Affine Alignment
 
Alignment between rfc-4 (top F31E3.3 334aa) and rfc-4 (bottom F31E3.3 334aa) score 32471

001 MEEPMEVDNKRPKVLTWTEKYRPKTLDDIAYQDEVVTMLKGALQGRDLPHLLFYGPPGTG 060
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
001 MEEPMEVDNKRPKVLTWTEKYRPKTLDDIAYQDEVVTMLKGALQGRDLPHLLFYGPPGTG 060

061 KTSAALAFCRQLFPKNIFHDRVLDLNASDERGIAVVRQKIQSFSKSSLGHSHREDVLKLK 120
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
061 KTSAALAFCRQLFPKNIFHDRVLDLNASDERGIAVVRQKIQSFSKSSLGHSHREDVLKLK 120

121 IIILDEVDAMTREAQAAMRRVIEDFSKTTRFILICNYVSRLIPPVVSRCAKFRFKSLPAE 180
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
121 IIILDEVDAMTREAQAAMRRVIEDFSKTTRFILICNYVSRLIPPVVSRCAKFRFKSLPAE 180

181 IQVQRLRTICDAEGTPMSDDELKQVMEYSEGDLRRAVCTLQSLAPILKSGDDNARNCYLR 240
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
181 IQVQRLRTICDAEGTPMSDDELKQVMEYSEGDLRRAVCTLQSLAPILKSGDDNARNCYLR 240

241 GSSDSLLISNVCKSILTADVPQIIALTKDITKSCTGVAFIRRCFQQLMDEDVINDENIGV 300
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
241 GSSDSLLISNVCKSILTADVPQIIALTKDITKSCTGVAFIRRCFQQLMDEDVINDENIGV 300

301 MGKLVATCEKRILDGCDLENNLLDFLLTLRETIQ 334
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||
301 MGKLVATCEKRILDGCDLENNLLDFLLTLRETIQ 334