UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1K11E4.1K11E4.10chrX 13,715,160contains similarity to Pfam domain PF01764 (Lipase (class 3))
2nhr-79T26H2.9n/achrV 19,209,750C. elegans NHR-79 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR001723 (Steroid hormone receptor), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
3C33C12.7C33C12.7n/achrII 2,174,952
4ZK899.1ZK899.1n/achrX 9,447,071
5F59B10.6F59B10.6n/achrII 10,523,795contains similarity to Prochlorococcus marinus Possible paralytic/GBP/PSP peptide precursor.; TR:Q7TUU1
6src-2F49B2.5n/achrI 14,325,568C. elegans SRC-2 protein; contains similarity to Pfam domains PF07653 (Variant SH3 domain) , PF07714 (Protein tyrosine kinase) , PF00069 (Protein kinase domain) , PF00018 (SH3 domain) , PF00017 (SH2 domain) contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR001452 (Src homology-3), IPR000108 (Neutrophil cytosol factor 2), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR013315 (Spectrin alpha chain), IPR011511 (Variant SH3), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related), IPR000980 (SH2 motif), IPR008266 (Tyrosine protein kinase, active site)
7F25F8.1F25F8.1n/achrI 4,890,200contains similarity to Interpro domain IPR011042 (Six-bladed beta-propeller, TolB-like)
8snt-2F42G9.7n/achrIII 789,889C. elegans SNT-2 protein; contains similarity to Pfam domain PF00168 C2 domain contains similarity to Interpro domains IPR001565 (Synaptotagmin), IPR008973 (C2 calcium/lipid-binding region, CaLB), IPR000008 (C2 calcium-dependent membrane targeting)
9F35C11.6F35C11.6n/achrII 8,258,607contains similarity to Homo sapiens Oxysterol binding protein-related protein 11; ENSEMBL:ENSP00000296220
10Y81G3A.3Y81G3A.3n/achrII 13,087,735contains similarity to Pfam domains PF05773 (RWD domain) , PF00069 (Protein kinase domain) contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR008271 (Serine/threonine protein kinase, active site), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR006575 (RWD), IPR016135 (Ubiquitin-conjugating enzyme/RWD-like), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
11K09C4.4K09C4.4n/achrX 3,290,202contains similarity to Pfam domain PF00083 Sugar (and other) transporter contains similarity to Interpro domains IPR005828 (General substrate transporter), IPR016196 (MFS general substrate transporter)
12srab-10C36C5.7n/achrV 3,143,828C. elegans SRAB-10 protein; contains similarity to Pfam domain PF02117 C.elegans Sra family integral membrane protein contains similarity to Interpro domain IPR000344 (Nematode chemoreceptor, Sra)
13egl-23Y37A1B.11n/achrIV 14,007,827egl-23 encodes one of 44 C. elegans TWK (two-P domain K+) potassium channel subunits that contain two pore-forming domains and four transmembrane domains; egl-23 was originally defined by gain-of-function mutations that result in defects in locomotion, egg-laying, and enteric muscle activation; loss of egl-23 function via reversion or RNA-mediated interference (RNAi) does not result in any abnormalities suggesting that EGL-23 may function redundantly with other TWK channels; egl-23 does not, however, interact genetically with the UNC-93 group of TWKs encoded by unc-93, sup-9, and sup-10; the EGL-23 expression pattern is not yet known.
14F40A3.7F40A3.7n/achrV 7,897,725contains similarity to Pfam domain PF00001 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
15F25H2.2F25H2.2n/achrI 10,544,713contains similarity to Pfam domains PF00595 (PDZ domain (Also known as DHR or GLGF)) , PF00787 (PX domain) contains similarity to Interpro domains IPR002048 (Calcium-binding EF-hand), IPR001683 (Phox-like), IPR001478 (PDZ/DHR/GLGF)
16bath-26T07H3.6n/achrII 1,600,097C. elegans BATH-26 protein; contains similarity to Pfam domains PF00651 (BTB/POZ domain) , PF00917 (MATH domain) contains similarity to Interpro domains IPR002083 (MATH), IPR000210 (BTB/POZ-like), IPR011333 (BTB/POZ fold), IPR013069 (BTB/POZ)
17haf-1C30H6.6n/achrIV 17,377,825haf-1 encodes a predicted transmembrane protein of the ATP-binding cassette (ABC) transporter superfamily; by homology, HAF-1 is proposed to function in ATP-dependent transport of molecules across plasma and intracellular membranes; however, as loss of HAF-1 function via RNA-mediated interference (RNAi) does not result in any abnormalities, the precise role of HAF-1 in C. elegans development and/or behavior is not yet known.
