Affine Alignment
 
Alignment between ama-1 (top F36A4.7 1852aa) and ama-1 (bottom F36A4.7 1852aa) score 185459

0001 MALVGVDFQAPLRIVSRVQFGILGPEEIKRMSVAHVEFPEVYENGKPKLGGLMDPRQGVI 0060
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0001 MALVGVDFQAPLRIVSRVQFGILGPEEIKRMSVAHVEFPEVYENGKPKLGGLMDPRQGVI 0060

0061 DRRGRCMTCAGNLTDCPGHFGHLELAKPVFHIGFLTKTLKILRCVCFYCGRLLIDKSAPR 0120
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0061 DRRGRCMTCAGNLTDCPGHFGHLELAKPVFHIGFLTKTLKILRCVCFYCGRLLIDKSAPR 0120

0121 VLEILKKTGTNSKKRLTMIYDLCKAKSVCEGAAEKEEGMPDDPDDPMNDGKKVAGGCGRY 0180
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0121 VLEILKKTGTNSKKRLTMIYDLCKAKSVCEGAAEKEEGMPDDPDDPMNDGKKVAGGCGRY 0180

0181 QPSYRRVGIDINAEWKKNVNEDTQERKIMLTAERVLEVFQQITDEDILVIGMDPQFARPE 0240
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0181 QPSYRRVGIDINAEWKKNVNEDTQERKIMLTAERVLEVFQQITDEDILVIGMDPQFARPE 0240

0241 WMICTVLPVPPLAVRPAVVTFGSAKNQDDLTHKLSDIIKTNQQLQRNEANGAAAHVLTDD 0300
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0241 WMICTVLPVPPLAVRPAVVTFGSAKNQDDLTHKLSDIIKTNQQLQRNEANGAAAHVLTDD 0300

0301 VRLLQFHVATLVDNCIPGLPTATQKGGRPLKSIKQRLKGKEGRIRGNLMGKRVDFSARTV 0360
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0301 VRLLQFHVATLVDNCIPGLPTATQKGGRPLKSIKQRLKGKEGRIRGNLMGKRVDFSARTV 0360

0361 ITADPNLPIDTVGVPRTIAQNLTFPEIVTPFNVDKLQELVNRGDTQYPGAKENGARVDLR 0420
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0361 ITADPNLPIDTVGVPRTIAQNLTFPEIVTPFNVDKLQELVNRGDTQYPGAKENGARVDLR 0420

0421 YHPRAADLHLQPGYRVERHMKDGDIIVFNRQPTLHKMSMMGHRVKILPWSTFRMNLSVTS 0480
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0421 YHPRAADLHLQPGYRVERHMKDGDIIVFNRQPTLHKMSMMGHRVKILPWSTFRMNLSVTS 0480

0481 PYNADFDGDEMNLHLPQSLETRAEIEEIAMVPRQLITPQANKPVMGIVQDTLCAVRMMTK 0540
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0481 PYNADFDGDEMNLHLPQSLETRAEIEEIAMVPRQLITPQANKPVMGIVQDTLCAVRMMTK 0540

0541 RDVFIDWPFMMDLLMYLPTWDGKVPQPAILKPKPLWTGKQVFSLIIPGNVNVLRTHSTHP 0600
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0541 RDVFIDWPFMMDLLMYLPTWDGKVPQPAILKPKPLWTGKQVFSLIIPGNVNVLRTHSTHP 0600

0601 DSEDSGPYKWISPGDTKVIIEHGELLSGIVCSKTVGKSAGNLLHVVTLELGYEIAANFYS 0660
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0601 DSEDSGPYKWISPGDTKVIIEHGELLSGIVCSKTVGKSAGNLLHVVTLELGYEIAANFYS 0660

0661 HIQTVINAWLIREGHTIGIGDTIADQATYLDIQNTIRKAKQDVVDVIEKAHNDDLEPTPG 0720
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0661 HIQTVINAWLIREGHTIGIGDTIADQATYLDIQNTIRKAKQDVVDVIEKAHNDDLEPTPG 0720

0721 NTLRQTFENKVNQILNDARDRTGSSAQKSLSEFNNFKSMVVSGSKGSKINISQVIACVGQ 0780
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0721 NTLRQTFENKVNQILNDARDRTGSSAQKSLSEFNNFKSMVVSGSKGSKINISQVIACVGQ 0780

0781 QNVEGKRIPFGFRHRTLPHFIKDDYGPESKGFVENSYLAGLTPSEFFFHAMGGREGLIDT 0840
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0781 QNVEGKRIPFGFRHRTLPHFIKDDYGPESKGFVENSYLAGLTPSEFFFHAMGGREGLIDT 0840

0841 AVKTAETGYIQRRLIKAMESVMVNYDGTVRNSLAQMVQLRYGEDGLDGMWVENQNMPTMK 0900
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0841 AVKTAETGYIQRRLIKAMESVMVNYDGTVRNSLAQMVQLRYGEDGLDGMWVENQNMPTMK 0900

