Affine Alignment
 
Alignment between haf-1 (top C30H6.6 677aa) and haf-1 (bottom C30H6.6 677aa) score 64619

001 MHCLCVLRSTLCCQMPTSTYRMLLQTKAVPVQIIKRDLTAKVKNQKLNQNIRRVDRRNAA 060
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
001 MHCLCVLRSTLCCQMPTSTYRMLLQTKAVPVQIIKRDLTAKVKNQKLNQNIRRVDRRNAA 060

061 YLLRHTTWKDLVELYEIAKPFRKWIFLGTSFMVVSSGIFLIIPRILGKLIDQFDSNTGVQ 120
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
061 YLLRHTTWKDLVELYEIAKPFRKWIFLGTSFMVVSSGIFLIIPRILGKLIDQFDSNTGVQ 120

121 KAEEVFTMKIAKYFKEQPMSLVGLLAIGALATAAKVYCLQIAGVNIVGSLRKMVYSSIIR 180
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
121 KAEEVFTMKIAKYFKEQPMSLVGLLAIGALATAAKVYCLQIAGVNIVGSLRKMVYSSIIR 180

181 QDMTFFDKNMVGEIGSRHAADTVIVGYSVSSSLRAGVRAVLVGVGSIGMMLMTSLELSTV 240
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
181 QDMTFFDKNMVGEIGSRHAADTVIVGYSVSSSLRAGVRAVLVGVGSIGMMLMTSLELSTV 240

241 SFLTAPIVMGIFKMFGRVQQQCTWQLQEVAADVNQTAIERMANMKTIRMLSAEQQSIDEY 300
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
241 SFLTAPIVMGIFKMFGRVQQQCTWQLQEVAADVNQTAIERMANMKTIRMLSAEQQSIDEY 300

301 CKKGELVLDISKTEALAKGSLIGSFQFTGYSAFSSILFYGSHLINTGHITYGELSSFCLY 360
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
301 CKKGELVLDISKTEALAKGSLIGSFQFTGYSAFSSILFYGSHLINTGHITYGELSSFCLY 360

361 AVLAAASLSNISGFYNEVMKGLGASSRLLELKNAQPIMNLNSGIKKTDITTSIQFENVSF 420
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
361 AVLAAASLSNISGFYNEVMKGLGASSRLLELKNAQPIMNLNSGIKKTDITTSIQFENVSF 420

421 AYAGRKKTLENISFDIPRGKITAVIGPSGSGKSSIANLMLRLYDPADGRVTVDGVDLRDL 480
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
421 AYAGRKKTLENISFDIPRGKITAVIGPSGSGKSSIANLMLRLYDPADGRVTVDGVDLRDL 480

481 NATTWRHAIGTVGQEPVLFTCSIRENILMGTEHPEKVSQYELEEAAQLANALDFIQGFEN 540
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
481 NATTWRHAIGTVGQEPVLFTCSIRENILMGTEHPEKVSQYELEEAAQLANALDFIQGFEN 540

541 GFETMVGEHGCKLSGGQKQRIAIARALISKPKIMILDEATSALDATSDYLIRMTLDNLLK 600
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
541 GFETMVGEHGCKLSGGQKQRIAIARALISKPKIMILDEATSALDATSDYLIRMTLDNLLK 600

601 NHNLTVLVIAHRLATMQQADQVVYVNRGRIEGQGTFDEMMKIQNSIVEQEARRRGIPMNE 660
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
601 NHNLTVLVIAHRLATMQQADQVVYVNRGRIEGQGTFDEMMKIQNSIVEQEARRRGIPMNE 660

661 QMSRVNTPVARGFSLKF 677
    |||||||||||||||||
661 QMSRVNTPVARGFSLKF 677