFVVGCEENTNQYTEKNEIDIISVLRKGLNNRSQQKLLHLGLNGQLI 060

061 LRRDWINKLNNMLPSLRSFDMSNSQLDAKDFFRLCKNFPNLEFLDIRETGLSTISGLNRL 120
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
061 LRRDWINKLNNMLPSLRSFDMSNSQLDAKDFFRLCKNFPNLEFLDIRETGLSTISGLNRL 120

121 QNLQILKMQNMEFHNHFDIIDLFGLTKLKILDVSCNRYLKKRNIIKLYIECDMVLPELQL 180
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
121 QNLQILKMQNMEFHNHFDIIDLFGLTKLKILDVSCNRYLKKRNIIKLYIECDMVLPELQL 180

181 LDCSMTDFVYFIFEVFQNFNSSKTLEVGLVGTIIEYIDKFDDEQAQIAMLHSLGALAELE 240
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
181 LDCSMTDFVYFIFEVFQNFNSSKTLEVGLVGTIIEYIDKFDDEQAQIAMLHSLGALAELE 240

241 KFDSLRDFFTEANFSAIENMLNRWNDNRGNVVLSILVHLLNCLETVNPLHEKLWKSSNNV 300
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
241 KFDSLRDFFTEANFSAIENMLNRWNDNRGNVVLSILVHLLNCLETVNPLHEKLWKSSNNV 300

301 ILEFLLNHSITANTLHLGKTKHVLKTSKGSGQIFWALLTIKNVYPESEEFRRDIQESEIL 360
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
301 ILEFLLNHSITANTLHLGKTKHVLKTSKGSGQIFWALLTIKNVYPESEEFRRDIQESEIL 360

361 HHIRSVQCDSMDVMLLKKEVINLFN 385
    |||||||||||||||||||||||||
361 HHIRSVQCDSMDVMLLKKEVINLFN 385