Affine Alignment
 
Alignment between set-5 (top C47E8.8 1675aa) and set-5 (bottom C47E8.8 1675aa) score 162317

0001 MRERERVNSCRRDGELKDTRQAATREWEGMTVGDAAVDEGKEEDNITQRVPSPGWQKDLA 0060
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0001 MRERERVNSCRRDGELKDTRQAATREWEGMTVGDAAVDEGKEEDNITQRVPSPGWQKDLA 0060

0061 EEGGGRCQEAASEGTLDMRERDEVHITPKFRIILLKKTNTNSTNVRRNDRIIMNPKNKSS 0120
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0061 EEGGGRCQEAASEGTLDMRERDEVHITPKFRIILLKKTNTNSTNVRRNDRIIMNPKNKSS 0120

0121 TIISKNVEELLPTLFPITEVRSFGKKCRSIEISKSYLINRALVSNLDIEPDEPIVRIRGL 0180
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0121 TIISKNVEELLPTLFPITEVRSFGKKCRSIEISKSYLINRALVSNLDIEPDEPIVRIRGL 0180

0181 LAFHHELQEDSRNVNFLFTYGCVCLDARGTGNNPGRFVRRSCFPNSYLSYERNNTEFHII 0240
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0181 LAFHHELQEDSRNVNFLFTYGCVCLDARGTGNNPGRFVRRSCFPNSYLSYERNNTEFHII 0240

0241 IKARDFIPYGHEITIDFNDDFFPLNCSLKCTVHLEDSENCRREWKRKYIQNDGYWKPPEL 0300
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0241 IKARDFIPYGHEITIDFNDDFFPLNCSLKCTVHLEDSENCRREWKRKYIQNDGYWKPPEL 0300

0301 SISASSSSTSQIDPEPSKTPFNEEQEKLLKSIINQSKIIPMMPRHTKHLCHVFKQEFGSE 0360
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0301 SISASSSSTSQIDPEPSKTPFNEEQEKLLKSIINQSKIIPMMPRHTKHLCHVFKQEFGSE 0360

0361 KTVEEIDDDLGKLISDFTSRVMKSNIVLNDDRLMNAITLRNVLYVTSVSVEENVLEWLHD 0420
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0361 KTVEEIDDDLGKLISDFTSRVMKSNIVLNDDRLMNAITLRNVLYVTSVSVEENVLEWLHD 0420

0421 AGVNVFLNKNRQLFLMKYSKTDKSPLNVHSLDRKTKDYELYLKEQMTKLLAGMPDESGRE 0480
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0421 AGVNVFLNKNRQLFLMKYSKTDKSPLNVHSLDRKTKDYELYLKEQMTKLLAGMPDESGRE 0480

0481 TSQAANEVEVQAAMENVEEGEIVPESGNRVFSPLPPPPPPPLEMSRESSPISSVSGKSIK 0540
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0481 TSQAANEVEVQAAMENVEEGEIVPESGNRVFSPLPPPPPPPLEMSRESSPISSVSGKSIK 0540

0541 LLTLQLKETMHKKNSFFHSSYVKKEETGIINGESIQVTKKAESSQFSDSSPILLVNPHVH 0600
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0541 LLTLQLKETMHKKNSFFHSSYVKKEETGIINGESIQVTKKAESSQFSDSSPILLVNPHVH 0600

0601 TEAPEPTPKEHMERKWSTTHSGSMGELQRPVTSQSSRKSSRWDVTEEDLKRKLSATSSTH 0660
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0601 TEAPEPTPKEHMERKWSTTHSGSMGELQRPVTSQSSRKSSRWDVTEEDLKRKLSATSSTH 0660

0661 NPRERASVELETRQSEEIQKLQRLVNVIKPRDDSLEGTSNLDAANREIPIEASSTAPLLS 0720
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0661 NPRERASVELETRQSEEIQKLQRLVNVIKPRDDSLEGTSNLDAANREIPIEASSTAPLLS 0720

0721 RSFQFWRERSKSPDDSAQNHSDLHGTSLKSRPDAQKNPIPQAVAKTMLKFPVSTLDRPVN 0780
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0721 RSFQFWRERSKSPDDSAQNHSDLHGTSLKSRPDAQKNPIPQAVAKTMLKFPVSTLDRPVN 0780

0781 TKKSMAFGQEAQIMPKSSVFVNNAVKIPQKFVIVKEASSDNPNAAENPVSTQNTVDLHDI 0840
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0781 TKKSMAFGQEAQIMPKSSVFVNNAVKIPQKFVIVKEASSDNPNAAENPVSTQNTVDLHDI 0840

