Affine Alignment
 
Alignment between hch-1 (top F40E10.1 605aa) and hch-1 (bottom F40E10.1 605aa) score 61883

001 MVSYWPVLIVLCLLPICHAKSYFADFVNGKGPFKQADALKFMDKMTILNKLQADILGIPQ 060
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
001 MVSYWPVLIVLCLLPICHAKSYFADFVNGKGPFKQADALKFMDKMTILNKLQADILGIPQ 060

061 PDEFSALDFEDKIESKPDEIPYLFEGDMVLTDEQMDLIIKNVRDQYWARKSSTNEFLYAI 120
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
061 PDEFSALDFEDKIESKPDEIPYLFEGDMVLTDEQMDLIIKNVRDQYWARKSSTNEFLYAI 120

121 RGKRSMTSFLSERWSFPVPYYIDTSSGVNTNAVLAGVAKWEQETCARFTRLNSYSSSSRQ 180
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
121 RGKRSMTSFLSERWSFPVPYYIDTSSGVNTNAVLAGVAKWEQETCARFTRLNSYSSSSRQ 180

181 NALRFISGNGCYSNIGKVSRFPQDVSIGWGCTSLGTVCHEIGHALGFYHEQARYDRDDYV 240
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
181 NALRFISGNGCYSNIGKVSRFPQDVSIGWGCTSLGTVCHEIGHALGFYHEQARYDRDDYV 240

241 SILTQNIQDMYLSQFTKQSASSMVDYGVGYDYGSVMHYDQAAFSSTGGNTIATRDPNFQA 300
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
241 SILTQNIQDMYLSQFTKQSASSMVDYGVGYDYGSVMHYDQAAFSSTGGNTIATRDPNFQA 300

301 TIGQRVAPSFADVKRINFAYCNSTCSNYLDCQNGGYINPNDCNNCKCPPGFGGQLCDVAG 360
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
301 TIGQRVAPSFADVKRINFAYCNSTCSNYLDCQNGGYINPNDCNNCKCPPGFGGQLCDVAG 360

361 TNSNGCGAGDITATSSIQTISASGALTCNYVIKAPVGAKVYFQMTAATFSRYSPCTTNYL 420
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
361 TNSNGCGAGDITATSSIQTISASGALTCNYVIKAPVGAKVYFQMTAATFSRYSPCTTNYL 420

421 EINYGRDFSRVGARFCASYPTISLSETNTLVVIYKGVNGARFSLNYRYDPVTFSTSAPTT 480
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
421 EINYGRDFSRVGARFCASYPTISLSETNTLVVIYKGVNGARFSLNYRYDPVTFSTSAPTT 480

481 TSTTTTTAPITVPTVSPTTTTTRQTTTTARTSTTTTTTQAPPTTTTSTSQCASWSACSAQ 540
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
481 TSTTTTTAPITVPTVSPTTTTTRQTTTTARTSTTTTTTQAPPTTTTSTSQCASWSACSAQ 540

541 CGGCGTQSRRCGTYVETVYCNTNPCTGGYCCRPFFYVTSFGTGYCRRPGADTPAAPQRYV 600
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
541 CGGCGTQSRRCGTYVETVYCNTNPCTGGYCCRPFFYVTSFGTGYCRRPGADTPAAPQRYV 600

601 EQRKG 605
    |||||
601 EQRKG 605