Affine Alignment
 
Alignment between cup-4 (top C02C2.3 433aa) and cup-4 (bottom C02C2.3 433aa) score 43111

001 MKIIIFVCFILIFYLPIQKKHVNSQQQGIDSDDGDAESFFNKSYSEHQSALEQKIFRGYN 060
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
001 MKIIIFVCFILIFYLPIQKKHVNSQQQGIDSDDGDAESFFNKSYSEHQSALEQKIFRGYN 060

061 PKNRPMKNASFPTIVDVHWHIIHVSINQREQTMTVHGHIYMRWFDEFLVWDPKDFNNIQY 120
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
061 PKNRPMKNASFPTIVDVHWHIIHVSINQREQTMTVHGHIYMRWFDEFLVWDPKDFNNIQY 120

121 ARVKKWQVWQPKIKVSNSASGLGSAFDFSTSAHVIIQMMGKDRAKVEMYPTFSIKVGCAF 180
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
121 ARVKKWQVWQPKIKVSNSASGLGSAFDFSTSAHVIIQMMGKDRAKVEMYPTFSIKVGCAF 180

181 DFTDYPYDLNKCAINLFSTSTMADVQLQNLYAIPPTLSFGWEEQKMKRIISDFKIQNVSS 240
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
181 DFTDYPYDLNKCAINLFSTSTMADVQLQNLYAIPPTLSFGWEEQKMKRIISDFKIQNVSS 240

241 SALYYTNGNITSSAPITGFDLGSTWSMLAVTVSFVRHSPLFEAAVVTPCIVVASLISMTF 300
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
241 SALYYTNGNITSSAPITGFDLGSTWSMLAVTVSFVRHSPLFEAAVVTPCIVVASLISMTF 300

301 FIDSLSSTFLLMMLHFYVQLIFLHDLVEKLPLSVSEIPFCIKLIGILMYTNGLTLVLHSS 360
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
301 FIDSLSSTFLLMMLHFYVQLIFLHDLVEKLPLSVSEIPFCIKLIGILMYTNGLTLVLHSS 360

361 LLCGSYYKCPVPQQLNKIFVIEEYIPNTFKEKVQIKKEESNKSWRDLMKLIRPIIGFVLI 420
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
361 LLCGSYYKCPVPQQLNKIFVIEEYIPNTFKEKVQIKKEESNKSWRDLMKLIRPIIGFVLI 420

421 ILLICMFFVCLLL 433
    |||||||||||||
421 ILLICMFFVCLLL 433