0841 PSKTPQQKVTSENRGSGAPNSSEDQQKLDEIAPTTQILPEDPVSVQSRSDVCEVTAETSQ 0900
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0841 PSKTPQQKVTSENRGSGAPNSSEDQQKLDEIAPTTQILPEDPVSVQSRSDVCEVTAETSQ 0900

0901 KSVGPERIGGDAQSSSENTVSVRNRVDLHGIPSKTPQKLVQSGKSAQSSTENQQQIEMTP 0960
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0901 KSVGPERIGGDAQSSSENTVSVRNRVDLHGIPSKTPQKLVQSGKSAQSSTENQQQIEMTP 0960

0961 EARILSKNPISAQSKTPVKEERPESHSLSESFASTQHPMKISEISENSTQNRSDSSRIGL 1020
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0961 EARILSKNPISAQSKTPVKEERPESHSLSESFASTQHPMKISEISENSTQNRSDSSRIGL 1020

1021 RSVKLEQIPSRTIKVEEPTDFPSNSEPEAQIPLETRTLEPSEASSVQPEPPIDQEEAEND 1080
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1021 RSVKLEQIPSRTIKVEEPTDFPSNSEPEAQIPLETRTLEPSEASSVQPEPPIDQEEAEND 1080

1081 ENPEILTPNSPTIDQDEAQNSDAPDASADSDLPKLEPELERMIDFLVEITEKISVPAIKT 1140
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1081 ENPEILTPNSPTIDQDEAQNSDAPDASADSDLPKLEPELERMIDFLVEITEKISVPAIKT 1140

1141 DIWKLYQARMKQNVKEECIRQRFMSKLAPIIHRLDNYSIEARVRIIFVLSVKVDADFLKE 1200
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1141 DIWKLYQARMKQNVKEECIRQRFMSKLAPIIHRLDNYSIEARVRIIFVLSVKVDADFLKE 1200

1201 LRKNAVVRVDDEQLITKYVSCNDGGLKLEGNHSMSDRLKNRKRSLDLIKDVDCEKKEAEH 1260
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1201 LRKNAVVRVDDEQLITKYVSCNDGGLKLEGNHSMSDRLKNRKRSLDLIKDVDCEKKEAEH 1260

1261 DVKKTKKSTSGSENDTDAEETDFHSITERQPKVVENSENRKRASSAKRRLVTSSSEESDQ 1320
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1261 DVKKTKKSTSGSENDTDAEETDFHSITERQPKVVENSENRKRASSAKRRLVTSSSEESDQ 1320

1321 DDRSSRSKTEKQRKIAANEKRLVRSSTASRVRILSDSSDESNREEGPSCSNSKKLTKISG 1380
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1321 DDRSSRSKTEKQRKIAANEKRLVRSSTASRVRILSDSSDESNREEGPSCSNSKKLTKISG 1380

1381 NKKNPAILRKRLLGDSSDKSDKDERTSCPSSKKRPKLAENKKKFVASQPKRCLSGSNVKS 1440
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1381 NKKNPAILRKRLLGDSSDKSDKDERTSCPSSKKRPKLAENKKKFVASQPKRCLSGSNVKS 1440

1441 DKNEKAGCSGTKKQEKVVKNKKKPPTPKANENTTTSDHSRIETDDIQFEGVYPIEPCAPV 1500
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1441 DKNEKAGCSGTKKQEKVVKNKKKPPTPKANENTTTSDHSRIETDDIQFEGVYPIEPCAPV 1500

1501 SSGMPILSVKTEPRSTEHLSFSYENVAYTQAEFSSTTYACPEPTETISLHDFLTLLRRLL 1560
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1501 SSGMPILSVKTEPRSTEHLSFSYENVAYTQAEFSSTTYACPEPTETISLHDFLTLLRRLL 1560

1561 ILLQCEELAELARNIKTISETGGDEKIPTNRINSVLDVAFYKIQRKFVVTSSPNSTSARE 1620
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1561 ILLQCEELAELARNIKTISETGGDEKIPTNRINSVLDVAFYKIQRKFVVTSSPNSTSARE 1620

1621 FLKLFKNLLNLLESRAVDMLLGQVSGKLSELEHVDMNLSIAYIEECVRAILSIFS 1675
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1621 FLKLFKNLLNLLESRAVDMLLGQVSGKLSELEHVDMNLSIAYIEECVRAILSIFS 1675