Affine Alignment
  
Alignment between nex-3 (top C28A5.3 317aa) and nex-3 (bottom C28A5.3 317aa) score 30324

001 MATAKIHFKPYFDEVAASEQLEKALRNKEKLKILEILVSVNNTQRQMIRTPYKTRYGKDL 060
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
001 MATAKIHFKPYFDEVAASEQLEKALRNKEKLKILEILVSVNNTQRQMIRTPYKTRYGKDL 060

061 EDEIKKAFSGDFEDFLVALLQTPTKLDVTELNRSVKGLGTNEKNLIEILTTRTNEEIEAA 120
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
061 EDEIKKAFSGDFEDFLVALLQTPTKLDVTELNRSVKGLGTNEKNLIEILTTRTNEEIEAA 120

121 KNTYFMTYSKSLEDAISADTSGDFRRLLIVILQAKREEGGFADTFKVGPHAAQILKSFDK 180
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
121 KNTYFMTYSKSLEDAISADTSGDFRRLLIVILQAKREEGGFADTFKVGPHAAQILKSFDK 180

181 KSGVEKFDAFKIFATCNGAHIQKVIEEVERQSGKEFQKLIDKELSGDFKNLVLSLIETSR 240
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
181 KSGVEKFDAFKIFATCNGAHIQKVIEEVERQSGKEFQKLIDKELSGDFKNLVLSLIETSR 240

241 NKPRYFANSIHLATKGMGTRDKDLIRILVSRSENDLVIIEHEFQTLFGKPLTQLIKEECK 300
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
241 NKPRYFANSIHLATKGMGTRDKDLIRILVSRSENDLVIIEHEFQTLFGKPLTQLIKEECK 300

301 AEYRDGLTMLVKGNPRP 317
    |||||||||||||||||
301 AEYRDGLTMLVKGNPRP 317