Affine Alignment
 
Alignment between hil-3 (top F22F1.1 208aa) and his-24 (bottom M163.3 208aa) score 11590

001 MSDTVVASAAVQAPAKTVKSPKAAKTTKVPKAKKPVAHPPYINMVTAAINGLKERKGSSK 060
    |||+ | +|||+      |+ |||| ||| ||| ||||||||||+  ||  ||+|||+||
001 MSDSAVVAAAVEPKVPKAKAAKAAKPTKVAKAKAPVAHPPYINMIKEAIKQLKDRKGASK 060

061 IAILKYITKNYNVGDQIIKINARLRDTLNKGVVSKALVQSVGTGASGRFRVTEKKAAAAK 120
     ||||+|++|| +|| +|+||| ||  | +|| ||||||+ |+||+||||| || ||| |
061 QAILKFISQNYKLGDNVIQINAHLRQALKRGVTSKALVQAAGSGANGRFRVPEKAAAAKK 120

121 KPVAKKAATGEKKAKKPVAQKAATGEKKAKKTTATKTKKTA---DKVKKVKSPKKIAKPT 177
       ||| |     |||| | | |||||||||  | | || |    |||| |||||+||| 
121 PAAAKKPAA----AKKPAAAKKATGEKKAKKPAAAKPKKAATGDKKVKKAKSPKKVAKPA 176

178 AKKVAKSPAKKSAPKKAA------AAKPAKKA 203
    |||||||||||+|||| |      ||||| ||
177 AKKVAKSPAKKAAPKKIAKPAAKKAAKPAAKA 208