18R05C11.1R05C11.1n/achrIV 2,070,210contains similarity to Interpro domain IPR014756 (Immunoglobulin E-set)
19F56F10.3F56F10.3n/achrX 863,092F56F10.3 encodes the C. elegans cysteine dioxygenase ortholog; by homology to mammalian enzymes, the product of F56F10.3 is predicted to function in cysteine catabolism by catalyzing the oxidation of cysteine to cysteine sulfanate.
20clec-192Y116A8A.1n/achrIV 16,803,039C. elegans CLEC-192 protein; contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
21R07C12.3R07C12.3n/achrIV 4,145,897
22C04E12.6C04E12.6n/achrV 3,355,089contains similarity to Pfam domain PF06162 Caenorhabditis elegans protein of unknown function (DUF976) contains similarity to Interpro domains IPR010381 (Protein of unknown function DUF976, Caenorhabditis species), IPR016125 (Peptidase C15, pyroglutamyl peptidase I-like)
23C34E7.3C34E7.3n/achrX 12,931,101contains similarity to Plasmodium falciparum Ribonuclease, putative.; TR:Q8ICL5
24twk-14K01D12.4n/achrV 12,388,845C. elegans TWK-14 protein; contains similarity to Pfam domain PF07885 Ion channel contains similarity to Interpro domains IPR003280 (Potassium channel, two pore-domain), IPR005410 (Potassium channel, two pore-domain, THIK), IPR013099 (Ion transport 2), IPR003092 (Potassium channel, two pore-domain, TASK)
25srt-8C50H11.2n/achrV 3,087,272C. elegans SRT-8 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
26lact-3M28.6n/achrII 10,654,998lact-3 encodes a beta-lactamase domain-containing protein that contains a predicted signal sequence; loss of lact-3 activity via RNAi has been reported to result in reduced fat content.
27T15B7.10T15B7.10n/achrV 6,811,130contains similarity to Ostreococcus tauri Predicted CDS, putative cytoplasmic protein family member, with ascoiled coil-4 domain, of ancient origin (ISS).; TR:Q010X5
28F37C4.2F37C4.2n/achrIV 3,887,244contains similarity to Pfam domain PF01757 Acyltransferase family contains similarity to Interpro domain IPR002656 (Acyltransferase 3)
29Y51A2A.6Y51A2A.6n/achrV 18,303,075contains similarity to Interpro domain IPR016187 (C-type lectin fold)
30tag-117C01B7.4n/achrV 8,794,107C. elegans TAG-117 protein; contains similarity to Pfam domains PF00018 (SH3 domain) , PF00625 (Guanylate kinase) , PF07653 (Variant SH3 domain) , PF00595 (PDZ domain (Also known as DHR or GLGF)) contains similarity to Interpro domains IPR011511 (Variant SH3), IPR008144 (Guanylate kinase), IPR008145 (Guanylate kinase/L-type calcium channel region), IPR001478 (PDZ/DHR/GLGF), IPR001452 (Src homology-3)
31str-15T08G3.1n/achrV 16,458,013C. elegans STR-15 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
32F23A7.3F23A7.3n/achrX 16,221,101contains similarity to Schizosaccharomyces pombe Endocytosis protein end4 (SLA2 protein homolog).; SW:Q9P6L5
33C34E11.2C34E11.2n/achrX 11,808,336contains similarity to Pfam domain PF03166 MH2 domain contains similarity to Interpro domains IPR008984 (SMAD/FHA domain), IPR000694 (Proline-rich region), IPR001132 (SMAD domain, Dwarfin-type), IPR017855 (SMAD domain-like)
34ocr-2T09A12.3n/achrIV 8,216,912ocr-2 encodes a TRPV (transient receptor potential channel, vanilloid subfamily) ion channel; OCR-2 activity is required for several types of sensory transduction including olfaction, osmosensation, mechanosensation, and chemosensation; an OCR-2 fusion protein is expressed in sensory cilia and requires the OSM-9 TRPV channel protein for proper localization; likewise, OSM-9 requires OCR-2 for its cilial localization.
