UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1K04E7.1K04E7.17e-102chrX 6,462,585
2F19D8.2F19D8.2n/achrX 13,835,397contains similarity to Homo sapiens Splice isoform 1 of Q9UMN6 Myeloid/lymphoid or mixed-lineage leukemia protein 4; ENSEMBL:ENSP00000222270
3srj-7T28A11.10n/achrV 3,245,861C. elegans SRJ-7 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
4C34D4.10C34D4.10n/achrIV 7,120,692
5nhr-33ZK455.6n/achrX 11,319,573C. elegans NHR-33 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
6C28A5.5C28A5.5n/achrIII 4,451,510contains similarity to Petunia hybrida PGPS/D8.; TR:Q9ZTN1
7K07D4.2K07D4.2n/achrII 4,045,127
8K03D7.9K03D7.9n/achrV 17,488,056contains similarity to Homo sapiens Olfactory receptor 1A1; ENSEMBL:ENSP00000305207
9C30H6.9C30H6.9n/achrIV 17,379,717contains similarity to Bacillus anthracis Hypothetical protein.; TR:Q81PV8
10sri-37D2062.2n/achrII 2,630,401C. elegans SRI-37 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
11ZK380.4ZK380.4n/achrX 1,652,654
12nhr-230Y17D7A.1n/achrV 18,849,704C. elegans NHR-230 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
13clec-247Y51A2A.1n/achrV 18,285,606C. elegans CLEC-247 protein; contains similarity to Pfam domain PF01757 Acyltransferase family contains similarity to Interpro domains IPR002656 (Acyltransferase 3), IPR006621 (Nose resistant to fluoxetine-4, N-terminal)
14F21C10.6F21C10.6n/achrV 9,124,712contains similarity to Pfam domain PF01705 CX module contains similarity to Interpro domain IPR002619 (Protein of unknown function CX)
15B0348.1B0348.1n/achrV 49,270contains similarity to Interpro domain IPR006629 (LPS-induced tumor necrosis factor alpha factor)
16pop-1W10C8.2n/achrI 2,826,881pop-1 encodes an HMG box-containing protein that is the sole C. elegans member of the TCF/LEF family of transcription factors; in C. elegans, POP-1 functions as a component of the canonical and noncanonical Wnt signaling pathways that are required for cell migrations and binary cell fate decisions associated with asymmetric cell division, respectively; in yeast two-hybrid assays, the POP-1 N-terminal beta-catenin binding domain interacts with BAR-1/beta-catenin as well as with the more divergent beta-catenin, SYS-1; when coexpressed with SYS-1, POP-1 is able to activate transcription from a promoter with TCF binding sites; during development, maternally provided POP-1 is first detected in the nuclei of maturing oocytes and then in nearly all cells of the early embryo; in sister blastomeres in the early embryo, POP-1 is detected at lower levels in posterior blastomeres, such as E and P3, than in corresponding anterior blastomeres, MS and C; in later developmental stages, POP-1 is detected in a subset of tissues including hypodermal seam cells, gonadal precursors, and the developing vulva; in the vulva, POP-1 also exhibits an asymmetric staining pattern, with sister cells showing high or low levels of POP-1 depending upon their orientation along the anterior/posterior axis of the vulva.
17R04B5.7R04B5.7n/achrV 10,089,830contains similarity to Rattus norvegicus Protein tyrosine phosphatase TD14.; TR:O88902
18nas-21T11F9.5n/achrV 11,473,207nas-21 encodes an astacin-like metalloprotease.
19T17A3.9T17A3.9n/achrIII 152,890
20C07B5.6C07B5.6n/achrX 9,520,189contains similarity to Helicobacter pylori Hypothetical protein HP1327.; TR:O25885
21sri-6T09E8.5n/achrV 13,186,537C. elegans SRI-6 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
22F40E3.6F40E3.6n/achrI 2,651,225
23dbl-1T25F10.2n/achrV 6,759,095dbl-1 encodes a member of the transforming growth factor beta (TGFbeta) superfamily that includes Drosophila decapentaplegic (Dpp) and the vertebrate bone morphogenetic proteins (BMPs); DBL-1 functions as a dose-dependent ligand for the SMA-6 and DAF-4 TGFbeta receptors that ultimately activate the SMA-2, -3, and -4 complex of transcription factors to regulate body length and size, as well as the patterning of male sensory rays and copulatory spicules; DBL-1 signaling upregulates sma-6 expression, suggesting that there is positive autoregulation in the DBL-1 signaling pathway; in contrast, DBL-1 negatively regulates expression of LON-1, a predicted secreted protein that is a downstream component of the body size pathway; DBL-1 is expressed primarily in neurons.