0901 PNNAVFERDFRMDLTDNKFLRKNYSEDVVREIQESEDGISLVESEWSQLEEDRRLLRKIF 0960
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0901 PNNAVFERDFRMDLTDNKFLRKNYSEDVVREIQESEDGISLVESEWSQLEEDRRLLRKIF 0960

0961 PRGDAKIVLPCNLQRLIWNAQKIFKVDLRKPVNLSPLHVISGVRELSKKLIIVSGNDEIS 1020
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0961 PRGDAKIVLPCNLQRLIWNAQKIFKVDLRKPVNLSPLHVISGVRELSKKLIIVSGNDEIS 1020

1021 KQAQYNATLLMNILLRSTLCTKNMCTKSKLNSEAFDWLLGEIESRFQQAIAQPGEMVGAL 1080
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1021 KQAQYNATLLMNILLRSTLCTKNMCTKSKLNSEAFDWLLGEIESRFQQAIAQPGEMVGAL 1080

1081 AAQSLGEPATQMTLNTFHYAGVSAKNVTLGVPRLKEIINVSKTLKTPSLTVFLTGAAAKD 1140
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1081 AAQSLGEPATQMTLNTFHYAGVSAKNVTLGVPRLKEIINVSKTLKTPSLTVFLTGAAAKD 1140

1141 PEKAKDVLCKLEHTTLKKVTCNTAIYYDPDPKNTVIAEDEEWVSIFYEMPDHDLSRTSPW 1200
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1141 PEKAKDVLCKLEHTTLKKVTCNTAIYYDPDPKNTVIAEDEEWVSIFYEMPDHDLSRTSPW 1200

1201 LLRIELDRKRMVDKKLTMEMIADRIHGGFGNDVHTIYTDDNAEKLVFRLRIAGEDKGEAQ 1260
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1201 LLRIELDRKRMVDKKLTMEMIADRIHGGFGNDVHTIYTDDNAEKLVFRLRIAGEDKGEAQ 1260

1261 EEQVDKMEDDVFLRCIEANMLSDLTLQGIPAISKVYMNQPNTDDKKRIIITPEGGFKSVA 1320
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1261 EEQVDKMEDDVFLRCIEANMLSDLTLQGIPAISKVYMNQPNTDDKKRIIITPEGGFKSVA 1320

1321 DWILETDGTALLRVLSERQIDPVRTTSNDICEIFEVLGIEAVRKAIEREMDNVISFDGSY 1380
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1321 DWILETDGTALLRVLSERQIDPVRTTSNDICEIFEVLGIEAVRKAIEREMDNVISFDGSY 1380

1381 VNYRHLALLCDVMTAKGHLMAITRHGINRQEVGALMRCSFEETVDILMEAAVHAEEDPVK 1440
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1381 VNYRHLALLCDVMTAKGHLMAITRHGINRQEVGALMRCSFEETVDILMEAAVHAEEDPVK 1440

1441 GVSENIMLGQLARCGTGCFDLVLDVEKCKYGMEIPQNVVMGGGFYGSFAGSPSNREFSPA 1500
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1441 GVSENIMLGQLARCGTGCFDLVLDVEKCKYGMEIPQNVVMGGGFYGSFAGSPSNREFSPA 1500

1501 HSPWNSGVTPTYAGAAWSPTTGGMSPGAGFSPAGNTDGGASPFNEGGWSPASPGDPLGAL 1560
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1501 HSPWNSGVTPTYAGAAWSPTTGGMSPGAGFSPAGNTDGGASPFNEGGWSPASPGDPLGAL 1560

1561 SPRTPSYGGMSPGVYSPSSPQFSMTSPHYSPTSPSYSPTSPAAGQSPVSPSYSPTSPSYS 1620
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1561 SPRTPSYGGMSPGVYSPSSPQFSMTSPHYSPTSPSYSPTSPAAGQSPVSPSYSPTSPSYS 1620

1621 PTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPSSPSYSPSSPSYSPSSPRYSPTSP 1680
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1621 PTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPSSPSYSPSSPSYSPSSPRYSPTSP 1680

1681 TYSPTSPTYSPTSPTYSPTSPTYSPTSPSYESGGGYSPSSPKYSPSSPTYSPTSPSYSPT 1740
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1681 TYSPTSPTYSPTSPTYSPTSPTYSPTSPSYESGGGYSPSSPKYSPSSPTYSPTSPSYSPT 1740

1741 SPQYSPTSPQYSPSSPTYTPSSPTYNPTSPRGFSSPQYSPTSPTYSPTSPSYTPSSPQYS 1800
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1741 SPQYSPTSPQYSPSSPTYTPSSPTYNPTSPRGFSSPQYSPTSPTYSPTSPSYTPSSPQYS 1800

1801 PTSPTYTPSPSEQPGTSAQYSPTSPTYSPSSPTYSPASPSYSPSSPTYDPNS 1852
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1801 PTSPTYTPSPSEQPGTSAQYSPTSPTYSPSSPTYSPASPSYSPSSPTYDPNS 1852