Affine Alignment
  
Alignment between ttr-29 (top R90.4 117aa) and ttr-29 (bottom R90.4 117aa) score 11685

001 MQAVAVSGRLICNGRPATNIKIKLYENEILFDRLMEESRTDSNGQFRVSGSKREISRIDP 060
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
001 MQAVAVSGRLICNGRPATNIKIKLYENEILFDRLMEESRTDSNGQFRVSGSKREISRIDP 060

061 KVNVYHKCNYNGLCSKKFTIKIPKDYINRGSQAERTYDIGTLNLANKYPGESTDCIN 117
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
061 KVNVYHKCNYNGLCSKKFTIKIPKDYINRGSQAERTYDIGTLNLANKYPGESTDCIN 117