35M57.1M57.1n/achrIV 3,536,339contains similarity to Pfam domain PF04435 Domain of unknown function (DUF545) contains similarity to Interpro domain IPR006570 (SPK)
36W04H10.1W04H10.1n/achrII 609,207
37srb-5C27D6.6n/achrII 5,162,671C. elegans SRB-5 protein; contains similarity to Pfam domain PF02175 C.elegans integral membrane protein Srb contains similarity to Interpro domain IPR002184 (Serpentine beta receptor)
38T10D4.3T10D4.3n/achrII 3,130,228contains similarity to Pfam domain PF00704 Glycosyl hydrolases family 18 contains similarity to Interpro domains IPR011583 (Chitinase II), IPR017853 (Glycoside hydrolase, catalytic core), IPR001223 (Glycoside hydrolase, family 18, catalytic domain), IPR013781 (Glycoside hydrolase, subgroup, catalytic core)
39R03G8.1R03G8.1n/achrX 13,086,031contains similarity to Pfam domain PF02995 Protein of unknown function (DUF229) contains similarity to Interpro domains IPR004245 (Protein of unknown function DUF229), IPR017850 (Alkaline-phosphatase-like, core domain)
40ZK688.7ZK688.7n/achrIII 7,911,165
41F15D4.3F15D4.3n/achrII 13,237,564contains similarity to Homo sapiens Protein MGR2 homolog; ENSEMBL:ENSP00000338293
42C05D11.5C05D11.5n/achrIII 6,410,742contains similarity to Pfam domain PF01261 Xylose isomerase-like TIM barrel contains similarity to Interpro domains IPR013279 (Apoptosis regulator, Bcl-X), IPR012307 (Xylose isomerase-type TIM barrel), IPR013022 (Xylose isomerase-like, TIM barrel)
43srt-67B0238.5n/achrV 5,256,766C. elegans SRT-67 protein; contains similarity to Pfam domains PF01461 (7TM chemoreceptor) , PF01748 (Caenorhabditis serpentine receptor-like protein) contains similarity to Interpro domains IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1), IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
44ttr-46T07C12.7n/achrV 9,951,666C. elegans TTR-46 protein; contains similarity to Pfam domain PF01060 Transthyretin-like family contains similarity to Interpro domain IPR001534 (Transthyretin-like)
45shw-3R186.5n/achrV 12,974,845C. elegans SHW-3 protein; contains similarity to Pfam domains PF02214 (K+ channel tetramerisation domain) , PF07885 (Ion channel) , PF00520 (Ion transport protein) contains similarity to Interpro domains IPR005821 (Ion transport), IPR000210 (BTB/POZ-like), IPR011333 (BTB/POZ fold), IPR003973 (Potassium channel, voltage dependent, Kv2), IPR003970 (Potassium channel, voltage dependent, Kv8), IPR003971 (Potassium channel, voltage dependent, Kv9), IPR003968 (Potassium channel, voltage dependent, Kv), IPR003131 (Potassium channel, voltage dependent, Kv, tetramerisation), IPR003969 (Potassium channel, voltage dependent, Kv6), IPR003091 (Voltage-dependent potassium channel), IPR013099 (Ion transport 2), IPR003974 (Potassium channel, voltage dependent, Kv3)
46nhr-197K06B4.7n/achrV 15,688,881C. elegans NHR-197 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
47F12A10.6F12A10.6n/achrII 5,494,268
48Y26G10.1Y26G10.1n/achrV 17,694,131contains similarity to Pfam domains PF00008 (EGF-like domain) , PF07974 (EGF-like domain) (3)contains similarity to Interpro domains IPR014756 (Immunoglobulin E-set), IPR001774 (Delta/Serrate/lag-2 (DSL) protein), IPR000742 (EGF-like, type 3), IPR015919 (Cadherin-like), IPR011050 (Pectin lyase fold/virulence factor), IPR006209 (EGF-like), IPR006210 (EGF), IPR002049 (EGF-like, laminin), IPR006626 (Parallel beta-helix repeat), IPR013032 (EGF-like region, conserved site), IPR002126 (Cadherin), IPR013111 (EGF, extracellular)
49T13C2.2T13C2.2n/achrII 6,795,686
50ZK938.6ZK938.6n/achrII 9,844,266contains similarity to Pfam domain PF00704 Glycosyl hydrolases family 18 contains similarity to Interpro domains IPR011583 (Chitinase II), IPR017853 (Glycoside hydrolase, catalytic core), IPR001223 (Glycoside hydrolase, family 18, catalytic domain), IPR013781 (Glycoside hydrolase, subgroup, catalytic core)