Affine Alignment
 
Alignment between R11E3.1 (top R11E3.1 549aa) and R11E3.1 (bottom R11E3.1 549aa) score 53675

001 MSDSEVGEIIKKKSIRETTTDETQERRPDLTTASEEKGSEKKDEKGSDRKDESATSKSVY 060
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
001 MSDSEVGEIIKKKSIRETTTDETQERRPDLTTASEEKGSEKKDEKGSDRKDESATSKSVY 060

061 VEKDVVEDEELYKSLQAMPFYHGFLPRDDLGVIIRNEGDYLIRVSEITTKKEGTTGIKRD 120
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
061 VEKDVVEDEELYKSLQAMPFYHGFLPRDDLGVIIRNEGDYLIRVSEITTKKEGTTGIKRD 120

121 IILSVCSSERGGTETEQTNTKSDAKSELNLGERKMRNMVIRRFDGKFGIKGNLFPTIEAL 180
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
121 IILSVCSSERGGTETEQTNTKSDAKSELNLGERKMRNMVIRRFDGKFGIKGNLFPTIEAL 180

181 LANYHVTNALETKENRFLKTPIDLQVWENRHSAVKLGDKLGEGAYGEVRKGVLHRKNKKL 240
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
181 LANYHVTNALETKENRFLKTPIDLQVWENRHSAVKLGDKLGEGAYGEVRKGVLHRKNKKL 240

241 DVAVKLMKGGELNKMKIREMMNEARLMRNFKHKNIVRFFGVAVVEQPLYILLELVNGGAL 300
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
241 DVAVKLMKGGELNKMKIREMMNEARLMRNFKHKNIVRFFGVAVVEQPLYILLELVNGGAL 300

301 NTYLQKNKVSDLELMRMCLGAAQGLQYLHANHCIHRDIAARNCLYSNDKVVKLSDFGLSV 360
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
301 NTYLQKNKVSDLELMRMCLGAAQGLQYLHANHCIHRDIAARNCLYSNDKVVKLSDFGLSV 360

361 VGNQYKLCAAQKLPIKWLAPETITTRFFTPKTDVYSYGVMCFEIFSNGAEPWEGVTNTVT 420
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
361 VGNQYKLCAAQKLPIKWLAPETITTRFFTPKTDVYSYGVMCFEIFSNGAEPWEGVTNTVT 420

421 KNNVVNGINLVIPESCPEKFRSFVHEKIFVVDPKRRVVMDDVSRFIEPIINDMHNAAAVS 480
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
421 KNNVVNGINLVIPESCPEKFRSFVHEKIFVVDPKRRVVMDDVSRFIEPIINDMHNAAAVS 480

481 TMLNLASDKSDYNQKTSDANRSMMVPNLTSSTPRNATNSMKQNDYRRKTRTSPNTGQRAG 540
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
481 TMLNLASDKSDYNQKTSDANRSMMVPNLTSSTPRNATNSMKQNDYRRKTRTSPNTGQRAG 540

541 KKSSQTVEK 549
    |||||||||
541 KKSSQTVEK 549