24R05D7.1R05D7.1n/achrI 12,162,955contains similarity to Kluyveromyces lodderae Truncated cytochrome oxidase subunit 2 (Fragment).; TR:Q7YG01
25T11F9.13T11F9.13n/achrV 11,482,664contains similarity to Thermotoga maritima ATP-dependent CLP protease, ATPase subunit.; TR:Q9WY41
26F21G4.4F21G4.4n/achrX 9,898,328contains similarity to Pfam domain PF00628 PHD-finger contains similarity to Interpro domains IPR001965 (Zinc finger, PHD-type), IPR013083 (Zinc finger, RING/FYVE/PHD-type), IPR011011 (Zinc finger, FYVE/PHD-type)
27srx-22F31F4.3n/achrV 680,688C. elegans SRX-22 protein ;
28srd-17Y2H9A.2n/achrV 13,431,663C. elegans SRD-17 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
29srxa-9ZK678.4n/achrX 15,749,493C. elegans SRXA-9 protein; contains similarity to Pfam domain PF03383 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein, class xa contains similarity to Interpro domain IPR005047 (Protein of unknown function DUF286, G protein-coupled receptor-like putative Caenorhabditis species)
30sdz-34Y73C8C.7n/achrV 3,108,727C. elegans SDZ-34 protein; contains similarity to Pfam domain PF00097 Zinc finger, C3HC4 type (RING finger) contains similarity to Interpro domains IPR001841 (Zinc finger, RING-type), IPR001965 (Zinc finger, PHD-type), IPR013083 (Zinc finger, RING/FYVE/PHD-type), IPR000533 (Tropomyosin), IPR011016 (Zinc finger, variant RING-type)
31srx-133F09F3.4n/achrV 13,849,303C. elegans SRX-133 protein ;
32ceh-14F46C8.5n/achrX 7,530,621ceh-14 encodes a LIM homeodomain protein orthologous to Drosophila Lim3 and the vertebrate Lhx3 and Lhx4 proteins; ceh-14 is required for specification of the AFD thermosensory neurons and for normal thermotactic behavior; a ceh-14::GFP reporter fusion is expressed in head and tail neurons, including the AFD thermosensory neurons, during late embryonic, larval, and adult stages. Animals triply mutant for the LIM homeobox genes ceh-14, lin-11, and ttx-3 which are required for function of the AFD, AIZ, and AIY neurons, respectively, exhibit a basic cryophilic thermotaxis response suggesting that, in C. elegans, there is more than one pathway for integration of thermosensory input.
33W03H9.3W03H9.3n/achrII 14,143,131contains similarity to Streptomyces avermitilis Putative oxidoreductase.; TR:Q82DU1
34srx-135F09F3.11n/achrV 13,860,290C. elegans SRX-135 protein ;
35srt-45M162.3n/achrV 19,780,434C. elegans SRT-45 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
36C14A11.6C14A11.6n/achrX 2,812,319
37tsp-7T23D8.2n/achrI 9,971,579C. elegans TSP-7 protein; contains similarity to Pfam domain PF00335 Tetraspanin family contains similarity to Interpro domains IPR000301 (CD9/CD37/CD63 antigen), IPR008952 (Tetraspanin)
38hap-1ZC395.7n/achrIII 5,264,428C. elegans HAP-1 protein; contains similarity to Pfam domain PF01725 Ham1 family contains similarity to Interpro domain IPR002637 (Ham1-like protein)
39Y38H8A.5Y38H8A.5n/achrIV 13,467,731The Y38H8A.5 gene encodes a homolog of the human gene ZNF195 (or p57KIP2), which when mutated leads to Beckwith-Wiedemann syndrome (OMIM:130650).
40F48C5.1F48C5.1n/achrX 11,445,448contains similarity to Pfam domain PF00047 Immunoglobulin domain contains similarity to Interpro domains IPR003598 (Immunoglobulin subtype 2), IPR000742 (EGF-like, type 3), IPR007110 (Immunoglobulin-like), IPR013032 (EGF-like region, conserved site), IPR013151 (Immunoglobulin)
41F45F2.7F45F2.7n/achrV 8,523,135contains similarity to Pfam domain PF03189 Protein of unknown function, DUF270 contains similarity to Interpro domains IPR003945 (NADH-plastoquinone oxidoreductase, chain 5), IPR004878 (Protein of unknown function DUF270), IPR016196 (MFS general substrate transporter)
42C44C10.5C44C10.5n/achrX 11,691,705contains similarity to Homo sapiens Structural maintenance of chromosomes protein 1A; ENSEMBL:ENSP00000323421
43srh-204E03D2.3n/achrV 4,239,757C. elegans SRH-204 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
44F36A4.11F36A4.11n/achrIV 4,245,281
45unc-40T19B4.7n/achrI 5,685,676The unc-40 gene encodes a netrin receptor that is required to guide dorsal-ventral cell and axon migrations, and is required for correct polarization and migration of the neuroblasts QL and QR.
46F39H12.2F39H12.2n/achrX 832,122contains similarity to Pfam domain PF00400 WD domain, G-beta repeat contains similarity to Interpro domains IPR011046 (WD40 repeat-like), IPR001680 (WD40 repeat), IPR015943 (WD40/YVTN repeat-like)
47lgc-7Y57G11C.2n/achrIV 14,712,127C. elegans LGC-7 protein; contains similarity to Pfam domains PF02931 (Neurotransmitter-gated ion-channel ligand binding domain) , PF02932 (Neurotransmitter-gated ion-channel transmembrane region) contains similarity to Interpro domains IPR006201 (Neurotransmitter-gated ion-channel), IPR006202 (Neurotransmitter-gated ion-channel ligand-binding), IPR006029 (Neurotransmitter-gated ion-channel transmembrane region)
48T09B4.2T09B4.2n/achrI 6,184,694
49srh-99C46E10.7n/achrII 3,715,771C. elegans SRH-99 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
50ifta-1C54G7.4n/achrX 5,549,123C. elegans IFTA-1 protein; contains similarity to Pfam domain PF00400 WD domain, G-beta repeat contains similarity to Interpro domains IPR011046 (WD40 repeat-like), IPR017233 (WD repeat protein 35), IPR001680 (WD40 repeat), IPR015943 (WD40/YVTN repeat-like), IPR011011 (Zinc finger, FYVE/PHD-type)