Affine Alignment
 
Alignment between KCNQ1 (top ENST00000155840.12_8 676aa) and KCNQ1 (bottom ENST00000155840.12_8 676aa) score 67032

001 MAAASSPPRAERKRWGWGRLPGARRGSAGLAKKCPFSLELAEGGPAGGALYAPIAPGAPG 060
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001 MAAASSPPRAERKRWGWGRLPGARRGSAGLAKKCPFSLELAEGGPAGGALYAPIAPGAPG 060

061 PAPPASPAAPAAPPVASDLGPRPPVSLDPRVSIYSTRRPVLARTHVQGRVYNFLERPTGW 120
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061 PAPPASPAAPAAPPVASDLGPRPPVSLDPRVSIYSTRRPVLARTHVQGRVYNFLERPTGW 120

121 KCFVYHFAVFLIVLVCLIFSVLSTIEQYAALATGTLFWMEIVLVVFFGTEYVVRLWSAGC 180
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121 KCFVYHFAVFLIVLVCLIFSVLSTIEQYAALATGTLFWMEIVLVVFFGTEYVVRLWSAGC 180

181 RSKYVGLWGRLRFARKPISIIDLIVVVASMVVLCVGSKGQVFATSAIRGIRFLQILRMLH 240
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181 RSKYVGLWGRLRFARKPISIIDLIVVVASMVVLCVGSKGQVFATSAIRGIRFLQILRMLH 240

241 VDRQGGTWRLLGSVVFIHRQELITTLYIGFLGLIFSSYFVYLAEKDAVNESGRVEFGSYA 300
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241 VDRQGGTWRLLGSVVFIHRQELITTLYIGFLGLIFSSYFVYLAEKDAVNESGRVEFGSYA 300

301 DALWWGVVTVTTIGYGDKVPQTWVGKTIASCFSVFAISFFALPAGILGSGFALKVQQKQR 360
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301 DALWWGVVTVTTIGYGDKVPQTWVGKTIASCFSVFAISFFALPAGILGSGFALKVQQKQR 360

361 QKHFNRQIPAAASLIQTAWRCYAAENPDSSTWKIYIRKAPRSHTLLSPSPKPKKSVVVKK 420
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361 QKHFNRQIPAAASLIQTAWRCYAAENPDSSTWKIYIRKAPRSHTLLSPSPKPKKSVVVKK 420

421 KKFKLDKDNGVTPGEKMLTVPHITCDPPEERRLDHFSVDGYDSSVRKSPTLLEVSMPHFM 480
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421 KKFKLDKDNGVTPGEKMLTVPHITCDPPEERRLDHFSVDGYDSSVRKSPTLLEVSMPHFM 480

481 RTNSFAEDLDLEGETLLTPITHISQLREHHRATIKVIRRMQYFVAKKKFQQARKPYDVRD 540
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481 RTNSFAEDLDLEGETLLTPITHISQLREHHRATIKVIRRMQYFVAKKKFQQARKPYDVRD 540

541 VIEQYSQGHLNLMVRIKELQRRLDQSIGKPSLFISVSEKSKDRGSNTIGARLNRVEDKVT 600
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601 QLDQRLALITDMLHQLLSLHGGSTPGSGGPPREGGAHITQPCGSGGSVDPELFLPSNTLP 660
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601 QLDQRLALITDMLHQLLSLHGGSTPGSGGPPREGGAHITQPCGSGGSVDPELFLPSNTLP 660

661 TYEQLTVPRRGPDEGS 676
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